Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Carbohydrate-Active Enzymes  / 33 /  -- классификация ферментов --
Кураторы темы:* daniil_naumoff
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуВнести в каталог новую ссылку
Участник оффлайн! daniil naumoff
moderator
Moscow, Russia



 прочитанное сообщение 13.05.2005 15:13     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

CAZy: Carbohydrate-Active Enzymes Database.

На сайте представлена современная классификация ферментов синтеза и утилизации углеводов, а также их гомологов. Ферменты (а точнее каждый из их модулей/доменов) разбиты на пять групп: Glycosidases and Transglycosidases, Glycosyltransferases, Polysaccharide Lyases, Carbohydrate Esterases, Carbohydrate-Binding Modules. В пределах каждого из них выделяются семейства, которые нумеруются арабскими цифрами в порядке описания. Каждое семейство объединяет "хорошие" гомологи. Родственные семейства объединены в кланы. Например, гликозидазы и трансгликозидазы образуют 113 семейств (GH1-GH118, кроме GH21, GH40, GH41, GH60 и GH69). Из них 50 семейств объединены в 14 кланов (GH-A–GH-N). Информация о каждом из семейств включает список его представителей из разных организмов с ссылками на базы данных аминокислотных и нуклеотидных последовательностей, указание ферментативных активностей, названий белков, наличия экспериментально определённых трёхмерных структур, данные о молекулярном механизме катализируемой реакции и компонентах активного центра. База данных обновляется примерно раз в месяц.

Ссылки на статьи с описанием классификации:
1. Biochemical Journal, 1991
2. Biochemical Journal, 1993
3. Biochemical Journal, 1996
4. Biochemical Journal, 1997
5. Recent Advances in Carbohydrate Bioengineering, 1999
6. Nucleic Acids Research, 2009

Сообщение было отредактировано daniil naumoff - 24.11.2010 14:52

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Aglaya
Участник оффлайн! daniil naumoff
moderator
Moscow, Russia



 прочитанное сообщение 21.06.2005 16:59     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Glycosidases and Transglycosidases.

Более подробная классификация по семейству GH3: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH4: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH5: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH6: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH8: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH9: ссылка и ссылка
Более подробная классификация по семейству GH13: ссылка и ссылка
Более подробная классификация по семейству GH16: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH18: ссылка и ссылка
Более подробная классификация по семейству GH27: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH28: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH31: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH32: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH36: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH38: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH43: ссылка
Более подробная информация по семейству GH62: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH68: ссылка
Более подробная информация по семейству GH94: ссылка
Более подробная информация по семейству GH95: ссылка
Более подробная классификация по семейству GH97: ссылка
Более подробная информация по семейству GH98: ссылка
Более подробная информация по семейству GH99: ссылка
Более подробная информация по семейству GH100: ссылка и ссылка
Более подробная классификация по семейству GH101: ссылка
Более подробная информация по семейству GH102: ссылка
Более подробная информация по семейству GH103: ссылка
Более подробная информация по семейству GH104: ссылка
Более подробная информация по семейству GH105: ссылка
Более подробная информация по семейству GH106: ссылка
Более подробная информация по семейству GH107: ссылка
Более подробная информация по семейству GH108: ссылка
Более подробная информация по семейству GH109: ссылка
Более подробная информация по семейству GH110: ссылка и ссылка
Более подробная информация по семейству GH111: ссылка
Более подробная информация по семейству GH112: ссылка
Более подробная информация по семейству GH113: ссылка
Более подробная информация по семейству GH114: ссылка
Более подробная информация по семейству GH115: ссылка

Сообщение было отредактировано daniil naumoff - 22.11.2010 13:02
Участник оффлайн! daniil naumoff
moderator
Moscow, Russia



 прочитанное сообщение 08.08.2006 17:03     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

В развитие двухуровневой (семейство/клан) классификации каталитических доменов гликозил-гидролаз и их гомологов предложена многоуровневая иерархическая классификация:

Naumoff D.G. Development of a hierarchical classification of the TIM-barrel type glycoside hydrolases. // Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. July 16-22, 2006. Novosibirsk. Russia. V.1. P.294-298. PDF

Сообщение было отредактировано daniil_naumoff - 09.08.2006 18:13
Участник оффлайн! daniil naumoff
moderator
Moscow, Russia



 прочитанное сообщение 12.03.2008 11:57     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

На ряду с Carbohydrate-Active Enzymes Database теперь ещё существует и CAZypedia.
Участник оффлайн! pollard45p
Участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  28.12.2018 09:00     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Treadmills are among the most famous kinds of cardio fitness hardware for both exercise centre and home utilize.

best treadmill 2019 |
best treadmill |
best treadmill for home
Участник оффлайн! davisjohn64




 прочитанное сообщение Сообщение на английском  11.01.2019 13:15     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Great topic, thank you for sharing this website.
Download the Latest Norton Antivirus Setup Protection. Lets see my website.

norton.com/setup | office.com/setup
Участник оффлайн! davisjohn64




 прочитанное сообщение Сообщение на английском  07.02.2019 11:39     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Download, Install or activate the Latest Ms office Setup and Norton Antivirus Setup Protection. For more information about setup procedure check the my Products: norton.com/setup | office.com/setup | office.com/setup
Bitdefender Login
IP-штамп: fr0t5ggpfhgHQ
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  24.07.2019 12:23     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Bitdefender Login | mcafee.com/activate | my.avast.com
Участник оффлайн! sachin75310

Gurgaon



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  27.09.2019 15:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

wow
norton.com/setup
IP-штамп: fr1dI8gOCPEAI
гость



 прочитанное сообщение 14.10.2019 10:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

И лике ит астоундинг сите И дисцоверед ёур блог плеасант артицле ехтраординары емплойментс греат щорк.

Трулы И до валуе ёур щорк.


Висит фор мы щебсите : нортон.цом/сетуп
norton.com/setup
IP-штамп: fr1dI8gOCPEAI
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  14.10.2019 10:47     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

Amazing web journal! Your information are quite astounding for all and steady , an obligation of appreciation is all together for sharing it.

Visit for my website : norton.com/setup

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Web-ресурсы · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуВнести в каталог новую ссылку

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 20.10.19 20:57
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft