Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Fritz Постоянный участник Москва |
|
zelensky Постоянный участник Ukraine - Israel - Canada -> ??? |
|
Fritz Постоянный участник Москва |
|
zelensky Постоянный участник Ukraine - Israel - Canada -> ??? |
http://nar.oupjournals.org/cgi/content/full/29/1/1 Наиболее распространенные программы для стат. обр-ки данных - Statistica, Jump, Statgraphics, CoStat; кроме того, существует огромное кол-во узкоспециализированных программ, в частности, бесплатных (см. ниже) http://members.aol.com/johnp71/javasta2.html, но, не зная ваших конкретных проблем - рекомендовать что-либо конкретно не берусь. |
win Постоянный участник RU |
Проблема мучает, в общем, таже. Мне кажется, проще ее сформулировать с помощью примеров: итак, для упражнений с последовательности - что-то типа Jellyfish or Vector, а для красоты и наглядности в работе с плазмидами - Visual Cloning. Спасибо. |
tamm Постоянный участник |
TotalLab,но он не бесплатный.Где (а может быть и как) можно ска- чать что-нибудь хорошее на эту тему? Прошу прощения за бесцеремонное вторжение и заранее благодарен за помощь. tamm |
Olezhek Постоянный участник Tsukuba, Japan/КФУ, РФ |
Мне очень приглянулась эта Jellyfish, подскажите, пожалуйста, ка кее получить, хм, в более долгосрочное пользование... а не только на 30 дней? Как я понял, там ежегодно обновлять нужно подписку???? А можно как-нибудь разом эту програмку заполучить? Подскажите новичку! |
tamm Постоянный участник |
tamm |
Olezhek Постоянный участник Tsukuba, Japan/КФУ, РФ |
Извините, я не очень понял вопрос. Программа JellyFish действительно очень удобна, но ее использование ограничено сетевым паролем, который валиден только 30 дней. Чтобы продолжить использование нужно подписаться на год на том самом сайте, как я понял, за 450 долларов, и типа ежегодно обновлять подписку... Это дорого, а мне бы хотелось иметь эту прогрмку у себя.. вот я и спросил. Скорее вопрос к win, так как он порекоммендовал эту програмку.. в чем ирония или юмор? |
zelensky Постоянный участник Ukraine - Israel - Canada -> ??? |
Увы, я сейчас занимаюсь повышением квалификации, так сказать, на дому, а именно - сижу без работы и стараюсь быть в курсе. Но все же теория от практики отстает. Иными словами - ничего конкретного я вам, к моему огорчению, посоветовать не могу, разве что - в недалеком будущем - надеюсь - недалеком - я все же найду работу и тогда смогу учавствовать в форуме более предметно... |
tamm Постоянный участник |
вел меня на мысль,об ироничном восприятии моих вопросов и чрезмерности моих желаний.Увы, сам я,видимо, свою веселость где- то утерял. С ув. tamm. PS а юмор получается в том что я старый дурак. PPS где бы,все-таки,стырить soft для анализа 1Dгелей. |
Olezhek Постоянный участник Tsukuba, Japan/КФУ, РФ |
|
Silnikov |
Вопрос не совсем по теме, но может кто-нибудь подскажет... Получил от своих зарубежных партнеров структуры в виде файлов с расшерением "DB". Мой комп их не воспринимает. Попытался выяснить, какой программой пользовались мои партнеры, но для них, похоже, просто не существует вопроса. Может кто подскажет, что это за программа такая и, в идеале, где ее взять? |
SergeyR Участник |
Попробуйте ONEdscan, лежит здесь http://rpe.fibkh.serpukhov.su/link/soft000.htm Не очень удобная, но других бесплатных не знаю. |
stask Постоянный участник Грозный - Москва - Stony Brook - ... |
Касаемо обсчета гелей: есть еще ScionImage. Насколько сия прога хороша, не знаю, сам пользовался мало и давно. Если надо, могу переслать. |
kglebov Постоянный участник Германия Гёттинген |
Замечательная программа TotalLab от Phoretix. Пишите им, что хотите получить Demo, и они Вам ее присылают по почте с кучей красивых и возможно нужных бумажек. Хоть программа и демо, но можно соверженно просто и без всяких crack'ов и т.д. анализировать гели. Их просто надо сканировтаь не самой программой а фотошопом в tiff файл и все. На само деле очень полезная и удобная программа. Может анализировтаь разные гели считать колонии на чашках Петри, выводит графики плотности и может расчитать колово исслежуемого вещества в бэнде..... Очень рекомендую. |
Murat Постоянный участник RU |
для работы с 1D-гелями я сам использовал разные версии Phoretix 1D, но это - за бугром, где ее купили за немалые деньги. Оч. приятная программа, может практич. все, включая составление базы данных. Но... у нее защита на уровне "железа" . Т.е. в комплект поставки входит переходник, втыкающийся в порт принтера, без которого программа не грузится. Я попробую спросить у коллег, может можно эту сложность обойти. Я дома мы пользуемся SigmaGel от Jandel Scentific. На эту же прогу в "крэкнутом" виде я буквально на днях наткнулся где-то в И-нете (набираете в Яндексе или Гугле "SigmaGel" и...). Если не получится и/или "не горит", то в начале апреля гляну дома и могу попробовать переслать нашу "крэкнутую" версию. Удачи! |
tamm Постоянный участник |
человек.Рад знакомству,хоть и заочному. tamm |
tamm Постоянный участник |
tamm |
tamm Постоянный участник |
tamm |
wistar |
По поводу софта для 1D гелей... Есть старые проги от Scanalitics Software (OneDScan оттуда). По моему - самые хорошие, так как позволяют "мануальное корректирование" обнаруженных пиков. Правда они не бесплатные, как утверждает уважаемый SergeyR,и изначально очень хотели присутствия железного ключа на LPT порте . SigmaGel, TotalLab и приблуды от биорада - хуже (более удобные за счет автоматизации, но менее точные за счет геморойности или невозможности ручной коррекции). Из них - TotalLab, пожалуй, самая продвинутая (сужу только по деме - в свое время получил, но ето даже не программа была, а фильм). По поводу софта действительно можно залезть на http://rpe.fibkh.serpukhov.su/link/soft000.htm и пошуршать там. Правда канал узкий и докачки нет -так что удачи. |
K-2 Постоянный участник |
|
wistar |
А у тебя есть что ломать? |
Der-ro Участник |
Удачи. |
DVKup Постоянный участник Москва, Россия |
|
DVKup Постоянный участник Москва, Россия |
Программку я готов выложить (4.8 МБ), если есть интерес. А если кто-то понимает в устройстве TIF файлов и сможет разобраться, как ей "скармливать" внешние данные - будет просто прекрасно. |
|
Но, к сожалению, простым копированием ее не перепишешь, я уже пыталась из "компьютерной" себе не комп поставить для удобства - она выдает ошибку и закрывается. |
DVKup Постоянный участник Москва, Россия |
|
Igork |
|
zelensky Постоянный участник Ukraine - Israel - Canada -> ??? |
http://www.bio.com/store/store_software.jhtml |
tamm Постоянный участник |
(насчет Image Quant).Особенно приятно будет,если Вы дадите минимальные инструкции - как это делается(я,например ничего еще не скачивал на форуме).Заранее благодарен. tamm PS Насчет tif-файлов ,действительно хотелось бы хоть немного подробнее,если возможно,конечно.Успехами поделюсь. |
|
Позвольте поделиться опытом работы с некоторыми программами: TotalLab demo-версия будет работать и после 60 дней, так долго, как вы захотите, только будет вас пугать "страшными" предупреждениями. Если вы еще не обновили JellyFish 1.1 1.2 1.4 или 1.5 до коммерческой версии 2.* , то и не делайте этого. Эти версии будут работать у вас без ограничений. Если же вы обновили свою версию, то делать нечего. Вообще, в инете очень много программ для работы с 1D гелями (да и с 2D тоже). Вопрос. В нашем учреждении мы много работаем с геномными фингерпринтами. Нам нужна программа для сравнения фингерпринтов на разных гелях. Я ищу ее более 7 лет и должен сказать, что единственный приемлемый вариант - GelCompar (теперь Bionumerics), но цена заоблачная 16000 USD, и даже в максимально усеченном варианте около 5000 USD. Интересно, что за 10 лет в мире, как мне кажется, никто (3 другие аналогичные программы, которые я знаю, не сопоставимы по качеству) не создал ничего подобного. Мне приходидось много работать с этой программой, она, действительно супер. Но что нам делать? Может кто-нибудь подскажет достойную альтернативу? |
|
<blockquote><font size="1" face="Verdana, Helvetica, sans-serif">цитата: Автор - Silnikov: Коллеги! Вопрос не совсем по теме, но может кто-нибудь подскажет... Получил от своих зарубежных партнеров структуры в виде файлов с расшерением "DB". Мой комп их не воспринимает. Попытался выяснить, какой программой пользовались мои партнеры, но для них, похоже, просто не существует вопроса. Может кто подскажет, что это за программа такая и, в идеале, где ее взять? </blockquote> |
iugarov |
Автор - Silnikov: Коллеги! Вопрос не совсем по теме, но может кто-нибудь подскажет... Получил от своих зарубежных партнеров структуры в виде файлов с расшерением "DB". Мой комп их не воспринимает. Попытался выяснить, какой программой пользовались мои партнеры, но для них, похоже, просто не существует вопроса. Может кто подскажет, что это за программа такая и, в идеале, где ее взять? </blockquote> Попробуйте Microsoft Visual FoxPro 6.0 Преобразует в формат .xls |
pol-ar |
|
pol-ar |
|
gibsongilbert |
|
« Предыдущая тема · Софт · Следующая тема » |