Herba · Конференции · Альгология · Фото растений · Изображения растений · Миксомицеты Иконотека · Живые растения · Биокартинки · Образцы гербария · Материалы А.Шипунова Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
plantago moderator |
Для начала: Cистематика и эволюция протистов и растений 1) Вышла работа по систематике клеверов ( 2) Вышла работа по систематике гвоздичных ( 3) Mark Simmons наконец переработал дерево бересклетоцветных ( 3) Наконец, переописали загадочную Mastigamoeba invertens (ее надо называть теперь Breviata anathema, 4) Прибыло якобид (весьма специфические свободноживущие родственники лямблии, интересные тем, что где-то рядом может быть корень эукариот) --- В этих номерах есть и еще много интересного.
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 04.04.2006 14:17 |
plantago moderator |
1) Вышла статья по систематике ситниковых ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...31.2006.00095.x ). Juncus никак не удается сделать монофилетическим, придется, видимо, делить этот обычный в нашей флоре род. 2) Еще один ископаемый зверь как следует посеквенирован ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...5ba901102121e58 ). Вымерший гигантский олень ближе всего к ланям (Dama). 3) Опубликовано подробное описание нового вида недавно описанного типа Cycliophora --- Symbion americanus ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...9058c05584ac885 ) 4) Сиквенсы 28S и 18S РНК подтверждают монофилетичность странной группы Platyzoa и говорят за полифилию лофофороносных беспозвоночных ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...0f36f7c0d135f1d ) 5) Статья про молекулярную систематику пшениц и эгилопсов еще раз подтверждает происхождение твердых пшениц путем комбинации двух геномов (!) и предлагает несколько рецептов, как с этим быть систематикам ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...6e0c37de191d2bc ) 6) Питерские протозоологи выложили на своем сайте текст книги про трихоплакса ( http://now.ifmo.ru/publications/trichoplax...hoplax_text.pdf ). 7) Кавалье-Смит после годичного "молчания" снова взялся за переработку системы протистов, на этот раз "царства" Chromista ( http://www.springerlink.com/link.asp?id=t5w324231345611g )
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 06.04.2006 01:38 |
plantago moderator |
Две интересные публикации: 1) Зоологи из ДВНЦ нашли нового представителя загадочной группы Rhinogradentia --- Dendronasus (см. статью в прикрепленном файле) 2) Хороший обзор по проблеме происхождения эукариот опубликован в Nature ( http://www.nature.com/nature/journal/v440/...ature04546.html ). Файл/ы:
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 07.04.2006 13:09 |
Redactor admin. Берлин, Германия |
это вполне подходящий материал для колонки новостей. Единственное: * я добавил в сообщения заголовки (если все сообщения в этой теме будут с таким заголовком, то можно ввести единый "комментарий к теме"); * отодвинул ссылки от скобок, иначе программа не узнаёт их как ссылки. Первое сообщения я уже вынес в колонку новостей, остальные желательно подбрасывать через какие-то промежутки, а потом выносить сразу после написания (Вы сами можете это делать -- кликните по значку с буквой "i", а дальше просто). |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
А сейчас действительно в таксономии есть такое понятие "протисты"? Я так понимаю, что это очень и очень полифилетическая группа: все эукариоты, кроме животных, растений, грибов и лишайников. |
plantago moderator |
(Redactor @ 04.04.2006 11:23) To plantago: это вполне подходящий материал для колонки новостей... остальные желательно подбрасывать через какие-то промежутки, а потом выносить сразу после написания Спасибо! Я так и буду делать. |
plantago moderator |
(daniil_naumoff @ 04.04.2006 13:26) to plantago, А сейчас действительно в таксономии есть такое понятие "протисты"? Я так понимаю, что это очень и очень полифилетическая группа: все эукариоты, кроме животных, растений, грибов и лишайников. Понятие есть, но скорее организационное (конгрессы. журналы, общества по протистам). Мегасистематики принимают протистов как царство редко. Можно определить протистов как "эукариот без тканей". Тогда грибы (и лихенизированные аскомицеты) --- протисты. |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
(plantago @ 05.04.2006 08:40) Понятие есть, но скорее организационное (конгрессы. журналы, общества по протистам). Мегасистематики принимают протистов как царство редко. Можно определить протистов как "эукариот без тканей". Тогда грибы (и лихенизированные аскомицеты) --- протисты. А что с водорослями? К протистам относят все одноклеточные и колониальные формы??? а может быть многоклеточные тоже? |
plantago moderator |
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
Неужели в протистных журналах есть публикации, например, по дрожжам? |
plantago moderator |
Helicosporidium: Fungi -> Chlorophyta Ellobiopsida: Fungi -> Dinophlagellata Amoebidium, Eccrinales: Fungi -> Mezomycetozoa Hyaloraphidium: Chlorophyta -> Fungi Microsporidia: "Protozoa" -> Fungi Nephridiophaga: Haplosporidia -> Fungi Pneumocystis: "Protozoa" -> Fungi и т.п. И публикаций немало. Вот (просто для примера): IJSEM: http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abs...ourcetype=HWCIT JEM: http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1....2004.tb00394.x В Protist и EJP меньше, это да.
|
plantago moderator |
1) Находка переходной формы между Panderichthys и Ichthyostega --- ископаемой четвероногой рыбы Tiktaalik ( http://www.nature.com/nature/journal/v440/...ature04639.html , http://www.nature.com/nature/journal/v440/...ature04637.html ) проливает новый свет на эволюцию конечностей позвоночных. 2) Классификация миозинов ( http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/103/10/3681 ) поддерживает таксон альвеолят (Alveolata, класс XIV) и еще более широкий таксон хромальвеолят (Chromalveolata, классы XXII--XXIV, в пику мнению T. Cavalier-Smith о "царстве" Chromista). 3) Andreas Schmidt-Rhaesa ответил ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...1c75679dd960a76 ) на критику Pilato et al., 2005 ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...6825d4369d19265 ) по поводу существования Ecdysozoa. 4) "Что такое популяция?" --- обзор R.S.Waples & O.Gaggiotti, который может быть многим полезен ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...4X.2006.02890.x ) 5) Jenny Xiang с соавторами опубликовала ( http://www.ingentaconnect.com/content/iapt...000001/art00006 ) обзор систематики рода Cornus (Кизил). Она категорически отказывается выделять из него роды Chamaepericlymenum, Cynoxylon, Swida etc., что приятно. 6) Опубликована новая система красных водорослей ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...17.2006.00210.x ). Авторы выделяют 7 классов (5 из них --- бывшие бангиевые), IMHO, многовато. 7) Хочу обратить внимание молекулярных биологов на совершенно сумасшедшую (но не лишенную, как мне кажется, оснований) гипотезу происхождения загадочной группы Dicyemida (паразиты осьминогов): в результате LGT между протистами (инфузориями?) и моллюсками ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...969824219aaa382 )!
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 09.04.2006 10:48 |
Indrekis IP-штамп: fr04Qan1zmBhk гость |
|
mlog moderator |
(Indrekis @ 09.04.2006 23:50) Скажите пожалуйста, "Зоологи из ДВНЦ нашли нового представителя загадочной группы Rhinogradentia --- Dendronasus" (kashkina2004.zip) - это такой прикол, или я чего-то недопонял? Это не больший прикол, чем вот это: Molecular phylogenetic analyses indicate extensive morphological convergence between the ‘‘yeti’’ and primates (см. прикрепленный файл) Файл/ы:
|
Indrekis IP-штамп: fr04Qan1zmBhk гость |
(Indrekis @ 09.04.2006 23:50) Скажите пожалуйста, "Зоологи из ДВНЦ нашли нового представителя загадочной группы Rhinogradentia --- Dendronasus" (kashkina2004.zip) - это такой прикол, или я чего-то недопонял? Собственно говоря, мена заинтересовало, действительно ли эта "работа" была опубликована в "Биология моря", и существует ли, раз уж такие дела, такой журнал. |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
|
mlog moderator |
(Indrekis @ 11.04.2006 00:45) Собственно говоря, мена заинтересовало, действительно ли эта "работа" была опубликована в "Биология моря", и существует ли, раз уж такие дела, такой журнал. Журнал точно есть. Есть ли статья, не знаю точно, но думаю, что на первое апреля --- почему бы и нет? Опубликовал же такой солидный журнал, как Mol. Phylogenet. Evol., статью про йети. |
plantago moderator |
2 daniil_naumoff: Это протисты ;-)) Ближе всего они стоят к различным бесцветным разножгутиковым (так называемым Bicosoecida). Посмотрите статью Cavalier-Smith из поста 2, там про это много. |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
(plantago @ 13.04.2006 09:48) 2 daniil_naumoff: Это протисты ;-)) Ближе всего они стоят к различным бесцветным разножгутиковым (так называемым Bicosoecida). Посмотрите статью Cavalier-Smith из поста 2, там про это много. Так когда я в своём CV пишу, что занимался Phytophthora infestans, то её не стоит именовать грибом? Или это не на столько принципиально. Я собственно об этом: статья. |
plantago moderator |
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
|
Juglans Постоянный участник |
Поэтомы оомицеты - это грибы! |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
(Juglans @ 14.04.2006 13:47) В самом слове "оомицеты" заложен корень, который присоединяют к грибам (аскомицеты и т.д.). Поэтомы оомицеты - это грибы! Может тогда и актиномицеты - грибы??? |
plantago moderator |
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
(plantago @ 14.04.2006 23:28) Тут и вправду есть некоторая хитрость: таксон "грибы" --- это совсем не все организмы, ссособные к мицелиальному росту. Как впрочем и наоборот: не все грибы обязаны иметь способность к мицелиальному росту. |
Juglans Постоянный участник |
начнем с того, что называются они сейчас актинобактериями plantago Вы путаете ТАКСОН "грибы" с понятием "грибы" - они не тождественны |
plantago moderator |
(Juglans @ 04.05.2006 23:08) plantago Вы путаете ТАКСОН "грибы" с понятием "грибы" - они не тождественны Нет, я как раз не путаю. Грибы, скорее, не таксон, а жизненная форма. Вокруг систематики пасется множество "мелких" классификаций, в том числе классификация органов (мерономия по Мейену), и вот жизненных форм тоже. В точках соприкосновения между ними рождаются проблемы -- конвергенция, несоответствия систем и пр. (вот и я в предыдущем посте назвал грибы таксоном). Дискуссии на форуме о лишайниках и вирусах -- той же природы. |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
сине-зелёный водоросли = цианобактерии (не надо тут казуистикой заниматься) |
plantago moderator |
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
бактерии = эубактерии археи = архебактерии эукариоты = эвкариоты Но устраивать дискуссию о "правильности" того или иного названия - дело малоосмысленное...
|
Juglans Постоянный участник |
"Даниил, всёж у Вас катастрофическое мышление" (с) речь не о правильности (пусть о ней пишут великие моралисты вроде Н.Михалкова), а о том, что одно и того же название имеет разный смысл. Для тёти Мани грибы - это одно, для daniil_naumoff - немного шире. plantago "Грибы, скорее, не таксон, а жизненная форма" Ключевым тут является слово "скорее", т.е. в нем уже есть некатегоричность. И не случайно. Растения, животные, водоросли и даже мхи - все это в своем прошлом было наполнено разным составом, относящимся ныне к разным царствам. Можно говорить о грибах как о жизненной форме, а можно и как о таксоне. Что такое таксон? - единица классификации. Могут ли грибы выступать в качестве единицы классификации? - да, при определенных условиях могут и выступали. К сожалению, далее Вы написали слишком непродуманную фразу, которая мало адекватна: "Вокруг систематики пасется множество "мелких" классификаций, в том числе классификация органов (мерономия по Мейену), и вот жизненных форм тоже." Остается только понять, почему дрожжи и лисички - это одна жизненная форма. |
plantago moderator |
(Juglans @ 05.05.2006 03:11) К сожалению, далее Вы написали слишком непродуманную фразу, которая мало адекватна: "Вокруг систематики пасется множество "мелких" классификаций, в том числе классификация органов (мерономия по Мейену), и вот жизненных форм тоже." Остается только понять, почему дрожжи и лисички - это одна жизненная форма. Мне кажется, я ее продумал (полдня думал, однако). Может, неудачно выразился? Попробую иначе: проблемы с понятиями "грибы", "вородосли", "вирусы" возникают потому, что их внутреннее содержание разнородно. Эти понятия частью таксономические, а частью относятся к соседним "топикам". "Топики" эти (классификация жизненных форм, например) пересекаются с систематикой, что и порождает проблемы. Так яснее? |
Juglans Постоянный участник |
я лишь был обескуражен тем, что мерономия была названа классификацией органов и помещена на "пастбище" с классификацией видов. Но, с другой стороны, я не вижу проблемы, чтобы называть грибами оомицеты. Pantopoda называют морскими пауками, хотя это не пауки. То, что оомицеты (т.е. уже -мицеты) похожи на грибы чисто внешне, может быть отражено в их названии. Название группы не определяет его положения в системе: китовая вошь - не насекомое, шток-роза - не розоцветное. Хотя есть и другое мнение. Когда доказали, что щупальца головоногих - это не гомологи ноги, то нашелся человек, предложивший новое название, Siphonopoda. |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
(Juglans @ 05.05.2006 14:11) Может объясните значение этого термина? |
plantago moderator |
1) Не очень новая статья ( 2) Происхождение кактусов опять стало привлекать внимание, особенно когда обнаружилось, насколько они близки к Portulacaceae. Интересная статья про возможные пути становления жизненной формы "кактус" в этой группе ( 3) Обзор T. Embley посвящен разоблачению Archezoa ( 4) Забавный случай HGT ядерного гена от мятлика к овсянице ( 5) Впервые посеквенирован экзотический класс моллюсков Monoplacophora ( === [In Antarctic]... at 3100 m depth, yielded one small specimen (1.7 mm shell length) of the monoplacophoran Laevipilina antarctica Waren et Hain, 1992, one of the 26 known species of this group of molluscs ... and half of the specimen was used for molecular work. Although monoplacophoran DNA was highly degraded ... we were able to amplify and sequence a 1.2-kb fragment of the large nuclear ribosomal subunit (28S rRNA). === Вы только представьте, достать с трехкилометровой глубины антарктического моря 1 (один) экземпляр двухмиллиметрового моллюска! И получить "highly degraded" ДНК... Ну и, бардака в молекулярную систему моллюсков добавилось. Попали моноплакофоры внутрь хитонов. 6) И еще про беспозвоночных ( 7) Морфологи членистоногих считают, что морфология мозга сближает онихофор с хелицеровыми ( 8) Безумные динофлагелляты, меняющие пластиды, как перчатки, исследованы на предмет белков ( 9) Отдаленный гомолог метазойного гена Hedgehog, участвующего в эмбриогенезе, найден у хоанофлагеллят ( 10) И опять ( === Gene fusion events are considered rare and likely stable, and such an event has recently been used to argue for a root of the eukaryotic tree. Our data, however, show that exact reversals of fusion events do take place and hence gene fusion data are difficult to interpret without knowledge of the phylogeny of the organisms – therefore their use as phylogenetic markers must be considered carefully. === Это -- здоровенный камень в огород T. Cavalier-Smith и его новой любимой теории о двух ветвях эукариот: Uniconta и Biconta. 11) Еще одна гипотеза принадлежности вендобионтов. Теперь их сравнивают с гребневиками ( 12) По-прежнему очень просто открыть новый тип. Надо взять список D. Patterson ( 13) И off-topic на закуску, просто прикольно, как говорится --
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 13.05.2006 12:15 |
Juglans Постоянный участник |
думаю, что мерономия - это классификация частей или структур организмов с целью создания иерархической системы меронов. Классификация органов - органомия - часть анатомии. |
plantago moderator |
(Juglans @ 13.05.2006 03:44) plantago думаю, что мерономия - это классификация частей или структур организмов с целью создания иерархической системы меронов. Классификация органов - органомия - часть анатомии. Согласен. |
plantago moderator |
1) Вышла статья, посвященная подробному изучению развития "цветка наоборот" -- Lacandonia schismatica ( 2) Новая классификация пальм -- одного из крупнейших семейств однодольных -- предложена C. Asmussen с соавторами ( 3) W. Friedman (известный открытием двойного оплодотворения у Ephedra) описал новый тип женского гаметофита (зародышевого мешка) у покрытосеменных, свойственный базальному таксону -- Amborella trichopoda ( 4) Th. Cavalier-Smith опубликовал статью "с большими буквами и цветными картинками", в которой описаны его представления об эволюции всего живого ( Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 21.05.2006 07:30 |
plantago moderator |
1) В статье ( 2) Заодно отыскал (2000 года) статью по систематику цитрусов ( 3) G. Brugerolle добавил ( 4) Молекулярные исследования митохондриального генома вернули трихоплаксу статус самого примитивного многоклеточного животного -- 5) W. Foissner исследовал в деталях феномен космополитического распространения протистов ( 6) Французские планктонологи попробовали выяснить ( 7) Отсеквенированы эбриевые ( 8) Вышла большая работа по молекулярной систематике гастротрих ( 9) Как известно, в результате молекулярных исследований цветковых больше всего "не повезло" норичниковым и молочайным. Ботаники школы P. Endress выполнили анализ строения и развития цветка у Picrodendraceae -- одного из семейств, выделяемых из молочайных (
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 05.06.2006 07:43 |
plantago moderator |
1) Новая работа о таксономических отношениях проблематичной группы Hydrocotyloideae ( 2) Семейство портулаковых находится на перекрестке дискуссий о парафилии в систематике, потому что, согласно логике кладистики, в него надо включать кактусовые, дидиереевые и базелловые, чего не хотят сторонники традиций (а включать в портулаковые кактусы не хотят даже сами кладисты ). Еще одна своеобразная группа -- кергеленско-новозеландские гекторелловые, по-видимому, тоже должна войти в этот набор ( 3) И про парафилию: R. Brummit написал статью под названием "Am I a bony fish?" ( 4) Как-то ускользнула от моего внимания еще одна статья T. Cavalier-Smith, где автор развивает смелую гипотезу о происхождении митохондрий от фотосинтезирующих (sic!) пурпурных бактерий ( 5) Очередная гипотеза происхождения цветковых основана на геномике арабидопсиса: авторы утверждают, что ключевым событием в истории цветковых была двойная дупликация всего генома ( 6) Попытку установить место микроспоридий на филогенетическом дереве грибов предприняли канадские исследователи ( 7) Молекулярные исследования подтверждают дифилетичность радиолярий, а также близость к ним своеобразнейшего протиста Sticholonche ( 8) Молекулярная систематика амеб развивается быстрыми темпами, причем российские протистологи здесь лидируют. В последней работе С.И.Николаева с соавторами установлена принадлежность замечательного во многих отношениях протиста Multicilia marina ( 9) Систематика млекопитающих более или менее стабилизировалась, однако в статье японских исследователей ( 10) Ископаемая неогнатная птица из раннего мела (!) найдена в Китае (
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 23.06.2006 06:48 |
mlog moderator |
(plantago @ 23.06.2006 04:46) Новости систематики и эволюции 1) Новая работа о таксономических отношениях проблематичной группы Hydrocotyloideae ( 5) Очередная гипотеза происхождения цветковых основана на геномике арабидопсиса: авторы утверждают, что ключевым событием в истории цветковых была двойная дупликация всего генома ( Нет ли у Вас доступа к полным текстам этих статей?
|
plantago moderator |
(mlog @ 22.06.2006 23:51) Есть. Все статьи, упомянутые в "Новостях", можно получить, написав мне личное сообщение. |
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
(plantago @ 23.06.2006 07:46) 2) Семейство портулаковых находится на перекрестке дискуссий о парафилии в систематике, потому что, согласно логике кладистики, в него надо включать кактусовые, дидиереевые и базелловые, чего не хотят сторонники традиций (а включать в портулаковые кактусы не хотят даже сами кладисты ). Еще одна своеобразная группа -- кергеленско-новозеландские гекторелловые, по-видимому, тоже должна войти в этот набор ( На сколько вообще изучена флора (и фауна) Кергелена и прилегающих островов (Хёрд и т.д.)? Есть ли обзорная литература по этому вопросу - по биоразнообразию? |
plantago moderator |
|
Asafich Постоянный участник St.Petersburg |
Это же мечта! Республика ученых ! Правда, судя по всему кергеленские ученые в основном пинают балду . По крайней мере флора и растительность изучены слабо. Я посмотрел, что есть в библиотеке в Кью - и вот что нашёл: Cour, P. 1959. Flore et végétation de l'Archipel de Kerguelen. ii. Végétation Terres Australes et Antarctiques francaises, no. 8-9. pp. 3-40. Lourteig, Alicia. 1973. Essai sur la distribution géographique des plantes vasculaires de l'Archipel de Kerguélon. Chastain, A. 1958. La Flore et la végétation des îles de Kerguelen: polymorphisme des espcèes australes + ещё несколько немецких работ 19 века. Не густо... Сообщение было отредактировано Asafich - 28.06.2006 00:09
|
SOE |
|
Asafich Постоянный участник St.Petersburg |
|
plantago moderator |
(SOE @ 29.06.2006 07:36) Может быть кто-нибудь может подсказать последний обзор по лютиковым, в частности интересует род Прострел, Pulsatilla. Желательно на русском или англиском языке. Если у кого-то есть тексты статей Тамуры (Tamura M.) по лютиковым, пожалуйста перешлите, а то нигде не могу найти. и будет Вам щастье Я думаю, Вы понимаете, что Pulsatilla из Anemone выделяют в основном в России и в Германии. Если нужны полные тексты статей, которые Вы получите при поиске, звоните в FullText (
|
Juglans Постоянный участник |
Anemone s.l. какие еще роды включает? |
plantago moderator |
|
« Предыдущая тема · Plant science / Herba · Следующая тема » |