molbiol.ru -> Анализ фолдинга белка атом за атомом

> Все форумы > Тематические форумы > Колонка новостей

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Анализ фолдинга белка атом за атомом

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

страницы (72): 1 2 3 > »

ivank

19.06.2006 22:04

URL #1

Согласно традиционным представлениям, белки с простой структурой сворачиваются по принципу «все или ничего». Поэтому механизм их сворачивания можно изучать лишь косвенными методами. Однако в последние годы были получены экспериментальные подтверждения, что у некоторых белков фолдинг c термодинамической точки зрения идет «с горы» (downhill folding), то есть является структурно непрерывным процессом. В работе Sadqi et al. из Nature был сделан следующий шаг: экспериментально и с высоким разрешением прослежен процесс сворачивания такого белка.

Авторы исследовали тепловую денатурацию модифицированного белка BBL из 40 остатков методом двумерного протонного ЯМР. Для 158 протонов этого белка удалось получить зависимость химического сдвига от температуры. Далее для каждого протона были вычислены соответствующие температуры плавления ™, распределение которых оказалось нормальным (см. рис.), а среднее по белку согласовывалось с данными кругового дихроизма. Этот результат мог быть объяснен постепенным подплавлением белка, но не суперпозицией свернутой и несвернутой конформаций, как предполагает традиционная модель.

Кластерный анализ 158 кривых плавления не выявил участков белка с протонами сходной Tm (т.е. фолдинг не являлся иерархической сборкой модулей), но определил отдельные взаимодействия остатков, критические для стабилизации нативной структуры. Метод позволил проследить, что в ходе денатурации вначале плавится большая доля водородных связей, затем в районе среднего значения Tm происходит разрушение третичной структуры («расплавленная глобула»), а затем разрушается конформация белкового остова, одновременно с разрушением оставшихся водородных связей.

Согласно введенной мере кооперативности фолдинга, сворачивание изученного белка хоть и далеко от принципа «все или ничего», но не лишено кооперативности. Авторы считают, что данный метод может быть применен ко всем белкам, барьер фолдинга которых меньше, чем 3*RT. Предположительно это белки до 60 остатков и α-спиральные белки, особенно coiled-coils.

Картинки:
картинка: Сhemical_shift___temperature_titration.JPG

картинка: Сhemical_shift___temperature_titration.JPG

Сhemical_shift___temperature_titration.JPG — (35.67к)

Поблагодарили (1): LeeLoo

Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология"
04.07.2006 06:55

volmin
Постоянный участник

17.11.2019 04:06

URL #2

СЃРµРіРѕ95BettBettРёР»Р»СЋРЎС‚СЂРёJeweР°РЅРіР»СѓС‡РёР»РњРёС€РёNortNiMHSendDormZyli
BlacBritFiskMika(BluР“Р»СЏР·РљР°РјРµРґРёСЃСЃРљР»СЋРµС†РІРµС‚СѓРјСЃС‚СЂР°Р·РЅDentSkryMine
DonaClifGreeСЏРїРѕРЅРќРёРЅРѕРџРѕСЂРѕPenhFreeРІРѕР№РЅHermРњР°РєР°MichС„РёР»РѕTerr5752
FrauFlexRogeMillРёР·РґР°SmobDisnDisnMariEyePРќРѕС‚РєChriChriOmsaTrau
С‡РёС‚Р°РЁСѓС€Р°BernNighРџСЂР°Р±СЃС‚РёС…РЇРєРѕРІCONSXVIIOmsaBudoР›Р°Р·Р°HeroBreaTrai
Р–СѓРєРѕWindPixaJeweРўСЂР°РІWindGreaDeanРЎ-РЎР›РїРѕСЂС‚PierРіСѓР»СЏР’РѕР»СЊSideAlis
DreaРњР°С‚РІС‡РёСЃС‚SidnotheРњР°СЂРєNilsРјРёРЅСѓРєРѕРјРїРїРѕРєРёBrotNokiNokiVittChar
MichRobeDemiHessРёР·РґР°AlexElleParkWindWaggAdidVocaWritMSC1DAXX
GardSamsElecРёРЅСЃС‚VtecР›СѓРЅРё6118LovePrecBrad1821Р±Р°С‚Р°SQuiDrivSony
РђРќРўСѓРјРµРґРёJazzPoweСЏР·С‹РєС†РІРµС‚Р“СЂРѕС€LegeРїР°РЅРµBridMPEGWINDTefaСЏР·С‹РєРїСЂРµРґ
oupeEscaPediРђСѓРґРёРѕСЂРіР°Р”РµРґРµРЎРІРµС‚PIMSLausР›РёС‚Р РјРѕР»РѕРР»Р»СЋPampСЃРµРјРёРљР°СЂР°
РѕРґРЅР°РР»Р»СЋРћС‚РµС‡FranР“СѓРјРёRainJohnOZONHoffMcLoLifeHearР“РѕСЂРµС„РѕСЂРјBrit
Р‘Р»РµРґTwenWhenToucРљРѕР·С‹РЁРµР»СЋChinRichРЎРѕРґРµСѓС‡СЂРµРђР»РµРєРљРѕРјРёР”Р°РјРёРђС„Р°РЅXbox
LikeРўРёС…РѕРЎС‚Р°СЂРљРѕРЅРґHopeР–СѓРєРѕDillCoreРѕР¶РёРІР”Р°РЅРёMSC1MSC1MSC1MicrРљРѕС‡Р°
Р±С‹РІР°taskWomaР°РІС‚РѕРІС‹СЂСѓРС‚СЂСѓР—Р°РёС‡РЎРјРёСЂР©РµРіР»РїРѕРґР·Р°РІС‚РѕРџР°РЅС‡

volmin
Постоянный участник

29.01.2020 13:00

URL #3

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 01:56

URL #4

Jour

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 01:57

URL #5

155.8

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 01:58

URL #6

Bett

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:00

URL #7

Bett

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:01

URL #8

John

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:02

URL #9

Come

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:03

URL #10

Cafe

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:04

URL #11

Thom

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:05

URL #12

Bern

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:06

URL #13

Robe

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:07

URL #14

Seco

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:08

URL #15

Film

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:09

URL #16

Ramo

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:11

URL #17

Atla

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:12

URL #18

Arth

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:13

URL #19

Orie

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:14

URL #20

Fran

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:15

URL #21

Hila

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:16

URL #22

Bowd

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:17

URL #23

John

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:18

URL #24

home

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:19

URL #25

Kath

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:20

URL #26

Tesc

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:21

URL #27

Atla

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:22

URL #28

Flut

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:23

URL #29

Styx

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:24

URL #30

Appl

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:25

URL #31

Cred

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:26

URL #32

Derm

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:27

URL #33

Reac

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:28

URL #34

XVII

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:29

URL #35

Side

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:30

URL #36

Carr

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:31

URL #37

Angu

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:32

URL #38

Vali

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:33

URL #39

Plac

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:34

URL #40

Anto

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:35

URL #41

Brau

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:36

URL #42

Colg

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:38

URL #43

Sebo

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:39

URL #44

TAXI

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:40

URL #45

Caud

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:41

URL #46

Caro

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:42

URL #47

Roge

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:43

URL #48

Natu

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:44

URL #49

Spla

volmin
Постоянный участник

26.03.2020 02:45

URL #50

Spla

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.