Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Ответ в Датировки по рибосомальным генам

Иконка сообщения*  [ Без иконки ]   Важно!   Вопрос   Информация     Обмен опытом   Шутка, забавная история     Поздравления, благодарности   Возмутительно!   Проблема   Картинки, фотографии
Введите имя

 [вст. закрывающие теги*

*


*



Смайлик: согласен Смайлик: не согласен Смайлик: улыбка Смайлик: пожалуйста, умоляю! Смайлик: помираю со смеху Смайлик: подмигивание Смайлик: подшучивать, дразнить Смайлик: смущение Смайлик: мне стыдно Смайлик: жуть! Смайлик: не понял Смайлик: закатывать глаза Смайлик: недовольство, огорчение Смайлик: рёв в три ручья Смайлик: злость Смайлик: супер Смайлик: умник Смайлик: чайник Смайлик: сходка Смайлик: Ура! Смайлик: не получается!
Перевод выделенного текста из латиницы в кирилицу. Текст в квадратных скобках '[]' не преобразуется

Пример: biologija -> биология [b] - полужирный шрифт

Пример: [b]полужирный[/b] [i] - курсив

Пример: [i]курсив[/i] [u] - подчёркнутый

Пример: [u]подчёркнутый[/u] [sup] - верхний индекс

Пример: температура 37[sup]o[/sup]C [sub] - нижний индекс

Пример: H[sub]2[/sub]O - вода [QUOTE] - применяется для цитирования чужих сообщений, цитата вставляется с небольшим отступом от края текста

Пример: [QUOTE]цитата[/QUOTE] [code] - форматирование как при вводе
Применяется для вывода теста как он есть, с предотвращением форматирования (автопереноса на новую строку), без интерпретации кодов форума и смайликов; вставляется с небольшим отступом от края текста.

Пример: 
[code]
программный код
	1 строка
	2 строка
[/code] [list] - список:
возможны опции: 1, a, A, i, I
[list] неупорядоченный; 
[list=1] нумерованный; 
[list=A] упорядоченный по буквам A-Z

Пример:
[list=1]
[*] первая строка;
[*] вторая строка;
[/list] Тег [hr] - горизонтальная разделительная линия

Пример: 
Абзац 1
[hr]
Абзац 2 [url] - гиперссылка

Примеры:
[url]www.ncbi.nlm.nih.gov[/url]
[url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/]NCBI[/url] [email] - ссылка на адрес электронной почты

Пример: [email]masha@mail.ru[/email] Тег [img] - рисунок
[img] - в строке;
[imgL] - выравнивание по левому краю; 
[imgR] - выравнивание по правому краю.

Пример:
[img]http://molbiol.ru/izo/rl.gif[/img] [ru] - только для русских читателей

Пример:
[ru]это увидят только те, кто использует русский интерфейс[/ru] [en] - только для английских читателей

Пример:
[en]это увидят только те, кто использует английский интерфейс[/en] [self] - текст виден только вам и администрации

Пример:
[self]это увидите только вы сами[/self]
[left] - выравнивание по левому краю

Пример: [left]текст слева[/left] [center] - выравнивание по центру

Пример: [center]текст в центре[/center] [right] - выравнивание по правому краю

Пример: [right]текст справа[/right] [just] - выравнивание по обоим краям

Пример: [just]выровненный текст[/just]

     размер сообщения / макс. размер:  / 15360


Последние 10 сообщений [ в обратном порядке ]
watchesbiz Отправлен 11.11.2021 16:09
  https://replicawatches24.tumblr.com/post/64...lica-watches-uk
https://ello.co/replicawatchesuk/post/ubut9ig9g4glx-q6nyphka
https://www.evernote.com/shard/s451/client/...%2BWatches%2BUK
https://www.bloglovin.com/@rolexrelicawatch...replica-watches
https://www.designspiration.com/watcheshutuk/saves/
https://write.as/fakerolexwatches/hints-to-...lica-watches-uk
https://www.dailystrength.org/journals/hint...lica-watches-uk
https://issuu.com/replicawatchesuk/docs/dif...he_replica_watc
https://www.keepandshare.com/discuss2/5601/...lica-watches-uk
https://penzu.com/public/9e250377
https://bestreplicawatc.livejournal.com/336.html
https://www.pearltrees.com/replicawatchesuk/item349627941
https://www.intensedebate.com/people/watches24
https://anonfiles.com/N039Qf66q9/Guide_On_H...atch_Online_pdf
dk Отправлен 16.05.2019 11:15
  А в чём проблема-то? Можете "откалибровать" часы по любому локусу. Ну, конечно, если вы вообще верите в мол.часы. Особых проблем тут нет, ITS должен даже лучше подходить, т.к. он якобы эволюционно нейтральный (хотя говорят что это не так). Например, здесь считают скорость замен у хищнецов по разным локусам, в том числе и ITS. Но с этим локусом есть другая "засада" - он часто полиморфный и тогда его надо клонировать а потом разбираться с аллелями.
Nemestnyi Отправлен 16.05.2019 09:23
  Опять возник подобный вопрос, правда касается он рибосомального спейсера ITS1. Отправлял статью в один иностранный журнал, там имеются датировки по COI, используются так же последовательности ITS1. Вот рецензент спросил, "отчего мы не используем еще и датировки по ITS1?" Вот лично я вообще никогда не встречал молекулярных датировок по этому фрагменту и имею большие сомнения о его пригодности. Но закрались сомнения.

Вопрос: Может кто-то где-то встречал подобные калибровки на данный фрагмент?
dk Отправлен 22.11.2017 19:12
  Вот это - подойдёт? Дуплексы консервативные, в петлях (не всех и не везде) возможны замены.
Nemestnyi Отправлен 22.11.2017 08:40
  Кстати!

А не подскажет ли кто какой схемы/рисунка, публикации, ресурса со схемой или описанием консервативных участков и вообще, какие именно и как компонуются в молекуле 18S в рабочем состоянии?
dk Отправлен 18.11.2017 11:24
  Да, 18S не самый удачный локус. Консервативные участки, которые образуют дуплексы, вообще сильно консервативны, а накопление замен в доменах петель тоже вовсе не линейно и сильно ограничено функцией рибосомы. Филогения на 18S будет "работать" на довольно "больших" временных промежутках (уровень семейств), а если Вы работаете с видами - то не особо. Да и в некодирующих локусах, честно сказать, мол.часы не всегда корректно работают. Калибровка-то ведётся либо по синтетическим тестам, либо по палеонтологическим данным. И в том, и в другом случае есть свои особенности для разных локусов. Что уж там - сам М.Нэй в своей посл.книге советует очень аккуратно использовать мол.часы!
А так для беспов обычно используют или "Хебертовский" COI с ходом в 0,7-1,2 Mya на %, или общий мтДНК с ходом в 1,5 Mya на %. При этом использование разных палеонтологических данных приводит к погрешностям в 10 (!) раз. Например, при калибровке часов для Дафнии можно пользоваться этим, а можно вот вот этим - и получите существенные различия.
vb Отправлен 16.11.2017 09:17
  По-моему не подходят, так как последовательноти достаточео консервативные и если и есть замены, то они мало связаны с временем.
хотя могу ошибаться, я эту тему краем затронул.

Вернее так - они консервативные, так как критичны для организма.
молекулярныечасы - это лучше во всяких некодирующих участках.
Nemestnyi Отправлен 16.11.2017 09:06
  Здравствуте! Не подскажет ли кто, а существуют ли какие расчитанные скорости накопления замен для рибосомальных генов? В частности для 18S у беспозвоночных. Сколько искал (возможно плохо искал), не натыкался.

Вообще используют ли рибосомальные гены для датировок и вычисления всяких там молекулярных часов?
Посмотреть тему (откроется в новом окне)

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 29.03.24 02:32
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft