Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Gregory |
Сообщение было отредактировано Gregory - 16.05.2019 21:32 |
Carbon Copy Постоянный участник So close no matter how far |
|
TAMARA5 Участник |
(Gregory @ 16.05.2019 22:16) Нужен датасет содержащий сиквенс транскриптов ITS1 и ITS2. Насколько я знаю при whole genome transcriptome analysis короткие РНК отбрасываются. А когда смотрят короткие - выбирают избирательно, определенной длины. А нужно чтобы присутствовали транскрипты ITSов на разных стадиях процессинга рРНК. рРНК, как таковая, не является в данном случае предметом интереса. Существует ли такой датасет в природе? вроде это метагеномика по грибам на MiSeq 2x300 bp скорее всего генбанк по грибам |
TAMARA5 Участник |
(Carbon Copy @ 16.05.2019 23:47) Не извольте беспокоиться, Ваше Сиятельство! Щас ведущие иксперды Молбиола подкатят Вам свежайший датасет! Даже если его не существует в природе, животы положат, но датасет добудут для Вашей Светлости! И транскрипты и сплайс варианты достанут, лишь бы угодить! И короткие и длинные - какие Вашей душеньке угодно! шахтер свали с ветки |
TAMARA5 Участник |
(Gregory @ 16.05.2019 22:16) Нужен датасет содержащий сиквенс транскриптов ITS1 и ITS2. Насколько я знаю при whole genome transcriptome analysis короткие РНК отбрасываются. А когда смотрят короткие - выбирают избирательно, определенной длины. А нужно чтобы присутствовали транскрипты ITSов на разных стадиях процессинга рРНК. рРНК, как таковая, не является в данном случае предметом интереса. Существует ли такой датасет в природе? генбанк геномы грибов |
TAMARA5 Участник |
(TAMARA5 @ 18.05.2019 23:08) опознаных и сиквинированых |
TAMARA5 Участник |
(Gregory @ 16.05.2019 22:16) Нужен датасет содержащий сиквенс транскриптов ITS1 и ITS2. Насколько я знаю при whole genome transcriptome analysis короткие РНК отбрасываются. А когда смотрят короткие - выбирают избирательно, определенной длины. А нужно чтобы присутствовали транскрипты ITSов на разных стадиях процессинга рРНК. рРНК, как таковая, не является в данном случае предметом интереса. Существует ли такой датасет в природе? грегор погуглите посмотрите кто сечас отвечает за ITS 1 2 3 4 датабазы |
TAMARA5 Участник |
(Gregory @ 16.05.2019 22:16) Нужен датасет содержащий сиквенс транскриптов ITS1 и ITS2. Насколько я знаю при whole genome transcriptome analysis короткие РНК отбрасываются. А когда смотрят короткие - выбирают избирательно, определенной длины. А нужно чтобы присутствовали транскрипты ITSов на разных стадиях процессинга рРНК. рРНК, как таковая, не является в данном случае предметом интереса. Существует ли такой датасет в природе? грегор я кабы больше по геному человека шампинионы и трюфеля меня не очень волнуют |
thomaslist Участник |
|
thomaslist Участник |
|
garryy Постоянный участник |
|
garryy Постоянный участник |
|
garryy Постоянный участник |
|
garryy Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |