Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
aleximmunology |
|
MMM Постоянный участник |
|
aleximmunology |
|
MMM Постоянный участник |
|
aleximmunology |
Файл/ы:
|
IMK Участник |
|
MMM Постоянный участник |
|
aleximmunology |
|
MMM Постоянный участник |
|
Rhizon Участник |
1) В некоторые фазы жизненного цикла прокариотическая клетка может содержать несколько копий генома; 2) Число рРНК-оперонов в геноме прокариот может варьировать от 1 до 15. В среднем по базе геномов, наверное, 2-4 копии. Т.е. пересчитать число оперонов в число клеток можно только приблизительно. Если у вас праймеры, специфичные для конкретного вида, то там все просто... Сообщение было отредактировано Rhizon - 13.08.2016 11:45 |
aleximmunology |
|
aleximmunology |
|
ksm Постоянный участник |
после этого берете навеску вашего субстрата в граммах/миллиграммах, выделяете ДНК и оцениваете содержание по полученной кривой. необходимо разобраться будете ли вы оценивать в абсолютных единицах, либо приводить количество на содержание в контроле - в последнем случае вы получаете безразмерные "разы", которые покажут, во сколько раз рРНК больше в экспериментальной пробе относительно контроля. в случае с абсолютной оценкой вы будете оперировать условным содержанием в г фекального субстрата но, данный субстрат тоже необходимо как-то нормализовать. я не знаю, как это делается, но, допустим на тотальную ДНК, на г сухого в-ва, на г сырого в-ва и т.д. еще как вариант, считать соотношение мишеней для специфичных и неспецифичных праймеров Сообщение было отредактировано ksm - 14.08.2016 14:36 |
ksm Постоянный участник |
(aleximmunology @ 14.08.2016 15:01) Встроенная программа cfx manager выдает после прогона начальное кол-во мишени и др колич. показатели. Насколько корректно пользоваться этими цифрами для хотя бы приблизительного суждения о численности конкретного вида бактерии при использовании видоспецифич. праймеров?? если, уж простите, хавно нормализовано, либо выделена ДНК из навески, то при прочих равных вполне можете пользоваться |
aleximmunology |
|
vadimchik152a Постоянный участник |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
Shikooo Постоянный участник |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: fr4iy3.kHUw02 гость |
|
vadimchik152a Постоянный участник |
|
vadimchik152a Постоянный участник |
|
Shikooo Постоянный участник |
|
Ufa1688 Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |