Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
KCN Постоянный участник Київ. Україна понад усе! / DELETED |
Если челоек ушёл из НИИ, например на пенсию, но желаени что-то делать в науке осталось и есть 5-20 свободных часов чистого времени в неделю - можно ли проводить исследования и публиковаться, имея под рукой только компьютер? Я говорю о биоинформатике и теоретических методах в биологии. Ведь не секрет, что сырых данных накапливается в десятки раз больше, чем их успевают обработать. Давайте обсудим, что для этого нужно: 1. Темы исследований. 2. Компьютерная конфигурация и ОС, канал интернета. 2. Программы и онлайн-ресурсы. 3. Языки программирования. 4. Где можно публиковать работы (статьи, написанные по полученным данным). |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
А компьютер, который потянет современные рассчётные пакеты биоинформатики стоит весьма дорого. Канал связи и программы - дело совсем вторичное, равно как и языки программирования, которые для каждого программного пакета - свои. Там если что нужно, программисты всегда на подхвате и дописывают всё что просят. |
Nastja Постоянный участник Новосибирск |
На самом деле вопрос надуманный, если человек ушел на пенсию, то он и так знает, чем заниматься, и для успешной научной деятельности ему будет достаточно браузера и почтового клиента, программами пусть аспиранты занимаются. |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
|
Mike Shelk Участник Москва |
Сообщение было отредактировано Mike Shelk - 08.10.2011 23:21 |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
|
ihlindham Постоянный участник |
(NMR-guy @ 07.10.2011 18:14) (Mike Shelk @ 09.10.2011 00:21) (NMR-guy @ 09.10.2011 00:24) Большую часть моих идей можно было проверить лишь на очень мощных вычислительных "фермах", ждать месяцы результатов, равно как и ползти вперёд на предоставленных костылях по онлайн-интерфейсу БЛАСТа мне было не интересно... Так я так и не понял - на ноутбуке считать или на кластере нужно время заказывать ? Сообщение было отредактировано ihlindham - 17.01.2012 21:55 |
Mike Shelk Участник Москва |
(ihlindham @ 17.01.2012 22:54) Скажу так: если вы решаете стандартные задачи стандартными методами, как то: а)Собираете геномы de novo б)Делаете молдинамику больших систем на значительных промежутках времени в)Строите огромные филогенетические деревья и кое что ещё, то Вам не обойтись без мощного кластера. Если же Вы сами ставите новые задачи или придумываете новые методы, то Вам, в дополнение к мозгу, нужен лишь Core2Duo (на втором ядре во время вычислений можно фильмы смотреть) Почитайте крупнейшие биоинформатические журналы, например PLOS Computational Biology, BMC Bioinformatics, Oxford Journals Bioinformatics, и Вы найдёте там множество работ, которые требуют преимущественно аналитических и творческих способностей автора. Или, например, зайдите на сайт ребят Гельфанда, rtcb.iitp.ru, и посмотрите их статьи. Короче, всё зависит от Вас. В биоинформатике, при хорошем воображении, легко можно придумать тему, для которой хватит самого простого компьютера.
|
Сухова Наталья Участник |
Единственно что удивительно - уходя на пенсию вам некому было оставить работу или некому обсчитывать? Почему не подготовили смену? Или понабрали одних лаборантов или учителей математики и менталитет соответствующий, которым далеко до тяму? Если нормальная пенсия - можно просто сотрудничать, если проблема - можно подключиться на контрактной основе - так, подработать... и сохранить связи. |
Guest IP-штамп: frXuVLWc4rjiI гость |
(Nastja @ 07.10.2011 20:42) А у меня дома микроскоп, посоветуйте, что еще можно купить, чтобы заниматься экспериментальной биологией?
На самом деле вопрос надуманный, если человек ушел на пенсию, то он и так знает, чем заниматься, и для успешной научной деятельности ему будет достаточно браузера и почтового клиента, программами пусть аспиранты занимаются. |
Guest IP-штамп: frXuVLWc4rjiI гость |
(Nastja @ 07.10.2011 20:42) А у меня дома микроскоп, посоветуйте, что еще можно купить, чтобы заниматься экспериментальной биологией? На самом деле вопрос надуманный, если человек ушел на пенсию, то он и так знает, чем заниматься, и для успешной научной деятельности ему будет достаточно браузера и почтового клиента, программами пусть аспиранты занимаются. А у меня дома камера Горяева + стекла для нее полированные , еще времен СССР, покупал по 52 коп. 10=ток, в бумажку вощеную завернуты, предметные и покровные стекла, канадский бальзам сухой из Канады, меланжеры лейкоцитарные и эритроцитарные, автоматические пипетки Ленпипет, бинокулярная лупа МБС-9, и два биологических микроскопа. Еще есть термостата, и сухожаровой шкаф - на даче, хотел использоватьи их для копчения, А также 2 магнитные мешалки и три микротома - все Лейтц! А на даче стоит работоспособный FACS scan 5 центрифуг! Одна даже с охлаждением. А еще гениальные идеи - как разгадать проблемы иммунологической толерантности и иммунологической памяти. |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
Центрифуги вот зато в хозяйстве на даче очень полезны, если откручивать на них самодельное вино от жмыха и прочее, особенно не нарушая температурный режим брожения в погребе (+4), то есть крутя с охлаждением, можно ОЧЕНЬ неплохое вино гнать домашнее! |
Nastja Постоянный участник Новосибирск |
|
tac14 Участник |
(Nastja @ 07.10.2011 21:42) А у меня дома микроскоп, посоветуйте, что еще можно купить, чтобы заниматься экспериментальной биологией? Такая же история, купил было микроскоп, теперь стоит пылится ... набаловался вроде как посмотрел бактерии (хотя их плохо было видно точки небольшие), ну и так ребенку всякую мелочь показывал ... Вот и толку от него Единственно, понял что пока не будет денег на секвенатор - ничего суваться в экспериментальную биологию А биоинформатикой - да успешно занимаюсь "типа на пенсии" Сообщение было отредактировано tac14 - 22.07.2014 18:25 |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
|
Nastja Постоянный участник Новосибирск |
|
Guest IP-штамп: frJsuiia8dM6. гость |
(NMR-guy @ 23.07.2014 11:11) Их никогда не будет. Там расходники дороже самого прибора в пересчете на жизненный цикл. К тому же, если не знать что искать заранее, секвенатор - абсолютно бесполезный хлам. Как показывают куча противоречащих друг дружке исследований GWAS. Ооо батенька а ничего что большинство GWAS сделаны на SNP array + если анализировать умно (с учетом linkage disequilibrium, combinatorial SNPs и gene network propagation), то пересечение разумное есть? Наверное вы со своим NMR совсем себе мозги засветили
|
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
Вот каждые 2-3 года каждый такой гений со своими сверхценными идеями, всё более и более умными, своим очередным GWASом опровергает (до следующего гения, то есть на следующие 2-3 года) результаты предыдущих даунов и обезьян, которые все конечно никогда ни о чем подобном ("linkage disequilibrium, combinatorial SNPs и gene network propagation") не слышали, ибо КТО КРОМЕ ВАС может об этом толково рассказать то? >"Наверное вы со своим NMR совсем себе мозги засветили" Да, моё NMR оно такое было, да, забористое. Мозгов у меня правда никогда не было, лишь головной межушной ганглий... Вы мне льстите! |
Золотая рыбка |
(NMR-guy @ 07.10.2011 18:14) Ваши расчёты должны подтверждаться хотя бы in vitro, кем-то у кого есть возможность с Вами коллаборироваться и быть соавтором работ. Если до пенсии Ваши моделирования не подтверждались или не имеют каких-либо практических применений уже сейчас, то вероятность того, что Вы будете нужны как биоинформатик-фрилансер крайне мала. Таких очень много, и часть из них закрывает весьма небольшую необходимость практиков в таком моделировании. А компьютер, который потянет современные рассчётные пакеты биоинформатики стоит весьма дорого. Канал связи и программы - дело совсем вторичное, равно как и языки программирования, которые для каждого программного пакета - свои. Там если что нужно, программисты всегда на подхвате и дописывают всё что просят. Совсем не обязательно тратиться на дорогущий мощный компьютер, когда можно купить б/у. Конечно, тоже не за копейки, но гораздо дешевле, чем если бы покупать новый. Сама прошлой весной такой взяла, когда в Украине еще жили. Заказывала из Сообщение было отредактировано Золотая рыбка - 11.09.2017 10:04 |
Золотая рыбка |
(Золотая рыбка @ 11.09.2017 11:04) Совсем не обязательно тратиться на дорогущий мощный компьютер, когда можно купить б/у. Конечно, тоже не за копейки, но гораздо дешевле, чем если бы покупать новый. Сама прошлой весной такой взяла, когда в Украине еще жили. Заказывала из Главное, что у человека желание есть. А ресурсы найдутся всегда, я считаю. |
бутанол Постоянный участник Новосибирск |
ну и вообще .. матмоделирование инфекционных процессов или роста биопленок... вы нам только скажите как вам наиболее удобно чтобы мы опыты ставили для ваших моделей.. |
guest: great IP-штамп: frj5GEfdEWR5M гость |
|
guest: 123 IP-штамп: frJhOCvSv9ICE гость |
|
guest: 123 IP-штамп: fr4iy3.kHUw02 гость |
|
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема » |