Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Транскрипционные факторы по последовательности ДНК? -- промотер человеческий --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! gostya
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.06.2012 05:15     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Как определить какие транскрипционные факторы связываются с определенным промотером? Можно ли это точно определить программами или надо все равно потом какой-нибудь Chip делать? Какие есть хорошие бесплатные программы? Спасибо!
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  24.06.2012 15:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=509394

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): petr, gostya
Участник оффлайн! petr
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.06.2012 03:29     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

(gostya @ 24.06.2012 03:15)
Ссылка на исходное сообщение  Можно ли это точно определить программами или надо все равно потом какой-нибудь Chip делать?

Да, есть хорошие проги. Только какой нибудь ChIP или GelShift потом все равно придется делать, т.к. проги выдают данные только для первоначальной пристрелки.
Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 25.06.2012 10:09     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(gostya @ 24.06.2012 05:15)
Ссылка на исходное сообщение  Как определить какие транскрипционные факторы связываются с определенным промотером? Можно ли это точно определить программами или надо все равно потом какой-нибудь Чип делать? Какие есть хорошие бесплатные программы? Спасибо!


ну и какой трансфак тут на промоторе ?
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?hg...&knownGene=pack
Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 25.06.2012 10:11     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(petr @ 25.06.2012 03:29)
Ссылка на исходное сообщение  Да, есть хорошие проги. Только какой нибудь ЧИП или ГелШифт потом все равно придется делать, т.к. проги выдают данные только для первоначальной пристрелки.

гелшифт - ин витро
Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 25.06.2012 10:17     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

(petr @ 25.06.2012 03:29)
Ссылка на исходное сообщение  Да, есть хорошие проги. Только какой нибудь ChIP или GelShift потом все равно придется делать, т.к. проги выдают данные только для первоначальной пристрелки.

http://www.plosgenetics.org/article/info%3...al.pgen.1002610
Участник оффлайн! petr
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.06.2012 21:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

(Guest @ 25.06.2012 08:11)
Ссылка на исходное сообщение  гелшифт - ин витро

Кто-ж спорит? это конечно скорее к самому трансфаку относится, чем к промотору smile.gif
Однако тоже не помешает. Меня как-то ревьюеры заставили кроме чипа Gelshift^ом показать связывание.

Сообщение было отредактировано petr - 25.06.2012 21:49
Участник оффлайн! gostya
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.06.2012 22:01     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

а какая программа самая простая, у меня это побочный проект, мне некогда программы изучать, мне надо заслать последовательность и получить список транскрипционных факторов и их участки связывания, ну и желательно вероятность этого события

еще раз большое спасибо!
Участник оффлайн! nbarlev




 прочитанное сообщение 26.06.2012 19:27     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

попробуйте consite. http://asp.ii.uib.no:8090/cgi-bin/CONSITE/consiteТупая программа, но для начала сойдет.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): gostya
Участник оффлайн! gostya
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 27.06.2012 18:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

отличная программа, это нормально что она находит около 200 сайтов на ~5000 bp?
Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 28.06.2012 07:53     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

(petr @ 25.06.2012 21:48)
Ссылка на исходное сообщение  Кто-ж спорит? это конечно скорее к самому трансфаку относится, чем к промотору smile.gif
Однако тоже не помешает. Меня как-то ревьюеры заставили кроме чипа Гелшифт^ом показать связывание.


а если Чип-Секом 25 000 байндинг сайтов - 25 000 гелшифтов ? smile.gif
Участник оффлайн! watchesbiz
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  09.12.2021 17:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

http://replicarolexwatches.simpsite.nl/
https://www.smore.com/rj7kh-best-replica-watches
https://www.athleticsnation.com/users/Replicarolexwatches
https://pastebin.pl/view/ab0e458a
https://mix.com/watcheshutukcom
https://www.woddal.com/post/359216_tiny-acc...nybody-039.html
https://share.naturalnews.com/posts/3904099
https://demo.wowonder.com/post/214429_the-i...-producers.html
https://rapichat.com/post/5369_our-purpose-...ible-there.html
https://dashburst.com/replicarolexwatches/1
https://sway.office.com/KifcQvn36MK821G8
https://flipboard.com/@replicarolex24
https://getpocket.com/redirect?url=https%3A...eshut.uk.com%2F
https://www.openstreetmap.org/user/Hints%20...20Rolex%20Watch

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 29.03.24 10:19
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft