Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
|
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 12:22) Насколько я понимаю, степень загрязнения ДНК фенолом проверяется по соотношению 260/230, больше 2.0 - нормально. А если, например, -822 - что это значит и чем это грозит? Подскажите пожалуйста кто в курсе! Заранее спасибо! МИНУС822 а не ТИРЕ -поясните |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
|
Mykhaylo Постоянный участник Україна |
|
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
|
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 13:55) Хорошо бы... там нет кювет, это нанодроп, концентрация и 260/280 в норме, а вот 260/230 - кто в лес кто по дрова - минус4, минус41, минус822 - совсем уж казуистика. Вот я и подумала - может, кто-то с таким уже сталкивался и знает, что к чему... на нанодропе сначала "бланк" бланк должен быть ТЕ буффер БЕЗ ПУЗЫРЕЙ ДНК должна быть РАСТВОР в ТЕ (1 час прои комнатной температуре) тока ПОТОМ мерить |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
|
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 15:35) Это все понятно, спасибо и соблюдено. В основной массе значения в пределах разумного, но некоторые сиьо выбиваются. И это часто совпадает с низким качеством ДНК на геле. Я просто пытаюсь выяснить: а) что это значит, б) чем это обусловлено, и в) чем это грозит. качество ДНК на геле понятие "слишком растяжимое" а чем грозит - это наверно что с ДНК далъше делать собираетесь |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 15:35) Это все понятно, спасибо и соблюдено. В основной массе значения в пределах разумного, но некоторые сиьо выбиваются. И это часто совпадает с низким качеством ДНК на геле. Я просто пытаюсь выяснить: а) что это значит, б) чем это обусловлено, и в) чем это грозит. можете в параллель померять Пикогрином например |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 02.05.2007 15:44) наверно нанодроп 3000 у вас есть ? |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 02.05.2007 15:45) пардон - нанодроп ND-3300 |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
(Guest @ 02.05.2007 15:53) Нету только ND-1000. А отчего в принципе, как вы думаете, возможны такие значения? Это ошибка измерения или признак примеси фенола в образце? |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
(Guest @ 02.05.2007 15:42) качество ДНК на геле понятие "слишком растяжимое" а чем грозит - это наверно что с ДНК далъше делать собираетесь AFFYMETRIX |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 16:50) |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 16:50) тока у него кается РНК если не Чип-он-чип |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 02.05.2007 17:09) или CGH |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 16:50) Тоды ой Ваше стремление разобратся вполне объяснимо |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
(Guest @ 02.05.2007 17:06) Спасибо... Только это, по-моему, про качество РНК |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
(Guest @ 02.05.2007 17:15) |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 17:22) а что на аффи делать собираетесъ ? |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 02.05.2007 17:34) |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 02.05.2007 17:34) |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
(Guest @ 02.05.2007 17:34) Genome-wide human SNP |
Janni IP-штамп: frlPzEHrsCZpM гость |
В любом случае спасибо, забросали прямо меня информацией. Пойду отделять зерна |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 02.05.2007 17:48) А я вот не знаю, я с одним человеом разговаиваю ли с несколькими? В любом случае спасибо, забросали прямо меня информацией. Пойду отделять зерна Редактор всем поставил IP ШТАМПЫ по данному поводу. Посмотрите на свой ник |
Ъ IP-штамп: frh5mdI9nB8Yg гость |
(Janni @ 02.05.2007 17:48) А я вот не знаю, я с одним человеом разговаиваю ли с несколькими? В любом случае спасибо, забросали прямо меня информацией. Пойду отделять зерна С одним, с одним Челом |
petr Постоянный участник |
|
Janni IP-штамп: fru6iMd.dV7wQ гость |
(petr @ 02.05.2007 23:53) Если есть сомнения загрязнен образец фенолом или нет, проще и быстрее не мерить на всяких СФах или чем там еще, а развести до пол-кубика, отхлороформить и переосадить. Спасибо за совет. Такая мысль тоже была, но, к сожалению, некоторых образцов слишком мало, чтобы так развлекаться. Вопрос у меня был даже не столько о том, есть там фенол или нет, а почему соотношение 260/230 уходит в минус. |
Janni IP-штамп: fru6iMd.dV7wQ гость |
(Guest @ 02.05.2007 18:18) Вот я первым делом туда и посмотрела Просто Вы отвечаете быстрее, чем я задаю вопросы, это меня и дезориентировало |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 03.05.2007 10:43) Спасибо за совет. Такая мысль тоже была, но, к сожалению, некоторых образцов слишком мало, чтобы так развлекаться. Вопрос у меня был даже не столько о том, есть там фенол или нет, а почему соотношение 260/230 уходит в минус. в минус на нанодропе - бланк обычно - ТЕ хорошии - и крутануть на 10000 и потом пипеткой не шуровать |
Janni IP-штамп: fru6iMd.dV7wQ гость |
(Guest @ 03.05.2007 11:46) Так не все же, а только некоторые... |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 03.05.2007 15:04) это не НЕКОТОРЫЕ - а ТЕЖЕ САМЫЕ в чем ДНК |
Janni IP-штамп: fru6iMd.dV7wQ гость |
(Guest @ 03.05.2007 15:35) я поняла, что ТЕ- это буфер имелось в виду не все уходят в минус а только некоторые |
Ъ IP-штамп: frh5mdI9nB8Yg гость |
(Janni @ 03.05.2007 10:46) Вот я первым делом туда и посмотрела Просто Вы отвечаете быстрее, чем я задаю вопросы, это меня и дезориентировало В том то и дело, что с толку сбивает Все жалуются, а он не понимает |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Ъ @ 03.05.2007 23:48) Ну вопервых не Все а тока Ты ЖАЛУВАЛСЯ. Разницу в ПЦР планшетах пришлось пару дней обяснять |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Ъ @ 04.05.2007 16:39) Нифига подобного Если Миллику УГОНЯЛИ из нее ползет смола и ингибирует ПЦР |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 04.05.2007 19:50) дк вроде обяснили что минус на нанодропе обычно из-за "бланк ТЕ буффера" пылъгрязпузури кода одни ДНК -тоже грязные -то ПЛУС а коды СЛИШКОМ ЧИСТЫЕ -то минус |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Janni @ 04.05.2007 19:50) а ысе нанодроп - хорожо промыватъ стеклышко -ато ПРЕДЫДУЩИЕ ДНК -граз могут накапится |
MartinS |
|
MMM Постоянный участник |
|
MartinS |
|
Mykhaylo Постоянный участник Україна |
|
MartinKat |
|
Mykhaylo Постоянный участник Україна |
|
-Ъ- Постоянный участник Москва |
(MartinS @ 03.03.2017 21:10) После разбавления в 10 раз (если конечно количество ДНК позволяет) от ингибирования не останется никакого следа. Остатки фенола никогда не мешают ПЦР - в основном в классическом выделении ДНК ингибирование ПЦР от всяких там солей, SDS, EDTA... Была статья в начале 90-х на эту тему. Найду - скину. Хуже всего в ПЦР работает высокомолекулярная вязкая ДНК. |
Mykhaylo Постоянный участник Україна |
|
-Ъ- Постоянный участник Москва |
(MartinS @ 02.03.2017 21:51) ИМНо обсуждаем сферического коня в вакууме. Сообщение было отредактировано -Ъ- - 06.03.2017 16:41 |
MartinKat |
|
Irchonok |
|
MMM Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |