Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Секвенатор ABI prism 3500
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! XXL
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.07.2013 16:20     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

У кого есть этот агрегат, недавно к нам приехал в заведение, что посоветуете при работе?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 03.08.2013 14:24     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Совет простой - обращаться за расходниками не в представительство ABI, а в Biagen (www.biagen.com).
Кое-то есть и в Синтоле:
http://www.syntol.ru/pricesekven.htm

Если, конечно, цена имеет значение

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): XXL, criplenie
Участник оффлайн! olegatorshik




 прочитанное сообщение 01.12.2013 08:44     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

(XXL @ 25.07.2013 17:20)
Ссылка на исходное сообщение  У кого есть этот агрегат, недавно к нам приехал в заведение, что посоветуете при работе?


Главный совет - сначала набирайте образцы для секвенирования, потом сразу все секвенируйте.
Особенность прибора - буферный раствор должен быть использован в течении 7 дней после начала работы.
Участник оффлайн! XXL
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.12.2013 22:36     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(olegatorshik @ 01.12.2013 09:44)
Ссылка на исходное сообщение  Главный совет - сначала набирайте образцы для секвенирования, потом сразу все секвенируйте.
Особенность прибора -  буферный раствор должен  быть использован в течении 7 дней после начала работы.



Уже столкнулись с этим... Нет никакой возможности обойти этот срок в 7 дней? какова стоимость буфера, кто пользовался им? как им вообще запасаться, в коробке 4 анодных и 4 катодных буфера, что на месяц всего, и срок годности ограничен

Сообщение было отредактировано XXL - 10.12.2013 22:39
Участник оффлайн! XXL
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 01.02.2014 06:30     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

У кого то на лабе есть ABI 3500? Как разводите смесь для цикл сиквенса? Поделитесь опытом, во сколько раз позволяет 5 X буфер удешивить процесс (предлагают набор для цикл сиквенса на 1000 реакций за 500 тыс, что то невероятное)?
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 03.02.2014 09:56     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

(XXL @ 01.02.2014 04:30)
Ссылка на исходное сообщение  У кого то на лабе есть ABI 3500? Как разводите смесь для цикл сиквенса? Поделитесь опытом, во сколько раз позволяет 5 X буфер удешивить процесс (предлагают набор для цикл сиквенса на 1000 реакций за 500 тыс, что то невероятное)?

Вам выйдет значительно дешевле, если не будете ставить повторных реакций для прочтения хренового сиквенса, получившегося после "удешевляющих" разведений.
Участник оффлайн! Teaholic




 прочитанное сообщение 11.05.2014 02:40     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

(XXL @ 01.02.2014 07:30)
Ссылка на исходное сообщение  У кого то на лабе есть ABI 3500? Как разводите смесь для цикл сиквенса? Поделитесь опытом, во сколько раз позволяет 5 X буфер удешивить процесс (предлагают набор для цикл сиквенса на 1000 реакций за 500 тыс, что то невероятное)?


Бигдая кладем 0,5 мкл на 10мкл реакцию. Буфер сами делаем. wink.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): XXL
Участник оффлайн! XXL
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 27.05.2014 21:34     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

рецептик буфера не напишите?
Участник оффлайн! haurhot

Москва



 прочитанное сообщение 16.07.2014 14:53     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

(XXL @ 10.12.2013 23:36)
Ссылка на исходное сообщение  Нет никакой возможности обойти этот срок в 7 дней?

Давно не секрет, что буферы можно гонять и месяц, скручивая дату постановки на прибор, но тем не менее они имеют ограничение по количеству запусков, которое пока обойти не удалось(да и смысла нет) поскльку такой байкот всплывает как раз неделе не 3-4, когда и совесть уже теребит, что пора бы.
Сиквенсную ставлю в 5мкл. из которых 1мкл-ПЦР-ка и 2мкл-BD3.1, остальное-праймер. Такой протокол следствие экономии сил на добавление 1кратного буфера и лени, но успешно работает.
Участник оффлайн! justcrocodile




 прочитанное сообщение 17.07.2014 15:31     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Я бы посоветовала прежде чем приступать к ответственной работе, посеквенировать что-нибудь неважное и подогнать под себя протоколы. Правильный протокол = 90% хорошего сиквенса.
Разведение буфера для секвенирования тоже индивидуально - если остаются dye blobs (лишняя краска), тогда разводите постепенно.
По поводу скрутки дат, несвежий буфер давал мне как-то плохие результаты. По-моему, не лучший способ экономить.
И ещё, не допускайте, чтобы в комнате было жарко. Прибор от этого просто фигеет.
Участник оффлайн! haurhot

Москва



 прочитанное сообщение 24.07.2014 15:38     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

(justcrocodile @ 17.07.2014 16:31)
Ссылка на исходное сообщение 
По поводу скрутки дат, несвежий буфер давал мне как-то плохие результаты. По-моему, не лучший способ экономить.
И ещё, не допускайте, чтобы в комнате было жарко. Прибор от этого просто фигеет.

Так в том и фокус, что буфер становиться несвежим только через несколько недель, так что 2-3 недели интенсивной работы на приборе успешно выдерживает. В том же 3130 буфер дохнет в разы быстрее.
На счёт жары можно подробнее. Не замечал, чтобы при +28,5 цельсия в помещении он начинал фигеть.
Участник оффлайн! afanasev-max
Постоянный участник
Irkutsk-Moscow-Irkutsk



 прочитанное сообщение 24.07.2014 16:30     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

Прибору норм, а вот полимер сдыхает на порядок быстрее: кристаллизуется, падает его разделяющая способность. Буферы испаряются активно
Участник оффлайн! haurhot

Москва



 прочитанное сообщение 24.07.2014 16:38     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

(afanasev-max @ 24.07.2014 17:30)
Ссылка на исходное сообщение  Прибору норм, а вот полимер сдыхает на порядок быстрее: кристаллизуется, падает его разделяющая способность. Буферы испаряются активно

С деградацией полимера как раз основная засада и есть. Буфер анодный хоть и сильно испаряется, но успешно доливается по мере надобности водичкой, катодный же почти не испаряется.
Участник оффлайн! XXL
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.07.2014 23:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

(haurhot @ 16.07.2014 15:53)
Ссылка на исходное сообщение  Давно не секрет, что буферы можно гонять и месяц, скручивая дату постановки на прибор, но тем не менее они имеют ограничение по количеству запусков, которое пока обойти не удалось(да и смысла нет) поскльку такой байкот всплывает как раз неделе не 3-4, когда и совесть уже теребит, что пора бы.
Сиквенсную ставлю в 5мкл. из которых 1мкл-ПЦР-ка и 2мкл-BD3.1, остальное-праймер. Такой протокол следствие экономии сил на добавление 1кратного буфера и лени, но успешно работает.


Наш комп позволил открутить дату тока однократно, потом делать этого не удаётся. Т.о. ставим буфера, работаем неделю, откручиваем ещё на неделю. Пользоваться просроченной химией позволяет патч, но буфера тока на пару недель и всё....Ваш позволяет крутить назад по нескольку раз с одними и теми же буферами?
Сколько вы максимум держали полимер в секвенаторе без инжекций?
Расскажите как вы обслуживаете прибор при длительном простое.
Ещё вопрос - кто нибудь использует повторно септы, плашки? Как моете?
На сколько вам хватает капиллярного блока?

Сообщение было отредактировано XXL - 25.07.2014 23:27
Участник оффлайн! haurhot

Москва



 прочитанное сообщение 28.07.2014 11:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

У нас время можно открутить на сколько угодно: например сегодняшним числом ставим буферы и дата запоминается, далее вырубаем диспетчером прогу и даемон, скручиваем дату хоть до 01.01.1980 и включаем прогу обратно. В результате время стояния на приборе уйдёт в минус smile.gif Хотя стараюсь менять буферы одновременно, но анодного тратится больше.
Думаю, недели 3 полимер стоит. При средней интенсивности расхода на полплашки в день выходит 2 недели может стоять.
Септы можно мыть, хотя если не мыть то тоже самое. Таким образом они почти бесконечноразовые если плашку анализировать сразу(при чистке сиквенсной XTerminator-ом он за ночь может испариться и лунка закаменеет).
Капилляры до 400 запусков выдерживают успешно, только менять по сравнению с 3130 хлопотнее.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): XXL
Участник оффлайн! XXL
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.07.2014 15:10     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

(haurhot @ 28.07.2014 12:23)
Ссылка на исходное сообщение  У нас время можно открутить на сколько угодно: например сегодняшним числом ставим буферы и дата запоминается, далее вырубаем диспетчером прогу и даемон, скручиваем дату хоть до 01.01.1980 и включаем прогу обратно. В результате время стояния на приборе уйдёт в минус smile.gif Хотя стараюсь менять буферы одновременно, но анодного тратится больше.
Думаю,  недели 3 полимер стоит. При средней интенсивности расхода на полплашки в день выходит 2 недели может стоять.
Септы можно мыть, хотя если не мыть то тоже самое. Таким образом они почти бесконечноразовые если плашку анализировать сразу(при чистке сиквенсной XTerminator-ом он за ночь может испариться и лунка закаменеет).
Капилляры до 400 запусков выдерживают успешно, только менять по сравнению с 3130 хлопотнее.


Спасибо, а можно подробнее про плашки, что за процессы в них происходят, что значит "каменеет". Потом можно образец новый заливать поверх старого? Мы пока доделываем первую, в промежутках между сиквенсами держим в морозилке.
Участник оффлайн! haurhot

Москва



 прочитанное сообщение 28.07.2014 16:24     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

(XXL @ 28.07.2014 16:10)
Ссылка на исходное сообщение  Спасибо, а можно подробнее про плашки, что за процессы в них происходят, что значит "каменеет". Потом можно образец новый заливать поверх старого? Мы пока доделываем первую, в промежутках между сиквенсами держим в морозилке.

В принципе всё можно наверное отмыть. В 90-е даже специальный бурбулятор придумали для промывания одноразовых носиков дозаторов.
"Каменеет"-просто смесь сам-буфера Eterminator-а и сиквенсной превращается в некоторых лунках в ватообразную сухую субстанцию. Поскольку в сиквенаторе не прохладно, то в нём плашку лучше не хранить во избежание(соответственно надо как минимум лично контролировать удачность префореза). Для очистки спиртом такой проблемы нет. Там просто формамид потихоньку испаряется. В холодильнике же очищенная Eterminator-ом сиквенсная хранится успешно и более недели.
Залить заново поверх старого не имеет смысла поскольку протокол очистки подразумевает наличие очищенного супернатанта над шариками ещё на одну попытку.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): XXL
Участник оффлайн! watchesbiz
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  22.06.2021 12:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

https://wanelo.co/replicarolexwatches
https://musescore.com/fakerolexwatches
https://www.racked.com/users/Replicarolexwatches
https://sketchfab.com/Rolexrelicawatches
http://www.video-bookmark.com/bookmark/433...eplica-watches/
https://www.slideserve.com/ReplicawatchesUK...pt-presentation
https://www.theverge.com/users/Replicarolexwatches
https://www.yumpu.com/en/document/read/6532...lica-watches-uk
https://online.flippingbook.com/view/152275247/
https://www.instapaper.com/p/8767342
https://www.bigblueview.com/users/Replicarolexwatches
https://weheartit.com/watcheshutuk
https://sites.google.com/view/replicarolexwatches24/home
https://www.indiehackers.com/post/hints-on-...atch-113aef73a9
http://replicawatchesuk.esportsify.com/for...ica-rolex-watch
Участник оффлайн! Чистюля




 прочитанное сообщение 16.09.2022 16:26     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

Как 100 мкМол превратить в 3,2пикоМол?
Я сначала разводила по инструкции до 100 мкМол (добавила воды). А потом взяла 3,2 до 100 довела водой. Засада в том, как понять, что у меня 3,2 пикомоля масса.
Считала-считала, надоело. Зная мол массу, все сходится, но вроде бы. Нанодроп показал похожие нг/мкл.
Поделитесь формулами или источниками.
Участник оффлайн! Ufa1688
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  23.09.2022 14:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

I think the concern ufabet เข้า สู่ระบบ is about those being ufa1688auto taken from the White House absent ทางเข้าufa1688 some way of declassifying ufa1688 them or the fact that ราคาบอล there were classified documents สล็อตออนไลน์ removed without sort UFA1688 of the appropriate safeguards, ลิงค์รับทรัพย์the South Dakota Republican continued, แฮนดิแคป adding, I think that is what the บอลสเต็บ Justice Department is getting at.
Участник оффлайн! Ufa1688
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  23.09.2022 14:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

I think the concern ufabet เข้า สู่ระบบ is about those being ufa1688auto taken from the White House absent ทางเข้าufa1688 some way of declassifying ufa1688 them or the fact that ราคาบอล there were classified documents สล็อตออนไลน์ removed without sort UFA1688 of the appropriate safeguards, ลิงค์รับทรัพย์the South Dakota Republican continued, แฮนดิแคป adding, I think that is what the บอลสเต็บ Justice Department is getting at.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Организация работы группы/лаборатории · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.04.24 10:45
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft