Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Пришивка APTES к стеклу
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! APTES




 прочитанное сообщение 18.08.2019 18:40     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Доброго времени суток всем.
Кто-нибудь сам шил себе шарики для твердофазного синтеза днк, пептидов? Или регенерировал поюзаные. Каково оно?
А то стоит флакон с APTES на 100 мл, выкидывать жаба душит.
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 18.08.2019 21:01     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

для синтеза не шил. Кроме аминопропилтриэтоксисилана вообще-то нужны сами шарики точнее макропористое стекло. С юзаными шариками бы связываться не стал.

А так делаете раствор 2% в толуоле например. Стекло с кислотой кипятите пол часика, промываете водичкой обильно, потом сушите ночку при 120оС и заливаете волшебным раствором. Раствор можно и в баньке подержать градусах при 60 несколько часов, а можно на комнате оставить на сутки. Потом промываете толуолом, и сушите при 120оС
Участник оффлайн! kakseq




 прочитанное сообщение 19.08.2019 18:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

(MMM @ 18.08.2019 22:01)
Ссылка на исходное сообщение  для синтеза не шил. Кроме аминопропилтриэтоксисилана вообще-то нужны сами шарики точнее макропористое стекло. С юзаными шариками бы связываться не стал.

А так делаете раствор 2% в толуоле например. Стекло с кислотой кипятите пол часика, промываете водичкой обильно, потом сушите ночку при 120оС и заливаете волшебным раствором. Раствор можно и в баньке подержать градусах при 60 несколько часов, а можно на комнате оставить на сутки. Потом промываете толуолом, и сушите при 120оС

ммм я для ДНК микроаррев аминировал покровные стекла мелкоскопа не так жестоко smile.gif
Участник оффлайн! kakseq




 прочитанное сообщение 19.08.2019 18:44     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(MMM @ 18.08.2019 22:01)
Ссылка на исходное сообщение  для синтеза не шил. Кроме аминопропилтриэтоксисилана вообще-то нужны сами шарики точнее макропористое стекло. С юзаными шариками бы связываться не стал.

А так делаете раствор 2% в толуоле например. Стекло с кислотой кипятите пол часика, промываете водичкой обильно, потом сушите ночку при 120оС и заливаете волшебным раствором. Раствор можно и в баньке подержать градусах при 60 несколько часов, а можно на комнате оставить на сутки. Потом промываете толуолом, и сушите при 120оС

ммм ты забыл что все процедуры отмывки стекла в ултрозвуковой бане wink.gif
Участник оффлайн! kakseq




 прочитанное сообщение 19.08.2019 18:54     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(MMM @ 18.08.2019 22:01)
Ссылка на исходное сообщение  для синтеза не шил. Кроме аминопропилтриэтоксисилана вообще-то нужны сами шарики точнее макропористое стекло. С юзаными шариками бы связываться не стал.

А так делаете раствор 2% в толуоле например. Стекло с кислотой кипятите пол часика, промываете водичкой обильно, потом сушите ночку при 120оС и заливаете волшебным раствором. Раствор можно и в баньке подержать градусах при 60 несколько часов, а можно на комнате оставить на сутки. Потом промываете толуолом, и сушите при 120оС

"А так делаете раствор 2% в толуоле например" ©

из органики аминосиланит гемморр легче из спирта с водичкой beer.gif
Участник оффлайн! kortkeros




 прочитанное сообщение 19.08.2019 23:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

(MMM @ 18.08.2019 22:01)
Ссылка на исходное сообщение  для синтеза не шил. Кроме аминопропилтриэтоксисилана вообще-то нужны сами шарики точнее макропористое стекло. С юзаными шариками бы связываться не стал.

А так делаете раствор 2% в толуоле например. Стекло с кислотой кипятите пол часика, промываете водичкой обильно, потом сушите ночку при 120оС и заливаете волшебным раствором. Раствор можно и в баньке подержать градусах при 60 несколько часов, а можно на комнате оставить на сутки. Потом промываете толуолом, и сушите при 120оС

https://vk.com/video-1103046_79474974
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.08.2019 09:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Макропористое стекло (если не ошибаюсь) - это протравленные щёлочью шарики натриевоборосиликатного стекла. Промывать их кислотой - это излишество. Что касается APTES, то его проще растворить в ацетоне (1...2%). Причём совсем не обязательно особо чистом и безводном. Замочите стекло в ацетоновом растворе APTES на ночь, потом отмойте водой и прокалите 15 минут при 120...130 градусах. Не знаю, в чём тут дело, но прокаливание значительно повышает реакционную способность аминированных групп на поверхности стекла. Правда, насчёт макропористого стекла не уверен, но на обычных (предметных) стёклах это работало неплохо.
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 26.08.2019 17:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Надо, надо травить. Потому что любой диоксид кремния при лежании с поверхности пассивируется и активные гидроксилы на поверхности замыкаются сами на себя. Обработка раствором кислоты реактивирует эти гидроксилы разрушая, образовавшиеся при хранении кислородные мостики. Это такой способ если хотите омоложения диоксида кремния.

Ацетон плох тем, что не позволяет нагреть систему и тем самым повысить эффективность связывания APTES, те он может быть использован(желательно сухой), но не с такой эффективностью. Нагрев после обработки необходим, что бы молекулы APTES, связавшиеся с поверхностью диоксида, связались еще и между собой образуя на поверхности своеобразную органосилоксановую двумерную пленку, которая ограничивает доступ воды к кремний-кислородным связям и упрочняет связь молекул APTES с поверхностью диоксида кремния.
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 26.08.2019 19:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

(MMM @ 26.08.2019 15:02)
Ссылка на исходное сообщение  Надо, надо травить. Потому что любой диоксид кремния при лежании с поверхности пассивируется и активные гидроксилы на поверхности замыкаются сами на себя. Обработка раствором кислоты реактивирует эти гидроксилы разрушая, образовавшиеся при хранении  кислородные мостики. Это такой способ если хотите омоложения диоксида кремния.

Ацетон  плох тем, что не позволяет нагреть систему и тем самым повысить эффективность связывания APTES, те он может быть использован(желательно сухой), но не с такой эффективностью. Нагрев после обработки необходим, что бы молекулы APTES, связавшиеся с поверхностью диоксида, связались еще и между собой образуя на поверхности своеобразную органосилоксановую двумерную пленку, которая ограничивает доступ воды к кремний-кислородным связям и  упрочняет связь молекул APTES с поверхностью диоксида кремния.


Выглядит убедительно, но я всё равно сомневаюсь. Поскольку не уверен в механизмах реакций, идущих при травлении стекла, связывании им APTES и финишной термообработке.

Травление
Замыкание поверхностных силанольных групп вопросов не вызывает. Но для их размыкания требуются слабощелочные условия. В сильнощелочных стекло (соли кремниевой кислоты), и даже кристаллический кварц (двуокись кремния), будут растворяться. А вот с кислотным гидролизом нужно разбираться. Стекло, наверное, будет терять катионы натрия (и т.п.), но смежные силанольные группы будут моментально конденсироваться. И вообще кислотный гидролиз стекла и кремния вызывает сомнения. Хотя в соляной кислоте стекло, наверное, способно проявлять некоторые чудеса, характерные для плавиковой кислоты, и даже для её солей.
Связывание APTES
Для связывания с силанольными группами необходим его хотя бы частичный гидролиз, поскольку это не обменная реакция (или всё-таки обменная?), а конденсация по крайней мере двух силанольных групп с выделением молекулы воды. Такой конденсации могут помешать только щелочные условия. Специально гидролизовать APTES нет смысла. Гидролиз идёт спонтанно, в присутствии даже следовых количеств воды. Если её не слишком много, то APTES свяжется как положено - одной силанольной группой. Две другие останутся этоксисилановыми.
Финишная термообработка
Этоксигруппы хорошо гидролизуются парами воды, присутствующей в воздухе. Такой гидролиз стимулируется повышением температуры. Кроме того, прокаливание стёкол способствует конденсации свободных силанольных групп на поверхности стекла. Поэтому прогрев (15...20 минут при 115...120 град.) значительно улучшает связывающую способность аминированных стёкол. Главное при этом - не переборщить (аминные группы "загнутся"). Хотя "недобарщивать" тоже не стоит.

Но это всё теории. Поэтому буду признателен за любые замечания практиков.

Сообщение было отредактировано genseq - 26.08.2019 19:51
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 26.08.2019 20:22     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

--поскольку это не обменная реакция (или всё-таки обменная?)
Обменная не обменная - это вопрос философский. Гидролиз там никакой не нужен. Спирт уходит силоксан образуется. Вода будет только давать побочный параллельный процесс ухода спирта и образования не активного силанола.

При обработке кислотой она как раз действует, только на поверхность кремнезема и на поверхностные силанольные группы, а щелочь будет его частично растворять.
Участник оффлайн! elektrikvasilij




 прочитанное сообщение 28.08.2019 23:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

"При обработке кислотой она как раз действует, только на поверхность кремнезема" lol.gif lol.gif lol.gif

я на боросиликатное стекол пробовал во времена Андрея Мирзабекова директора Института Молекулярной Биологии smile.gif

типа ДНК-чип lol.gif

ммм в Америге Барбара Траск придлагала ВЫПАРИВАТ аминосилан на предметные стекла мелкоскопа beer.gif beer.gif
могу дат ссылку в ПубМеде на Барбару и метод аминосилан но это было так давно lol.gif lol.gif lol.gif
Участник оффлайн! 737MAX
Участник



 прочитанное сообщение 29.08.2019 09:04     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

(APTES @ 18.08.2019 19:40)
Ссылка на исходное сообщение  Доброго времени суток всем.
Кто-нибудь сам шил себе шарики для твердофазного синтеза днк, пептидов? Или регенерировал поюзаные. Каково оно?
А то стоит флакон с APTES на 100 мл, выкидывать жаба душит.

жаба душит lol.gif lol.gif lol.gif
на епоксисиланах габа душит круче beer.gif beer.gif jump.gif jump.gif
Участник оффлайн! 737MAX
Участник



 прочитанное сообщение 02.09.2019 18:14     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

"в Америге Барбара Траск придлагала ВЫПАРИВАТ аминосилан на предметные стекла" (ц)

я однажды попрпбовал этот протокол ВЫПАРИВАНИЯ lol.gif

Сут протокола:
спиртовый раствор слиана заливаетсйя в скороварку над ним на сеточку кладутся предметные стекла потом скороварку на газовую кухонную плиту
smile.gif
рвануло мама не горюй
smile.gif
зато покрытие стекла СУПЕРРАВНОМЕРНОЕ lol.gif
Участник оффлайн! APTES




 прочитанное сообщение 06.09.2019 21:59     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

Большое всем спасибо за помощь.
Единственное, возникли вопросы.
Эти методики вы нашли опытным путем или это адаптация методов из каких-то публикаций?
Если можете дать ссылки на публикации, было бы просто супер!

737MAX: "на епоксисиланах габа душит круче "
Скажите, а какие вы эпоксисиланы применяете и для чего? Почему бы на тот же APTES не пришить к аминогруппе эрихлоргидрин(получился бы N-(2-Oxiranylmethyl)-3-(triethoxysilyl)-1-propanamine)? GABA бы может и не душила так?
Участник оффлайн! КсенияЛарина




 прочитанное сообщение 09.09.2019 11:43     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

(APTES @ 06.09.2019 22:59)
Ссылка на исходное сообщение 
737MAX: "на епоксисиланах габа душит круче "
Скажите, а какие вы эпоксисиланы применяете и для чего? Почему бы на тот же APTES не пришить к аминогруппе эрихлоргидрин(получился бы N-(2-Oxiranylmethyl)-3-(triethoxysilyl)-1-propanamine)? GABA бы может и не душила так?

проще силанить прямо епокси мне нужно было прифигачить аминированые олиги beer.gif jump.gif
Участник оффлайн! X34
Участник



 прочитанное сообщение 09.09.2019 14:52     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

(elektrikvasilij @ 29.08.2019 00:08)
Ссылка на исходное сообщение  
я на боросиликатное стекол пробовал во времена Андрея Мирзабекова директора Института Молекулярной Биологии  smile.gif

до сих пор диссер его с подписью выбросить рука не поднимается
Участник оффлайн! КсенияЛарина




 прочитанное сообщение 09.09.2019 17:07     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

(X34 @ 09.09.2019 15:52)
Ссылка на исходное сообщение  до сих пор диссер его с подписью выбросить рука не поднимается

нефдачник чоли eek.gif confused.gif

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 20.09.19 09:30
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft