Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
ivka Участник Родина |
Сообщение было отредактировано ivka - 21.09.2012 00:58 |
guest: ммм IP-штамп: frQlBxj4iQSg. гость |
Дальше что делать будете? Огласите цель, которую вы хотите достичь? Или вы хотите пришить антитела к Белку А(G) отдельно, чтоб на блоте не мешали? Так делают, только надо аккуратно это делать(дозу сшивки подбирать), можно ненароком сильно снизить(или даже убить) их аффиность. |
ivka Участник Родина |
EGS я довольно эффективно использую в ChIP. |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(ivka @ 21.09.2012 06:42) Цель и смысл аналогично вот этому ЕГС я довольно эффективно использую в ЧИП. то-то ни одного мотива под трансфаком |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(ivka @ 21.09.2012 06:42) Цель и смысл аналогично вот этому ЕГС я довольно эффективно использую в ЧИП. угу - час в ЕГС плус пол-часа в формалине |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(ivka @ 21.09.2012 06:42) Цель и смысл аналогично вот этому EGS я довольно эффективно использую в ChIP. |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(ivka @ 21.09.2012 06:42) Цель и смысл аналогично вот этому ЕГС я довольно эффективно использую в ЧИП. ну тут может и нужен ЕГС ? |
guest: ммм IP-штамп: frQlBxj4iQSg. гость |
|
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(ivka @ 21.09.2012 06:42) Цель и смысл аналогично вот этому ЕГС я довольно эффективно использую в ЧИП. угу - только где мотив для трансфака ? |
ivka Участник Родина |
(guest: ммм @ 21.09.2012 12:10) ага! хотите сшить белки in vivo, вполне можно попробовать, раз ваш опыт говорит о том, что данная сшивка проникает через мембрану. Да, а вот ингибировать сшивку трисом, как у цитируемых ребят, глупо. Насколько мне известно трис сквозь мембрану не проходит. Собственно вопрос в том как декросслинкировать перед нанесением на форез. |
guest: ммм IP-штамп: frQlBxj4iQSg. гость |
А в чем проблема? Вы же им уже пользовались. Procedure for Cleaving EGS Crosslinked Compounds with Hydroxylamine•HCl This procedure is modified from the method used by Abdella, et al. (1979). A. Materials Required • Hydroxylamine•HCl • Phosphate Buffered Saline (PBS) adjusted to pH 8.5 B. Procedure 1. Prepare 2M hydroxylamine•HCl by adding it to PBS and adjusting the pH back to 8.5. Prepare this solution immediately before use. 2. Warm the hydroxylamine•HCl solution quickly to 37°C and incubate equal volumes of sample and hydroxylamine solution for 3-6 hours with stirring. Alternatively, incubate for 6 hours at room temperature; however, efficiency mightbe lower. Note: An aliquot of the hydroxylamine cleaved sample, containing 13-14µg quantities of protein, can be examined by SDS-PAGE to determine effectiveness of the cleavage вместо PBS можете использовать 0.2М Na2CO3, рН подводить щелочью. |
ivka Участник Родина |
Есть некоторая разница с ChIP, где для декросслинкирования достаточно удалить формальдыгидные сшивки с ДНК. Хм, да, надо читать до конца Сообщение было отредактировано ivka - 21.09.2012 20:29 |
ivka Участник Родина |
(Guest @ 21.09.2012 12:16) О каком мотиве можно говорить в случае nonDNA binding protein? |
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |