Rambler's Top100
Lo-Fi Version* Virtual  Russian keyboard  Russian  
Molbiol.ru | Project | Protocols | Programs | Literature
Web | Companies | Marketplace | Labor exchange

Today's active topics  [ Log In* | Register* ]  
   



Forum: 
 

Replying to R Help

Post Icons*  [ w/o icon ]   Important!   Question   Information     Know-how   Joke, funny story     Congratulation, gratitude   Disgusting!   Problem   Pictures, photos
Enter your Name

 [Close all Tags*

*


*



Emoticon: yes Emoticon: no Emoticon: smile Emoticon: entreat Emoticon: laughing out loud Emoticon: wink Emoticon: tease Emoticon: squirm Emoticon: shame Emoticon: can't understand! Emoticon: confused Emoticon: roll up eyes Emoticon: sad Emoticon: weep Emoticon: mad Emoticon: super Emoticon: clever man Emoticon: teapot Emoticon: beer, join Emoticon: Hurrah! Emoticon: got a problem!
Convertion of the selected text into cyrillic characters. Text within square brackets '[]' is not converted

Example: biologija -> биология [b] - bold

Example: [b]bold[/b] [i] - italic

Example: [i]italic[/i] [u] - underlined

Example: [u]underlined[/u] [sup] - superscript

Example: temperature is 37[sup]o[/sup]C [sub] - subscript

Example: H[sub]2[/sub]O - water [QUOTE] - is used to quote posts, the quote is inserted with a small indentation from the text border

Example: [QUOTE]quote[/QUOTE] [code] - formatting preservation
Is used to display the text as it is, without automatic line folding, without interpreting forum codes and smilies; the text is inserted with a small indentation from the text border

Example: 
[code]
programme code
	1 line
	2 line
[/code] [list] - list:
possible options: 1, a, A, i, I
[list] unordered; 
[list=1] numerated; 
[list=A] alphabetically ordered A-Z

Example:
[list=1]
[*] first line;
[*] second line;
[/list] Tag [hr] - horizontal separation line

Example: 
Paragraph 1
[hr]
Paragraph 2 [url] - hyperlink

Examples:
[url]www.ncbi.nlm.nih.gov[/url]
[url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/]NCBI[/url] [email] - link to the e-mail address

Example: [email]masha@mail.ru[/email] Tag [img] - image
[img] - in the line;
[imgL] - align left; 
[imgR] - align right.

Example:
[img]http://molbiol.ru/izo/rl.gif[/img] [ru] - for russian members only

Example:
[ru]only members using russian interface would read this sentence[/ru] [en] - for english-speaking members only

Example:
[en]only members using english interface would read this sentence[/en] [self] - only you yourself and site administartion would see the text

Example:
[self]nobody but you would see this sentence[/self]
[left] - align left

Example: [left]left aligned text[/left] [center] - center

Example: [center]center aligned text[/center] [right] - align right

Example: [right]right aligned text[/right] [just] - align

Example: [just]aligned text[/just]

     post length / max. size in characters:  / 15360


Last 10 Posts [ In reverse order ]
23432432432432dd Posted 20.01.2024 15:44
  user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
ИНО Posted 07.09.2022 22:41
  Увы с картой при помощи Вашего кода ничего не вышло. Делал на новом рабочем пространстве. Прикрепляю фрагмент с матюками:

CODE

> plot(bb, cols=0)
Warning messages:
1: In plot.window(...) : "cols" is not a graphical parameter
2: In plot.xy(xy, type, ...) : "cols" is not a graphical parameter
3: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :
 "cols" is not a graphical parameter
4: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :
 "cols" is not a graphical parameter
5: In box(...) : "cols" is not a graphical parameter
6: In title(...) : "cols" is not a graphical parameter
> points(bb$x, bb$y, pch=1, col=cc[rr]) # next step: deal with legend
Error in bb$x : $ operator is invalid for atomic vectors


При том выдается не карта, а обычный скаттерплот с незакрашенными точками. Возможно играют роль версии ПО, в моем случае это R 3.3.1 и spatstat 1.46-1.

В то время как plot(сн_2017Pgppp) работает вполне корректно у меня, никаких error. И проблемы с кириллицей видел только в заголовках столбцов таблиц. Наверное, дело в операционке. Ну, уберите из названия объекта эти две незнакомые буржуям буквы, если мешают, это ж просто пример, мне б принцип понять.

С деревом можно никаких файлов не грузить, а обойтись простым синтетическим примером:

CODE
y<-c(rnorm(10, 0, 1), rnorm(10, 0, 100))
x<-factor(c(rep(1,10), rep(2,10)))
xy<-cbind(x, y)
ctree(y~x, data=xy)#ветвление дерева нет, так как проверяется разница в средних, а надо чтобы проверялась разница в дисперсиях (или любом другом параметре масштаба).

xy$z<-c(abs(y[1:10]-mean(y[1:10])), abs(y[1:20]-mean(y[1:20])))#модуль отклонений от среднего в каждой группе
ctree(z~x)#теперь различия уловлены правильно


Надо чтоб преобразование y в z проходило автоматически в зависимости от формулы, переданной ctree(). По идее для этого есть в ctree() аргумент ytrafo, но как его правильно задавать, я так и не понял.
plantago Posted 07.09.2022 07:21
 
(ИНО @ 06.09.2022 10:49)
Link to the original post  Как заставить ctree() из {party} работать не с положением (средними), а с масштабом (дисперсией) зависимой переменной? Насколько понял из руководства, для этой цели можно использовать трансформацию при помощи аргумента ytrafo, но как именно им пользоваться так и не уразумел. Что только не перепробовал и с готовыми ytrafo из {coin}, на которые дается ссылка в том же руководстве и с самопиской функцией, считающей абсолютное отклонение от среднего, - либо матерится разными матюками, либо молча считает различия в средних, точно так же как с настройками по умолчанию, будто бы никаких манипуляций с ytrafo и не было.


К сожалению, без конкретных примеров и ссылок не смог ничего понять.
plantago Posted 07.09.2022 07:20
 
(ИНО @ 06.09.2022 11:37)
Link to the original post  Прицепом еще один вопрос. Есть у меня точки на карте (файлы прилагаются):

CODE
library(spatstat)
load("сн_2017Pgppp.Rda")
load("сн_2017Pg_lL.Rda")
plot(сн_2017Pgppp)


Задача - залить их цветом в зависимости от значений сн_2017Pg_lL, и приделать сбоку цветовую шкалу в виде б. м. непрерывного градиента и подписями значений соответствующего показателя через равные интервалы.


CODE

library(spatstat)

load("сн_2017Pgppp.Rda")
load("сн_2017Pg_lL.Rda")

# plot(сн_2017Pgppp) # error!

aa <- (get(ls()[1])) # does not always work; if not, use rm(list=ls()) _before_ load()
bb <- (get(ls()[2])) # and please do not name R objects with anything except [A-z0-9_.]

rr <- rank(aa, ties.method="last")
cc <- terrain.colors(max(rr))

plot(bb, cols=0)
points(bb$x, bb$y, pch=1, col=cc[rr]) # next step: deal with legend


Про шкалу можно, наверное, посмотреть сюда https://stackoverflow.com/questions/1335517...-legend-in-base
ИНО Posted 06.09.2022 18:37
  Прицепом еще один вопрос. Есть у меня точки на карте (файлы прилагаются):

CODE
library(spatstat)
load("сн_2017Pgppp.Rda")
load("сн_2017Pg_lL.Rda")
plot(сн_2017Pgppp)


Задача - залить их цветом в зависимости от значений сн_2017Pg_lL, и приделать сбоку цветовую шкалу в виде б. м. непрерывного градиента и подписями значений соответствующего показателя через равные интервалы.
ИНО Posted 06.09.2022 17:49
  Как заставить ctree() из {party} работать не с положением (средними), а с масштабом (дисперсией) зависимой переменной? Насколько понял из руководства, для этой цели можно использовать трансформацию при помощи аргумента ytrafo, но как именно им пользоваться так и не уразумел. Что только не перепробовал и с готовыми ytrafo из {coin}, на которые дается ссылка в том же руководстве и с самопиской функцией, считающей абсолютное отклонение от среднего, - либо матерится разными матюками, либо молча считает различия в средних, точно так же как с настройками по умолчанию, будто бы никаких манипуляций с ytrafo и не было.
plantago Posted 27.11.2021 12:47
  Вот и замечательно, что Вы все сами нашли. Только paste0(...) -- без пробела между скобками и именем команды (это для красоты smile.gif и именно paste0() а не paste(), потому что второй без дополнительных аргументов вставляет пробел, в то время как Excel -- нет.
Алекс3212 Posted 26.11.2021 20:42
  Очень долгие ответы тут, если вдруг кому то нужно, то используйте
paste () , где в кавычках перечисляете столбцы которые надо присоединить
Алекс3212 Posted 26.11.2021 15:53
  Подскажите пожалуйста аналог в R , знака & с помощью которого я могу присоединить одну яцейку к другой. Пока что приходится умножать на н значение и складывать с другой ячейкой. Мож знает кто более легкий способ. Например
A B C
10 3 13
в R C <- ((A*100)+B)
в excel C= A&B
plantago Posted 08.03.2021 02:54
  https://www.google.com/search?q=R+package+daytime+length
Review the complete topic (launches new window)

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Helicon · Dia-m · InterLabService · Beckman Coulter · SkyGen · OPTEC · BIOCAD · Evrogen · Syntol · Bioline · Sartorius · Khimexpert · SibEnzyme · Tecan · Danies · NPP «TRIS» · Bialexa · FizLabPribor · Genotek · ATG Service Gene · Biogen-Analitika
Your forum  ·  editor@zbio.net  ·  Time is now: 19.03.24 13:33
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft