Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Технологии секвенирования следующего поколения. -- Куда двигаться дальше? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Чёрный список: R-J-Dio, breznak, Acer-X
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 12:10     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(Carbon Copy @ 09.11.2017 19:48)
Ссылка на исходное сообщение  Молодец, genseq, грамотно изложил первоочередные задачи советской власти! Ты только это, последний абзац убери или перепиши как-нибудь от греха подальше. Можно то же самое сказать, но другими словами.


Прошла ровно неделя после появления на Geektimes "жёсткого" варианта "Первоочередных задач":
https://geektimes.ru/post/295313/
Можно подвести первые итоги.
Новостей, как обычно, две. Одна - хорошая, другая - плохая. Начну с хорошей. Опус всего за неделю набрал 9 тысяч просмотров. jump.gif
Плохая новость заключается в том, что почти все комментарии (143 шт./7 дней) весьма негативные. weep.gif

P.S.: Carbon Copy был абсолютно прав. Писать нужно было не о "взломе ПО", а о "информационной безопасности" и о "реверс-инжиниринге программного обеспечения". Теперь хоть знаю, как это называется у профессионалов. wink.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 19.11.2017 17:35
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 12:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

" ...весьма негативные" - хипстеры лютуют!
да, среди негативных пустозвонства тоже >95%, по моим скромным оценкам.
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 13:07     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

genseq, мне кажется Вы немного неправильно понимаете аудиторию geektimes. Для Вас секвенатор - это глобальная идея, а для читателей - очередная прикольная штуковина. Про то, как эту штуковину собрать читать прикольно, про то, как Россия должна догнать и перегнать - нет. Geektimes это не политический ресурс.
Но так как про сбор секвенатора на кухне или подробностей функционирования от опытного сервис инженера информации в статье нет, то и "выхлоп" соответствующий - обсуждение фразы про взлом.

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): ksm, dk, чайник555
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 17:27     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(kblag @ 19.11.2017 11:07)
Ссылка на исходное сообщение  genseq, мне кажется Вы немного неправильно понимаете аудиторию geektimes.


Аудиторию понимаю правильно. Именно в этой навозной куче можно найти требуемые жемчужные зёрна. Но в комментариях они не светятся. Пишут на личную почту. wink.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ksm
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 23:26     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 19.11.2017 15:27)
Ссылка на исходное сообщение  Аудиторию понимаю правильно. Именно в этой навозной куче можно найти требуемые жемчужные зёрна. Но в комментариях они не светятся. Пишут на личную почту.  wink.gif

ну удачи, коли так.

Всего благодарностей: 8Поблагодарили (8): Bern5, citypizza, meteo, bee3, магнитный штатив, genseq, dk, чайник555
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 18.12.2017 10:52     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Сегодня - небольшая круглая дата. Количество просмотров публикации "Задачи отечественного секвенаторостроения" на geektimes.ru перевалило за 10 тысяч. beer.gif

Особых новостей в области NGS пока не вижу, хотя 1 декабря в Нью-Йорке завершилась конференция Oxford Nanopore. Её основные итоги описаны здесь:
http://omicsomics.blogspot.ru/2017/12/2017...ty-meeting.html
http://albertsenlab.org/ncm17-day-1-new-te...g-applications/
http://albertsenlab.org/ncm17-day-2-into-the-unknown/
Заметным событием (для тех, кто понимает) стала сборка гексаплоидного генома пшеницы (Triticum aestivum).
Новые секвенаторы SmidgION и PromethION обещают выпустить в продажу только во второй половине 2018 года. shuffle.gif

Ещё недавно появилась публикация о проблемах мобильного секвенирования (т.е. о MinION). Рекомендую: umnik.gif
скачать файл Challenges_2017.pdf
размер: 1.81мб
кол-во скачиваний: 279



И ещё в минувшую пятницу появилось сообщение о первом риде, длина которого превысила миллион нуклетидов (1,015 Mb):
https://nanoporetech.com/about-us/news/worl..._source=twitter

Сообщение было отредактировано genseq - 31.12.2017 12:55
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 07.01.2018 14:26     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Из-за праздников пропустил описание запуска MinION в Санкт-Петербурге от 31.12.2017:
https://vk.com/feed?w=wall254879850_165

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ksm
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.01.2018 10:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Ещё одна пропущенная новость. Illumina недавно объявила о том, что продажа секвенаторов iSEQ 100 (проект Firefly) начнётся в I квартале этого года. Прибор довольно дешёвый (~$20 тыс.) и компактный (30.5×33×28 см, 16 кг). Способен за 17,5 часов секвенировать до 3000 ампликонов (2х150 bp):
https://www.genengnews.com/gen-news-highlig...eq-100/81255358
https://www.illumina.com/content/dam/illumi...70-2017-020.pdf

Сообщение было отредактировано genseq - 19.01.2018 10:34

Картинки:
картинка: Illumina_iSeq_100.jpg
Illumina_iSeq_100.jpg — (24.22к)   

Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.01.2018 13:42     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

А стоимость расходки неизвестна пока?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  22.01.2018 14:39     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

http://omicsomics.blogspot.ru/2018/01/iseq.html

The 2x150 cartridges are priced at $625 each, with small (~5%) discounts for packs of four.
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 22.01.2018 15:36     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

Генсек, подавай в суд, там тебя нагло используют:
http://anpro.group/#news
Очень крутой кит! tongue.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Daemonarchestratygos
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.01.2018 16:08     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Новый компонент набора – Реагент В заменяет магнитные частицы AMPure® Beads на этапе финальной очистки библиотек* после стадии преамплификации.

так может частицы Генсека и он в доле wink.gif
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.01.2018 10:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 22.01.2018 12:39)
Ссылка на исходное сообщение  http://omicsomics.blogspot.ru/2018/01/iseq.html
The 2x150 cartridges are priced at $625 each, with small (~5%) discounts for packs of four.

Тогда я чего-то не понимаю - а смысл менять Майсек вот на это? Что-то среднее получается между микрокитом за $800 с 8 млн. PE и нанокитом за $500 с 2 млн. PE. И вместо того, чтобы выпустить 4 млн. за $600 для майсека, они делают отдельный прибор. Опять маркетологи постарались, гениально просто.
Конечно, в качестве нового прибора цена вкусная, но в качестве удешевления NGS-анализа (например, 400-500 тыс. ридов за 100 баксов) опять глухо, при наличии майсека светлячок просто не нужен. А ведь могли бы занять нишу индивидуального таргетного секвенирования, для запуска 1-2образцов многие были бы готовы купить в дополнение к существующему зоопарку.
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.01.2018 10:30     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

так новый прибор под амплисеки, чтобы цену на расходники клиентом отбивать, а ниша, о которой вы пишите - Сэнгер
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.01.2018 11:10     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

На панель размером меньше одной мегабазы (а это генов 20-30) на майсек надо копить 12 или 24 образца и то покрытие избыточное для герминальных. Вариантов дешево поставить такую панель для 1-2-3 образцов на сегодняшний день для иллюмины не существует - микро и нанокиты все равно слишком дороги. А потребность ставить 1-2-3 образца есть.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): sceptique
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.02.2018 22:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Новости нанопорового секвенирования:

1. В начале февраля прошли запуски MinION в Нижнем Новгороде и в Оболенске (!!!?):
http://www.skygen.com/novosti/nanoporovoe_...spotrebnadzora/
http://www.skygen.com/novosti/v_fbun_gnts_...ushchen_minion/

2. On 8th Feb 2018, Clive G Brown provided a tech update on Oxford Nanopore by webcast.
https://nanoporetech.com/about-us/news/tech...d-other-goodies
Key updates included:
A pathway to a sub-$1,000 genome using PromethION (and longer term, MinION). PromethION pricing is now on the store.
Introducing Flongle, an adapter for MinION and GridION that enables smaller, single-use flow cells for smaller samples. Flongle may be used in the lab for smaller tests of quality checks, outside the lab, or may be developed into tests for applications like diagnostics, agriculture, food safety, water testing, education. First Flongles will be available for Early Access around the London Calling conference.
As Oxford Nanopore aims to get closer to our anyone/anywhere goal, we are launching MinIT, a pre-configured IT solution that replaces a laptop for MinION or Flongle.


Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): LMP
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.02.2018 22:31     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Про Оболенск подтверждаю - закуплено три штуки и пробный запуск был. У меня там брат работает rolleyes.gif
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.02.2018 10:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

А по-подробней можно? shuffle.gif
Как получилось.
Или пока рано?))
Участник оффлайн! SkyGen
Участник
Москва



 прочитанное сообщение 12.02.2018 12:00     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Коллеги, мы со своей стороны можем пригласить вас на вебинар - о нашем опыте инсталляций шести систем MinION в России - зарегистрироваться можно тут: goo.gl/tx9mq3

Сообщение было отредактировано SkyGen - 12.02.2018 12:03
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.02.2018 12:12     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(SkyGen @ 12.02.2018 10:00)
Ссылка на исходное сообщение  Коллеги, мы со своей стороны можем пригласить вас на вебинар - о нашем опыте инсталляций шести систем MinION в России - зарегистрироваться можно тут: goo.gl/tx9mq3
ссылка не открывается. Вы бы программу вебинаров что ли выложили, а то звучит как реклама скаджина: чего её слушать она и так в "фирмах" висит.
Участник оффлайн! SkyGen
Участник
Москва



 прочитанное сообщение 12.02.2018 13:03     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(LMP @ 12.02.2018 13:12)
Ссылка на исходное сообщение  ссылка не открывается. Вы бы программу вебинаров что ли выложили, а то звучит как реклама скаджина: чего её слушать она и так в "фирмах" висит.


Спасибо за ответ!
У нас ссылка открылась в сокращенном варианте - который указан выше.
На всякий случай вот оригинальная ссылка на регистрацию: https://events.webinar.ru/2966963/909971
вот сокращенная:
goo.gl/tx9mq3

Вы можете скопировать ее в браузер.

Название вебинара:
Успешные запуски секвенаторов MinION от Oxford Nanopore Technologies в России – теория и практика от СкайДжин

Анонс:
Технология нанопорового секвенирования сегодня занимает новые позиции в мировой науке: каждый день приходят новости о новых решаемых задачах и улучшении точности получаемых данных.
СкайДжин – официальный дистрибьютор Oxford Nanopore Technologies – приглашает вас принять участие в вебинаре, на котором мы расскажем не только о технологии, но и поделимся успешным опытом по запускам первых MinION в октябре 2017 - феврале 2018 года в российских лабораториях.

Дата: 26 февраля 2018 г
Время: 16.00 по московскому времени
Регистрация: требуется

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): genseq, LMP, sceptique
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.02.2018 08:47     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(SkyGen @ 12.02.2018 10:00)
Ссылка на исходное сообщение  Коллеги, мы со своей стороны можем пригласить вас на вебинар - о нашем опыте инсталляций шести систем MinION в России - зарегистрироваться можно тут: goo.gl/tx9mq3


Пропустил начало вебинара из-за проблем с компьютером. Наверное, поэтому не услышал ничего о шести системах MinION, инсталлированных в России. На сайте Скайджин фигурируют новости только об одном московском (ЦНИИЭ) и трёх российских (Новосибирск, Нижний Новгород, Оболенск):
http://www.skygen.com/novosti/kompaniya_sk...inion_v_rossii/
http://www.skygen.com/novosti/v_novosibirske__sekvenirovat_/
http://www.skygen.com/novosti/nanoporovoe_...spotrebnadzora/
http://www.skygen.com/novosti/v_fbun_gnts_...ushchen_minion/
Отсюда - вопрос:
Где инсталлированы ещё два Мин'ИОНа? confused.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 28.02.2018 08:49
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 28.02.2018 12:28     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(genseq @ 28.02.2018 09:47)
Ссылка на исходное сообщение  
Отсюда - вопрос:
Где инсталлированы ещё два Мин'ИОНа? confused.gif

Ну найдешь где, а что дальше, кому это интересно confused.gif
Интересная у тебя работа, Генсек.
Мне предлагали поиграться - отказался, еле ноги унес. tongue.gif
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 28.02.2018 17:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Врачам они официально продать ничего не смогут: РУшки для медицинских госзакупок в 2018 году у прибора не будет, посему только в чистую науку можно будет купить или чистым коммерсантам у которых после проверок не всю оборотку арестовали ещё lol.gif

Играться с ним незачем, на вебинаре достаточно наговорили, чтобы понять что это за зверь. Я лично понял его характер. Скопировать его, скорее всего, даже зная белки, будет близко к невозможному, судя по всему поры, даже самые лучшие, недостаточно всё ещё стабильны. А у большинства пиратов вообще ничего не будет работать, уже через час после рефолдинга в мембране.

Сообщение было отредактировано sceptique - 28.02.2018 17:35
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 07.03.2018 11:58     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Появилась идея использовать криптовалютные технологии для хранения и монетизации секвенированных геномов. umnik.gif
Покопавшись в Интернете обнаружил сразу несколько попыток её реализации. Причём самая серьёзная, на платформе Ethereum, затеяна нашими людьми: wink.gif
https://zenome.io/
https://zenome.io/download/terms.pdf

Конкуренты:
https://www.nebulagenomics.io/
https://www.lunadna.com/
https://encrypgen.com/
http://genecoin.me/
Фигли думать - всё давно придумано! jump.gif beer.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 08.03.2018 11:00
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 09.03.2018 22:38     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

75-100 МБайт на каждого жителя в блокчейн грузить, да еще в открытом виде - это не только безумие в плане размера такой цепочки на всех граждан, но и открытое нарушение уголовного кодекса РФ.

Нашими людьми это затеяно пока они не понимают, что раскрывать свои геномные данные всем - это всё равно что подарить свои отпечатки пальцев, паспорт и кредитки разбойникам в лесу. mad.gif

Сообщение было отредактировано sceptique - 09.03.2018 22:45
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.03.2018 09:06     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(sceptique @ 09.03.2018 20:38)
Ссылка на исходное сообщение  75-100 МБайт на каждого жителя в блокчейн грузить, да еще в открытом виде - это не только безумие в плане размера такой цепочки на всех граждан, но и открытое нарушение уголовного кодекса РФ.

Нашими людьми это затеяно пока они не понимают, что раскрывать свои геномные данные всем - это всё равно что подарить свои отпечатки пальцев, паспорт и кредитки разбойникам в лесу.  mad.gif


Достоинством блокчейн-технологии является хорошая защищённость геномной информации. Её собственником является только обладатель генома. И только он имеет право ей распоряжаться - предоставлять полный или ограниченный доступ заинтересованным лицам или организациям. Причём за вполне конвертируемую криптовалюту. Или за её эквиваленты (токены). А вырученными токенами оплачивать услуги биоинформатиков и прочие плюшки.

По-моему идея вполне достойная "раскрутки". И не только по-моему. Одних только токенов ZNA (от Zenome) продано уже почти 10 миллионов. И оплачены они конвертируемыми эфирами и биткойнами.
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 10.03.2018 14:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Вы не расшифруете, что значит "хорошая защищённость", дорогой ГенСеq?

Сервера (все!) этой цепочки находятся на территории РФ, сертифицированы ФСТЭК и ФСБ на отсуттсвие незадокументированных особенностей программного кода? Все (ВСЕ, Карл!) участники блокчейна имеют письменные разрешения от загрузчика в блокчен своего генома на владение своими генетическими данными, и, главное, ключ от блока с конкретным геномом есть ТОЛЬКО у его владельца изо всей "цепи"?

Достоинством блокчейн-технологии является лишь самый мутный из всех возможных механизм сокрытия данных и ключа, позволяющего их расшифровать. Данные просто случайным образом размазываются по всем участникам "цепи", маленькими кусками-блоками. При этом все ссылки на блоки имеются у всех, и КАЖДЫЙ, у кого есть набор ключей (а что-то мне подсказывает, что он есть не только у декларированных и доверчивых лохов-юзеров) может по данным сети стащить (украсть, стибрить и прочие эпитеты) данные, даже не засветившись, поскольку случайный доступ никак нельзя посторонним связать с конкретной целью, которую хочет собрать злоумышленник, спёрший или тихо скопировавший всю непубличную цепочку себе. Блокчейн - это не технология защиты чего-либо типа данных. Это технология бесследного их воровства и обобществления без возможности изъять их из публичного доступа, поскольку однажды туда загруженное уже невозможно стереть, как и в большом интернете.

Сообщение было отредактировано sceptique - 10.03.2018 14:55
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.03.2018 19:37     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Похоже, в блокчейновых технологиях Вы разбираетесь намного лучше меня. Мои познания ограничиваются тем фактом, что криптовалюту (биткойны, эфиры и т.п.) воруют не так уж и часто.

https://www.healthcare.digital/single-post/...g-In-Healthcare
Today there are 30 Tokens that operate within the healthcare, medicine or pharmaceutical space. In the next 12 months there could 120, maybe 150 new tokens in issue as more and more entrepreneurs and innovators flock to the ICO markets in search of funds to develop their healthcare products and services.

Сообщение было отредактировано genseq - 10.03.2018 21:10
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 10.03.2018 23:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Раздувание венчурных пузырей, особенно с публично-торгуемыми компаниями - это намного более древний "бизнесс", чем обобществление своих геномов wink.gif
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 11.03.2018 14:27     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 10.03.2018 20:37)
Ссылка на исходное сообщение ... криптовалюту (биткойны, эфиры и т.п.) воруют не так уж и часто.

Так называемую "криптовалюту", или токены, украсть (в классическом понимании этого слова, то есть - присвоить без ведома владельца и общества) невозможно, поскольку они - именные и вся цепь (весь интернет) знает кому какое количество чего принадлежит. И пока крптоключ владельца не удостоверит переход прав собственности - она не может измениться, поскольку нельзя чисто технически перезатереть многие миллионы цепочек, хранящихся распределенно в одно и то же измененнное состояние без ведома владельца. Нельзя - пока владелец криптоключа не подпишет сам переход их состояния в новое. Или, чего пока не происходит, но ради чего всё и делается, некто, кто тихо владеет всеми ЧУЖИМИ частными ключами СВОЕЙ цепи не захочет присвоить или переписать на себя или своего бенефициара ЧЬИ-ТО токены. Обычно это происходит после смерти владельца или с полным заметанием следов и гарантией, что прошлый владелец НИКОГДА не заявит сам о краже. Поэтому - о кражах просто никто не знает в силу закрытости использования непубличных приватных ключей, а не потому, что их нет, дорогой ГенСеq. wink.gif Просто говоря - красть информацию могут только "руты" этих сетей и цепей, про которых активно верещится, что "их нет". wink.gif

Сообщение было отредактировано sceptique - 11.03.2018 14:31

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): genseq
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.04.2018 09:02     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Наступило 25 апреля. Поздравляю всех с Днём ДНК!

Иллюстрации к докладу на сегодняшнем семинаре можно посмотреть здесь:

скачать файл SEQ___2018.ppt
размер: 9.65мб
кол-во скачиваний: 451




Сообщение было отредактировано genseq - 04.05.2018 15:57

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): NMR-guy, dk
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 04.05.2018 14:19     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

В презентации на странице 36
"Особенности национального секвенирования (20018 год)"
20018 год - это не опечатка confused.gif
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 04.05.2018 15:56     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(kblag @ 04.05.2018 12:19)
Ссылка на исходное сообщение  В презентации на странице 36
"Особенности национального секвенирования (20018 год)"
20018 год - это не опечатка confused.gif


Спасибо. Исправил. shuffle.gif

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): kblag, NMR-guy
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 03.10.2018 15:55     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Завтра на ВДНХ:

Сообщение было отредактировано genseq - 06.10.2018 14:00

Файл/ы:

скачать файл 9.2.6_1______________________2018.ppt
размер: 5.93мб
кол-во скачиваний: 332


Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.10.2018 07:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(seQQgene @ 12.10.2018 04:04)
Ссылка на исходное сообщение  гинсек а что завтра на вднх  eek.gif  confused.gif


Картинки:
картинка: Congress.png
Congress.png — (34.57к)   



Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): seQQgene
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 20.11.2018 01:01     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Просмотрел, новость - двухнедельной давности. Иллюмина - это наше всё, потихоньку подминает под себя геномное секвенирование в США.

Illumina to Acquire Pacific Biosciences for Approximately $1.2 Billion, Broadening Access to Long-Read Sequencing and Accelerating Scientific Discovery
https://www.illumina.com/company/news-cente...18/2374913.html

SAN DIEGO & MENLO PARK, Calif.--(BUSINESS WIRE)--Nov. 1, 2018-- Illumina, Inc. (NASDAQ: ILMN) and Pacific Biosciences (NASDAQ:PACB) today announced they have signed an agreement for Illumina to acquire Pacific Biosciences at a price of $8.00 per Pacific Biosciences share in an all-cash transaction. This price represents a premium of 71% to Pacific Biosciences’ 30 trading day volume weighted average share price as of the market close on October 31st, 2018, and a total enterprise value of approximately $1.2 billion on a fully diluted basis.

The agreement has been approved by the board of directors of Illumina and Pacific Biosciences. The acquisition complements Illumina sequencing solutions with accurate long-read sequencing capabilities to answer a set of complex genomic questions. While Illumina’s accurate and economic short-read sequencing platforms address the majority of sequencing applications optimally, select applications, such as de novo sequencing and sequencing of highly homologous regions of genomes, are better addressed with accurate long-reads. With its acquisition of Pacific Biosciences, Illumina will be positioned to provide integrated workflows and novel innovations that bring together the best of both technologies to help researchers advance their discoveries faster and clinicians offer new tests economically.

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): genseq, kblag, banned sceptique-NMRguy
Участник оффлайн! apoptos
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 05.12.2018 22:28     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Коллеги, как-то вы про BGI забыли smile.gif))
Вот занимательный новости и слова про 70%, не думаю, что вранье...
https://helicon.ru/brends/bgi/

Ну и наконец-то qiagen можно купить в нормальном месте...
https://helicon.ru/brends/qiagen/
так, к слову пришлось... ибо кто-то хотел слить одно в другое, но можно вспомнить и про с винтом и про лабиринт...
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 06.12.2018 03:52     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(apoptos @ 05.12.2018 20:28)
Ссылка на исходное сообщение  Коллеги, как-то вы про BGI забыли smile.gif))
Вот занимательный новости и слова про 70%, не думаю, что вранье...
https://helicon.ru/brends/bgi/

Канешн канешн, со смехотворной длинной рида 35 букв только геномы растений секвенировать. Пусть лохам втирают про 70% геномов различных видов растений и животных. Длинные риды (PacBio, Oxford Nanopore)- обязательное условие секвенирования сложных растительных геномов с большим количеством повторов.
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 06.12.2018 04:57     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Вы мне лучше скажите, куда провалилась страсть хеликоновцев торговать строго американским? Что с ними случилось?

Длинные участки можно и нужно капиллярником проходить (в нормальных лабах это делают в параллель) всё равно - он не ошибается вообще (особенно в полиплоидных геномах, в отличие от всего остального). Про ПакБио - особенно смешно с учётом того, как оно ошибается и ломается. И сколько при этом стоило... rolleyes.gif

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 06.12.2018 04:59
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 06.12.2018 06:07     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(banned sceptique-NMRguy @ 06.12.2018 02:57)
Длинные участки можно и нужно капиллярником проходить (в нормальных лабах это делают в параллель) всё равно - он не ошибается вообще (особенно в полиплоидных геномах, в отличие от всего остального). Про ПакБио - особенно смешно с учётом того, как оно ошибается и ломается. И сколько при этом стоило...  rolleyes.gif

Пожалуйста, не пишите того, чего не знаете, Вы себя ставите в неловкое положение. Я на PacBio секвенировал много чего, в том числе геном пшеницы (не помню - какого то определённого сорта). Про капиллярник - Вы себе обьём работы представляете хоть немного?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 06.12.2018 09:18     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(apoptos @ 05.12.2018 20:28)
Ссылка на исходное сообщение  Коллеги, как-то вы про BGI забыли smile.gif))
Вот занимательный новости и слова про 70%, не думаю, что вранье...
https://helicon.ru/brends/bgi/


Спасибо за новость. Не знал, что у BGI появился официальный представитель в России. Интересно, сколько стоит их MGISEQ-2000? И почём расходные материалы?

http://en.mgitech.cn/product/Sequencer.html

Сообщение было отредактировано genseq - 06.12.2018 09:18

Картинки:
картинка: MGI.jpg
MGI.jpg — (74.9к)   

Участник оффлайн! Dima11
Участник



 прочитанное сообщение 06.12.2018 10:35     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(Carbon Copy @ 06.12.2018 04:52)
Ссылка на исходное сообщение  Канешн канешн, со смехотворной длинной рида 35 букв только геномы растений секвенировать. Пусть лохам втирают про 70% геномов различных видов растений и животных. Длинные риды (PacBio, Oxford Nanopore)- обязательное условие секвенирования сложных растительных геномов с большим количеством повторов.


35 букв???

150+150
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 06.12.2018 17:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(Dima11 @ 06.12.2018 08:35)
Ссылка на исходное сообщение  35 букв???

150+150

И чо? У Complete Genomics было 35 букв, но китайцы по всей видимости накрутили по максимуму, как всегда в ущерб качеству. По большому счёту длина рида не критична для многих аппликаций. Illjumina же цветёт и пахнет с 150 буквами. SOLID правда вылетел в трубу с 50. НО, растительные геномы ими не отсеквенируешь однозначно. Поэтому "70% геномов различных видов растений и животных" - не боле, чем профанация и рекламный трюк.
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 11.12.2018 07:15     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(Carbon Copy @ 06.12.2018 07:07)
Ссылка на исходное сообщение  Пожалуйста, не пишите того, чего не знаете, Вы себя ставите в неловкое положение. Я на PacBio секвенировал много чего, в том числе геном пшеницы (не помню - какого то определённого сорта). Про капиллярник - Вы себе обьём работы представляете хоть немного?

Пшеница от рака не умирает и в суд её родня на Вас за пропуск соматической мутации не подаст. lol.gif Так что веселитесь со своими овощами сколько хотите и на чём хотите, главное от людей держитесь подальше - ради собственнного блага.

А хвалится что заправлял реагентами ПакБио и вынимал из него данные с кучей ошибок в коде - стало тем же самым, что воспоминать о полётах на станции "Мир" и секвенировании рошевским Джуниором. "Какая хорошая была станция Мир! Какие в ней были ШЛЮЗЫ!" Как интересно было секвенировать геном пшеницы на ПакБио! Какие длинные из неё вылазили РИДЫ!!!! weep.gif rolleyes.gif mol.gif

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 11.12.2018 07:22
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 11.12.2018 17:31     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(banned sceptique-NMRguy @ 11.12.2018 05:15)
Пшеница от рака не умирает и в суд её родня на Вас за пропуск соматической мутации не подаст.  lol.gif  Так что веселитесь со своими овощами сколько хотите и на чём хотите, главное от людей держитесь подальше - ради собственнного блага.

А хвалится что заправлял реагентами ПакБио и вынимал из него данные с кучей ошибок в коде - стало тем же самым, что воспоминать о полётах на станции "Мир" и секвенировании рошевским Джуниором. "Какая хорошая была станция Мир! Какие в ней были ШЛЮЗЫ!" Как интересно было секвенировать геном пшеницы на ПакБио! Какие длинные из неё вылазили РИДЫ!!!!  weep.gif  rolleyes.gif  mol.gif

Ну что тут сказать. Хамство никогда никого не украшало, пусть даже и сдобренное весёлыми смайликами. Если Вам нечего сказать по существу, так как Вы по всей видимости не разбираетесь в предмете обсуждения абсолютно, лучше было бы промолчать. Отвечать выпадом на выпад я не собираюсь, чтобы не устраивать очередной говносрач, тем более, что смысл Вашего высказывания весьма туманен. Одно лишь замечу про "овощи" - Монсанто секвенирует растения так, что секвенаторы горят от перегрузки, а данные потом анализируются целым биоинформатическим институтом. И нигде эти результаты не публикуются, так как всё - частная собственность.
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 12.12.2018 19:57     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

На здоровье. Главное - пусть не забывают маркировать их "ГМО" и сами почаще этим питаться. lol.gif Их страна (монсант разных) - их порядки.
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 27.12.2018 17:12     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Ну и наконец-то qiagen можно купить в нормальном месте...
https://helicon.ru/brends/qiagen/

[/quote]

Может со временем и отечественное что-то появится
https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/24/505966

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): -Ъ-
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 28.12.2018 07:21     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Они и Сибэнзим теперь продают!! Ааааа!!!! jump.gif

А это вообще невероятно: https://helicon.ru/brends/syntol/ mol.gif jump.gif

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 28.12.2018 07:23
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 28.12.2018 10:48     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

[quote=kb1,27.12.2018 18:12]Ссылка на исходное сообщение  Ну и наконец-то qiagen можно купить в нормальном месте...
https://helicon.ru/brends/qiagen/

[/quote]

Может со временем и отечественное что-то появится
https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/24/505966
[/quote]
Имеет тот же недостаток что и WGA - biasis во вновь синтезированном ДНК. В статье на эту тему ничего.
Но в любом случае, думаю, когда под рукой крохи "ценнейшей днк" - найдет применение.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.03.24 07:52
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft