Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

* Речеподобность белковых генов -- deleted by Aglaya --
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую тему
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.12.2017 19:40     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Поскольку мне грубо закрыли доступ к моей теме в Мол. и клет биологии
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=581153 ,
продолжу её здесь.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.12.2017 19:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Давно известное: Терминация — окончание синтеза белка, осуществляется, когда в А-сайте рибосомы оказывается один из стоп- кодонов — UAG, UAA, UGA. Из-за отсутствия тРНК , соответствующих этим кодонам, пептидил-тРНК остаётся связанной с Р-сайтом рибосомы. Здесь в действие вступают специфические белки RF1 или RF2, которые катализируют отсоединение полипептидной цепи от мРНК, а также RF3, который вызывает диссоциацию мРНК из рибосомы. RF1 узнаёт в А-участке UAA или UAG; RF-2 — UAA или UGA. С UAA терминация эффективнее, чем с другими стоп-кодонами.

ППГ: Это так, но этому предшествует важное событие - принятие решения об остановке синтеза белка тремя стоп кодонами (омонимами). "Решение" в данном случае - не пустая метафора, но результат работы нанобиокомпьютера, которым является белок синтезирующая система. Именно этот нанобиокомпьютер анализирует КОНТЕКСТ мРНК последовательности и тогда, и только тогда, один из трех омонимически двусмысленных триплетов (то-ли стоп, то-ли аминокислота?) приобретают значение или стопа, или аминокислоты. Вот так, коротенько. Разумеется, это гипотетично. Нам предстоит огромная работа по изучению белок синтезирующей системы, как нанобиокомпьютера. И работа по изучению белковых генов с позиций лингвистики.

Мысли о том, что белковый код двукратно синонимо-омонимически вырожденный
Представьте себе, что стоп-функции принадлежат каким-то кодонам синонимам. НО тогда выпадает архи важная функция анализа текстовой, смысловой составляющей генов. Ведь синонимы жестко, однозначно и избыточно кодируют аминокислоты вне зависимости от семантики гена. Или в зависимости, заданной как-то (как?) и заранее. И потом, пока не обнаружено делегирование функций стопов кодонам синонимам. Так? Так. В противоположность этому, стопы-омонимы живут в мРНК в режиме ожидания смысла контекста мРНК (гена). В зависимости от смысла, принимается решение о точном значении двусмысленного кодона не синонима (омонима) - быть кодом аминокислоты и продолжить синтез белка, или остановить его, как и положено стопу.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.12.2017 19:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

о двумерной вырожденности белкового генетического кода

Двумерная синонимо-омонимическая вырожденность белкового триплетного кода

TAT TYR TAC TYR TAA STOP TAG STOP (ПОПАРНЫЕ СИНОНИМЫ)
TAC TYR
TAA STOP
TAG STOP

(ПОПАРНЫЕ
ПРОТИВОСТЯЩИЕ
ОМОНИМЫ)

По вертикали - омонимы, по горизонтали - синонимы
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.12.2017 19:54     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Для лучшей ориентировке даю синонимо-омонимическое представление таблицы генетического кода:

Файл/ы:

______________.pdf
размер: 104.58к
кол-во скачиваний: 23
28.12.2017 — 29.06.2018

Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 28.12.2017 23:54     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Селеноцистеин подтверждает http://genetiku.ru/news/item/f00/s02/n0000254/index.shtml
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 29.12.2017 08:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Опять гаряев плодит бессмысленный бред.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 29.12.2017 09:26     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

(vb @ 29.12.2017 09:08)
Ссылка на исходное сообщение  Опять гаряев плодит бессмысленный бред.

tongue.gif
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 29.12.2017 09:31     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Генетический код поддерживает целевое введение двух аминокислот одним кодоном
Антон А. Туранов 1 , * ,Лобанов Алексей Владимирович 1 , * ,Дмитрий Феменко 1 ,Хилари Г. Моррисон 2 ,Митчелл Л. Согин 2 ,Лоуренс А. Клобутчер 3 ,Dolph L. Hatfield 4 ,Вадим Николаевич Гладышев 1 , †
↵ * Эти авторы также внесли вклад в эту работу.
Просмотреть всех авторов и филиалов
Science 09 Jan 2009:
Vol. 323, выпуск 5911, стр. 259-261
DOI: 10.1126 / science.1164748
Статья
Цифры и данные
Информация и показатели
eLetters
PDF
Вы просматриваете реферат.

Посмотреть полный текст






Абстракт
Считается, что строгое взаимно однозначное соответствие между кодонами и аминокислотами является важной особенностью генетического кода. Тем не менее, мы сообщаем, что один кодон может кодировать две разные аминокислоты с выбором вставленной аминокислоты, определенной специфической 3'-нетранслируемой структурой области и расположением кодона с двойной функциональностью в РНК-мессенджере (мРНК). Мы обнаружили, что кодон UGA указывает на введение селеноцистеина и цистеина в ресничном Euplotes crassus , что двойное использование этого кодона может происходить даже внутри одного и того же гена и что структурные механизмы мРНК Euplotes сохраняют зависимую от местоположения двойную функцию UGA, когда выраженный в клетках млекопитающих. Таким образом, генетический код поддерживает использование одного кодона для кодирования нескольких аминокислот.

Но это теоретически обосновано мной и предсказано в монографии "Волновой генетический код" (1997г.).
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 29.12.2017 12:17     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

Отличия старого и нового понимания белкового генетического кода.

Напомню, что среди 31 изученных (табличных) кодов нет такового Yomo sapiens. За стандартный принят код кишечной палочки https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi


Различия разительные и они определяются тем, что генетика и мол. биология пока еще не до конца поняла роль 3-го нуклеотида в кодонах. Все остается на уровне начала 60-х прошлого века с момента формулировки Ф.Криком своей гипотезы "качания" 3-го нуклеотида в кодонах. Именно ГИПОТЕЗЫ, но не утверждения. Эту гипотезу надо развивать, от этого зависит многое в биологии, генетике, медицине, компьютинге, сельском хозяйстве и т.д.
Теперь об отличиях.
1. Таблица ген. кода была дана как информационно не раздельная структура, где все кодоны, в статичном положении рибосом и Таблицы кода, ОДНОЗНАЧНО кодируют аминокислоты и стоп положения.

2. Таблица кода разделена функционально на две симметричные и равные части, где 32 кодона ОДНОЗНАЧНО и ИЗБЫТОЧНО кодируют только аминокислоты. Это кодоны-синонимы. 32 других кодона (не синонимы, названные омонимами) НЕ ОДНОЗНАЧНО шифруют и аминокислоты, и омонимы, поэтому для точного синтеза белков необходим ВЫБОР – из двух разных аминокислот – одну, или выбирают или аминокислоту, или стоп. Дешифрованные аминокислоты или стопы в этом случае могут не соответствовать Таблице и опознаваться рибосомой в ДИНАМИКЕ ее чтения мРНК. Это отрицается научным официозом, поскольку не соответствует пункту 1.

3. Такой ВЫБОР осуществляется рибосомой за счет учёта ею (и/ли всей клеткой) контекста данной мПНК. Это отрицается научным официозом.

4. Ситуация ОДНОЗНАЧНОСТИ кодирования СИНОНИМАМИ определяется тем, что в каждом из 8-ми семейств ВСЕ ТРОЙКИ (триплеты) РАЗНЫЕ, поэтому в семействах кодирование происходит ВСЕМИ тремя буквами (нуклеотидами) и все тройки в каждом семействе кодируют только одну аминокислоту. Это кодирование ОДНОЗНАЧНОЕ И ИЗБЫТОЧНОЕ. Установлено группой Нобелиата М.Ниренберга.

5. Ситуация НЕ ОДНОЗНАЧНОСТИ кодирования ОМОНИМАМИ определяется у половины кодонов – не синонимов (омонимов) тем, что 3-й нуклеотид кодонов не участвует в кодировании - может быть любым из 4-х возможных. Кодируют первые два нуклеотида (дублеты). При этом в 6-ти семействах возникает ситуация, когда пары ОДИНАКОВЫХ дублетов кодируют разные аминокислоты, а в двух семействах дублета TA кодирует Тирозин и Стоп, а в семействе дублета TG одна дублетная пара кодирует Цистеин, другая – Стоп и Тирозин. В целом это означает, что наличествует факт омонимии, когда одни и те же парные дублеты кодируют разные аминокислоты или аминокислоту и стоп. Это явление, хотя и было отрыто группой М.Ниренберга и Ф.Криком, не было понято и оценено как противоречащее выдвинутое ими же постулату об ОДНОЗНАЧНОСТИ кодирования всеми 64 кодонами аминокислот и стопов. Вслед за ними научный официоз придерживается того же мнения, что вводит в заблуждение биологов.

6. Существует и еще одна неопределенность в понимании работы кода. Как идет выбор аминокислот (и стопов) в кодонах омонимах? Основной вектор здесь - это контекстные ориентации рибосом на информационной РНК. Легко заметить, но не замечено до сих пор, что при условии воблирования 3-го нуклеотида во всех кодонах, например, семейство кодирующих дублетов AG кодируют ОДНОВРЕМЕННО Ser и Arg. Причем, попарно они синонимичны и избыточно кодируют только Ser и только Arg. И тут выбор прост - наличествуют изоакцепторные тРНК. Но триплеты AGT и AGC (Ser) ОМОНИМИЧНО противостоят триплетам AGA и AGG (Arg) в пределах семейства AG. Следовательно, эти ДВЕ пары могут кодировать и Ser, и Arg. Но тут уже НАДО делать ВЫБОР - либо Ser, либо Arg - одна тРНК не может посадить на себя две разные аминокислоты. И выбор идет с использование контекстных ориентаций рибосомы на мРНК. Такая внутренняя синонимо-омонимического дуалистичность кодонов омонимов (с дополнительными парными синонимиями) существенна. Биофункция такого дуализма (в пределах семейств омонимических кодонов), возможно, в придании еще большей гибкости коду в сочетании синонимии и омонимии. Это также не замечено пока большинством биологов.

7. Существенный момент. Принятая научным сообществом таблица кода СТАТИЧНА и не отображает фактор динамизма в процессе биосинтеза белков in vivo. Это является одной из причин непонимания большинством ключевой знаковой функции 3-го нуклеотида в кодонах омонимах, выводящих геном на уровень реально, а не метафорически, текстовых структур. Это даёт белок синтезирующей системе бесконечные горизонты смысловых (речевых) кодирований.

8. Таким образом мы видим синонимо-омонимическую вырожденность белкового генетического кода, что является существенной коррекцией прежней модели кода. Этот фундаментальный факт отображает единство противоположностей кодонов синонимов и кодонов омонимов, где синонимы выступают как избыточность и точность кодирования, а омонимы как гибкость и приспособляемость кода к долговременным изменениям окружающей среды и обеспечивают мощную защитную работу иммунной системы с ее быстрым биосинтезом иммуноглобулинов.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 00:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

(Gariaev @ 29.12.2017 10:31)
Ссылка на исходное сообщение  Генетический код поддерживает целевое введение двух аминокислот одним кодоном
Антон А. Туранов 1 , * ,Лобанов Алексей Владимирович 1 , * ,Дмитрий Феменко 1 ,Хилари Г. Моррисон 2 ,Митчелл Л. Согин 2 ,Лоуренс А. Клобутчер 3 ,Dolph L. Hatfield 4 ,Вадим Николаевич Гладышев 1

В оригинале так:

1-9-2009
Genetic Code Supports Targeted Insertion of Two
Amino Acids by One Codon
Anton Turanov
University of Nebraska - Lincoln
Alexei Lobanov
University of Nebraska - Lincoln
Dmitri E. Fomenko
University of Nebraska - Lincoln, dfomenko2@unl.edu
Hilary Morrison
Josephine Bay Paul Center, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543, USA
Mitchell Sogin
Josephine Bay Paul Center, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543, USA

Абстракт
Считается, что строгое взаимно однозначное соответствие между кодонами и аминокислотами является важной особенностью генетического кода. Тем не менее, мы сообщаем, что один кодон может кодировать две разные аминокислоты с выбором вставленной аминокислоты, определенной специфической 3'-нетранслируемой структурой области и расположением кодона с двойной функциональностью в РНК-мессенджере (мРНК). Мы обнаружили, что кодон UGA указывает на введение селеноцистеина и цистеина в ресничном Euplotes crassus , что двойное использование этого кодона может происходить даже внутри одного и того же гена и что структурные механизмы мРНК Euplotes сохраняют зависимую от местоположения двойную функцию UGA, когда выраженный в клетках млекопитающих. Таким образом, генетический код поддерживает использование одного кодона для кодирования нескольких аминокислот.

Но это теоретически обосновано мной и предсказано в монографии "Волновой генетический код" (1997г.).

Работа фундаментальная, фактически доказывающая то, что авторы не заметили, а это главное - то, то следует из этой работы, биологический смысл двойного кодирования одним кодоном двух разных аминокислот, что первыми получили в эксперименте группа М.Ниренберга и самостоятельно Ф.Крик. Об этом в следующем топике. А пока пусть жуют все ту же не пережевываемую жвачку междоумия LMP, vb, старушка чайница и прочие там разные Шведы (кроме У.Лагерквиста) smile.gif
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 10:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

(Gariaev @ 29.12.2017 07:31)
Ссылка на исходное сообщение  Генетический код поддерживает целевое введение двух аминокислот одним кодоном
Антон А. Туранов 1 , * ,Лобанов Алексей Владимирович 1 , * ,Дмитрий Феменко 1 ,Хилари Г. Моррисон 2 ,Митчелл Л. Согин 2 ,Лоуренс А. Клобутчер 3 ,Dolph L. Hatfield 4 ,Вадим Николаевич Гладышев 1 , †
↵ * Эти авторы также внесли вклад в эту работу.
Просмотреть всех авторов и филиалов
Science  09 Jan 2009:
Vol. 323, выпуск 5911, стр. 259-261
DOI: 10.1126 / science.1164748
Статья
Цифры и данные
Информация и показатели
eLetters
PDF
Вы просматриваете реферат.

Посмотреть полный текст
Абстракт
Считается, что строгое взаимно однозначное соответствие между кодонами и аминокислотами является важной особенностью генетического кода. Тем не менее, мы сообщаем, что один кодон может кодировать две разные аминокислоты с выбором вставленной аминокислоты, определенной специфической 3'-нетранслируемой структурой области и расположением кодона с двойной функциональностью в РНК-мессенджере (мРНК). Мы обнаружили, что кодон UGA указывает на введение селеноцистеина и цистеина в ресничном Euplotes crassus , что двойное использование этого кодона может происходить даже внутри одного и того же гена и что структурные механизмы мРНК Euplotes сохраняют зависимую от местоположения двойную функцию UGA, когда выраженный в клетках млекопитающих. Таким образом, генетический код поддерживает использование одного кодона для кодирования нескольких аминокислот.

Но это теоретически обосновано мной и предсказано в монографии "Волновой генетический код" (1997г.).

Как всегда, гаряев смотрел в книгу , видел фигу. Никакого отношения к волногопии гапяева этот феномер не имеет. Но гаряев упорно примазывается к чужим работам.
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 10:22     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

(Gariaev @ 29.12.2017 22:13)
Ссылка на исходное сообщение  Работа фундаментальная, фактически доказывающая то, что авторы не заметили, а это главное - то, то следует из этой работы, биологический смысл двойного кодирования одним кодоном двух разных аминокислот, что первыми получили в эксперименте группа М.Ниренберга и самостоятельно Ф.Крик. Об этом в следующем топике. А пока пусть жуют все ту же не пережевываемую жвачку междоумия  LMP, vb, старушка чайница и прочие там разные Шведы (кроме У.Лагерквиста) smile.gif

Да, пля, как всегда, гаряев увидел в чужих работах невидимое, примазался к чужим результатам и объявил, что все это он предсказал 1913 году. Клоун дешевый.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 11:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

(vb @ 30.12.2017 11:22)
Ссылка на исходное сообщение  Да, пля, как всегда, гаряев увидел в чужих работах невидимое, примазался к чужим результатам и объявил, что все это он предсказал 1913 году. Клоун дешевый.

Послушай, Bolvanicus vulgaris (остаюсь в рамках нормативной лексики smile.gif), ты в генетике Кверкус ( lol.gif ), поэтому тебе следует взять хоз.тряпочку и заткнуть рот.
Чужой результат - это прямое доказательство того, о чем говорил и писал в начале 90-х. И опубликовал в моногр. Волновой ген. код. Это кодирование аминокислои и стопов 32 кодонами омонимами, т.е. кодон шифрует одновременно две разных аминокислоты или ам-к-ту и стоп. Что и показали Туранов и др. на селеноцистеине. Понял, Кверкус иберика? tongue.gif
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 12:03     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

(Gariaev @ 30.12.2017 09:49)
Ссылка на исходное сообщение  П
Чужой результат - это прямое доказательство того, о чем говорил и писал в начале 90-х.
клиника, причем эта фраза - прямое доказательство.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 12:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

(LMP @ 30.12.2017 13:03)
Ссылка на исходное сообщение  клиника, причем эта фраза - прямое доказательство.

Зашевелились, голубчики. lol.gif
Конечно, чужой. Не я же ставил эксперименты, доказывающую омонимию половины кодонов, правда на примере одного кодона. Но я дал теоретическое обоснование омонимии половины кодонов и предсказал ее еще в 1997г. в своей монографии, а Туранов и др. подтвердили это экспериментально в 2009г. Я долбил здесь мол. биол с 2004г., втолковывая это генетикам и мол. биологам.
Так что, LMP еще и еще раз показал, что он ничего не понимает и не дружит с логикой. tongue.gif
Участник оффлайн! ihlindham
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 12:52     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

Совсем недавно вышла статья украинского и испанского авторов в которой с проведением расчетов в рамках аппарата квантовой механики исследуются вопросы "воблирования" ("вобл", "качание"):

Whether 2-aminopurine induces incorporation errors at the DNA replication? A quantum-mechanical answer on the actual biological issue

In this paper, we consider the mutagenic properties of the 2-aminopurine (2AP), which has intrigued molecular biologists, biophysicists and physical chemists for a long time and been widely studied by both experimentalists and theorists. We have shown for the first time using QM calculations, that 2AP very effectively produces incorporation errors binding with cytosine (С) into the wobble (w) C·2AP(w) mispair, which is supported by the N4H⋯N1 and N2H⋯N3 H-bonds and is tautomerized into the Watson–Crick (WC)-like base mispair C*·2AP(WC) (asterisk denotes the mutagenic tautomer of the base), that quite easily in the process of the thermal fluctuations acquires enzymatically competent conformation. 2AP less effectively produces transversions forming the wobble mispair with A base – A·2AP(w), stabilized by the participation of the N6H⋯N1 and N2H⋯N1 H-bonds, followed by further tautomerization A·2AP(w) → A*·2AP(WC) and subsequent conformational transition A*·2AP(WC) → A*·2APsyn thus acquiring enzymatically competent structure. In this case, incorporation errors occur only in those case, when 2AP belongs to the incoming nucleotide. Thus, answering the question posed in the title of the article, we affirm for certain that 2AP induces incorporation errors at the DNA replication. Obtained results are consistent well with numerous experimental data.


Сообщение было отредактировано ihlindham - 30.12.2017 12:53
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 12:55     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

(Gariaev @ 28.12.2017 20:40)
Ссылка на исходное сообщение  Поскольку мне грубо закрыли доступ к моей теме в Мол. и клет биологии
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=581153 ,
продолжу её здесь.



Гаряич с Вашими идеями сюда beer.gif beer.gif beer.gif jump.gif jump.gif

https://www.encodeproject.org/

jump.gif jump.gif jump.gif
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 13:12     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

(Gariaev @ 28.12.2017 20:40)
Ссылка на исходное сообщение  Поскольку мне грубо закрыли доступ к моей теме в Мол. и клет биологии
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=581153 ,
продолжу её здесь.

теоретичесские аспекты грубого секса smile.gif
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 13:35     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

(Gariaev @ 28.12.2017 20:40)
Ссылка на исходное сообщение  Поскольку мне грубо закрыли доступ к моей теме в Мол. и клет биологии
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=581153 ,
продолжу её здесь.



про желтки наскока помню это к Спирину wink.gif

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%BF%...%B2%D0%B8%D1%87
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 13:46     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

(Gariaev @ 28.12.2017 20:40)
Ссылка на исходное сообщение  Поскольку мне грубо закрыли доступ к моей теме в Мол. и клет биологии
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=581153 ,
продолжу её здесь.

Окончил биолого-почвенный факультет МГУ (1954). beer.gif
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 14:17     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

(Gariaev @ 30.12.2017 10:33)
Ссылка на исходное сообщение   Не я же ставил эксперименты
это ключевая фраза, остальное вымыслы и домыслы
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 14:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

По тому же как ППГ хреново знает собственную монографию, есть веские основания считать, что и автор не он. Сие ж доказать невозможно, значит и не писал smile.gif
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 14:58     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #23 множественное цитирование

(Bern5 @ 30.12.2017 13:55)
Ссылка на исходное сообщение  Гаряич с Вашими идеями сюда  beer.gif  beer.gif  beer.gif  jump.gif  jump.gif

https://www.encodeproject.org/

jump.gif  jump.gif  jump.gif

Там ни гу-гу по омонимии... confused.gif
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 15:04     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #24 множественное цитирование

(LMP @ 30.12.2017 15:21)
Ссылка на исходное сообщение  По тому же как ППГ хреново знает собственную монографию, есть веские основания считать, что и автор не он. Сие ж доказать невозможно, значит и не писал smile.gif

НЕ я, значит, правильная? Через свой анус, но согласился... lol.gif
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 16:07     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #25 множественное цитирование

(LMP @ 30.12.2017 15:21)
Ссылка на исходное сообщение  По тому же как ППГ хреново знает собственную монографию, есть веские основания считать, что и автор не он. Сие ж доказать невозможно, значит и не писал smile.gif

А вы, значит, хорошо знаете, коль сравниваете. Прогресс, однако.
Участник оффлайн! Чайник556
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 16:22     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #26 множественное цитирование

Стоит тогда и обьяснить смысл работы нанопереключателя на три положения про стоп-колоны, а то все опять запутались в этих миражах от Волного Ветра
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 16:34     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #27 множественное цитирование

(Gariaev @ 28.12.2017 17:40)
Ссылка на исходное сообщение  Поскольку мне грубо закрыли доступ к моей теме в Мол. и клет биологии
враньё, просто гаряева там опустили вместе с его темой, да ещё осмелились сумневаться в учении МЭтра, тут же можно спамить безнаказанно. А доступ открыт, но Ппг же у нас трусишка
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 16:43     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #28 множественное цитирование

(Gariaev @ 30.12.2017 13:04)
Ссылка на исходное сообщение  Через свой анус, но согласился...

Ппгею виднее, как с издательством договариваться
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 17:25     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #29 множественное цитирование

(LMP @ 30.12.2017 17:34)
Ссылка на исходное сообщение  враньё, просто гаряева там опустили вместе с его темой, да ещё осмелились сумневаться в учении МЭтра, тут же можно спамить безнаказанно. А доступ открыт, но Ппг же у нас трусишка

Обнаружена ошибка

Вернуться
Сообщение форума
Описание проблемы:
Вы не можете написать ответ в эту тему
++++++
Это ответ на мою попытку дать пост в моей теме.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 17:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #30 множественное цитирование

(Чайник556 @ 30.12.2017 17:22)
Ссылка на исходное сообщение  Стоит тогда и обьяснить смысл работы нанопереключателя на три положения про стоп-колоны, а то все опять запутались в этих миражах от Волного Ветра

Обязательно. Объясню это в рамках раб. гипотезы, которая, надеюсь, найдет экспер. подтверждение. Да собственно, уже получила подтверждение в работе Туранова и др. 2009 г. Не считая работы группы М.Ниренберга и Ф.Крика 1964г о поли-У двойном кодировании фал и лей., которую не раз цитировал.
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 17:57     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #31 множественное цитирование

(Gariaev @ 30.12.2017 15:25)
Ссылка на исходное сообщение  Обнаружена ошибка

Вернуться
Сообщение форума
Описание проблемы:
Вы не можете написать ответ в эту тему
++++++
Это ответ на мою попытку дать пост в моей теме.

это вы залогиниться забыли.
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 19:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #32 множественное цитирование

(LMP @ 30.12.2017 18:57)
Ссылка на исходное сообщение  это вы залогиниться забыли.

Нет. Проверил на других форумах. Там, где постил - отказы. Где впервые - свободно.
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 19:10     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #33 множественное цитирование

(Gariaev @ 30.12.2017 20:02)
Ссылка на исходное сообщение  Нет. Проверил на других форумах. Там, где постил - отказы. Где впервые - свободно.



гаряч осознал Беседа енто единственный форум гдне не гнобят

Свободу Деточкину beer.gif beer.gif
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 20:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #34 множественное цитирование

(Чайник556 @ 30.12.2017 17:22)
Ссылка на исходное сообщение  Стоит тогда и обьяснить смысл работы нанопереключателя на три положения про стоп-колоны, а то все опять запутались в этих миражах от Волного Ветра

3-й нуклеотид в кодонах омонимах - элемент в высоко организованной СИСТЕМЕ оценки контекста (смысла его) мРНК. Предполагаю, что эта с истема - нанобиокомпьютинг белок синтезирующей системы, а может, и клетки в целом. Более подробно в моей статье http://ss69100.livejournal.com/1395594.html

К этому же вопросу параллельный: почему только омонимы являются стоп кодонами? Потому что кодоны синонимы жестко, однозначно и избыточно кодируют аминокислоты либо остановки синтеза белков, причем всеми тремя нуклеотидами и по Таблице кода, столь любимой любителями от генетики smile.gif. И никаких "виляний" за счет 3-го нуклеотида, как у омонимов. Вот это Ф.Крик не прописал в своей Вобл гипотезе. А виляния - это и есть свобода и одновременно необходимость выбора (как смысла слова КОСА) одной аминокислоты из двух разных или выбора стопа или аминокислоты. И такие ВЫБОРЫ определяются контекстами мРНК. Есть даже выборы более высокого уровня - молчать гену или не молчать (silent genes) в биоморфогенезе - т.н. "эффект положения" генов в геноме. Тоже своего рода фрактальность. Итак, 3-й воблирующий нуклеотид в кодонах омонимах просто "молчит" в акте считывания рибосомой контекста мРНК, и тогда два первых нуклеотида становятся двусмысленным (как слово КОСА), а надо выбрать один и точный смысл - аминокислоты-ли, стопа-ли. Тут и выступает контекст мРНК как носитель РЕЧЕВОГО СМЫСЛА ГЕНА, кодирующего СМЫСЛ ПОТЕНЦИАЛЬНОГО БЕЛКА. Ведь белкИ, особенно ферменты, выполняют, извините, как бы ОСМЫСЛЕННУЮ работу по регуляции сложнейших актов метаболизма, в том числе в "соображающих" нейронах головного мозга. Вот так, коротенько.
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 20:36     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #35 множественное цитирование

Ну да, помню, помню, г-н машкин, эдельвейс. Спиритуальные завихрения континуума.
кто и как мыслит в рыбосомах, фантазер?
Участник оффлайн! ihlindham
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #36 множественное цитирование

(vb @ 30.12.2017 21:36)
Ссылка на исходное сообщение  Ну да, помню, помню, г-н машкин, эдельвейс. Спиритуальные завихрения континуума.
кто и как мыслит в рыбосомах, фантазер?


ПетровичЪ пригнитесь, сейчас "грады" начнут работать.

Поехали:



The triplet genetic code had a doublet predecessor

Quantum algorithms and the genetic code

Towards understanding the origin of genetic languages

Why genetic information processing could have a quantum basis

Carbon—the first frontier of information processing

MATHEMATICAL PHYSICS AND LIFE



А это "на закуску": quantum wobble author:A author:Patel




.

Сообщение было отредактировано ihlindham - 30.12.2017 21:09
Участник оффлайн! ihlindham
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:34     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #37 множественное цитирование

Второй залп:



Deciphering synonymous codons in the three domains of life: co‐evolution with specific tRNA modification enzymes

Dual functions of codons in the genetic code

Codon size reduction as the origin of the triplet genetic code

Stop codons in bacteria are not selectively equivalent

Non-standard genetic codes define new concepts for protein engineering

UGA codon position-dependent incorporation of selenocysteine into mammalian selenoproteins

Advances in the mechanism and understanding of site-selective noncanonical amino acid incorporation

An unprecedented non-canonical nuclear genetic code with all three termination codons reassigned as sense codons

The genetic code—more than just a table

Alternative genetic code for amino acids and transfer RNA revisited

Rewriting the genetic code

Structural and molecular features of non-standard genetic codes

Nuclear codon reassignments in the genomics era and mechanisms behind their evolution

The genetic code has a 'shift'key

How tRNAs dictate nuclear codon reassignments: Only a few can capture non-cognate codons

Double-Faced Code

Genetic code flexibility in microorganisms: novel mechanisms and impact on physiology
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:38     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #38 множественное цитирование

(vb @ 30.12.2017 21:36)
Ссылка на исходное сообщение  Ну да, помню, помню, г-н машкин, эдельвейс. Спиритуальные завихрения континуума.
кто и как мыслит в рыбосомах, фантазер?

"Рыбосомы" в твоей голове, Амвро́сий Амбруа́зович Выбега́лло, точно не мыслят. smile.gif
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #39 множественное цитирование

(ihlindham @ 30.12.2017 22:34)



не страшно


https://www.nature.com/articles/s41467-017-01251-7


wink.gif
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:46     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #40 множественное цитирование

(ihlindham @ 30.12.2017 22:34)



в Кейптаунском порту с пробоиной в борту Жанетта поправляла такелаж
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:46     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #41 множественное цитирование

(ihlindham @ 30.12.2017 22:02)


Вызываю огонь на себя. Первая градина хороша: "Молекулярная биология - это нанотехнология, которая работает - она ​​работает миллиарды лет и в
самых разных условиях." В остальных (по диагонали) о кодировании и выборах в аспекте "два из трёх" - Н И Ч Е Г О.

Сообщение было отредактировано Gariaev - 30.12.2017 21:48
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:52     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #42 множественное цитирование

(Gariaev @ 30.12.2017 22:46)
Ссылка на исходное сообщение  Вызываю огонь на себя. Первая градина хороша: "Молекулярная биология - это нанотехнология, которая работает - она ​​работает миллиарды лет и в
самых разных условиях." В остальных (по диагонали) о кодировании и выборах в аспекте "два из трёх" - Н И Ч Е Г О.


http://pishi-stihi.ru/syn-artillerista-simonov.html
Участник оффлайн! ihlindham
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 21:54     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #43 множественное цитирование

Петрович, во всех приведенных статьях (из первого залпа) автор пишет о wobbl. Внимательно почитайте .

Все статьи есть в открытом доступе - вбивайте название сюда

http://scholar.google.com/

и открывайте.

Суть в том что этот автор (Patel) объясняет wobbl с позиции квантовой теории

Сообщение было отредактировано ihlindham - 30.12.2017 23:13
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 22:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #44 множественное цитирование

(ihlindham @ 30.12.2017 22:54)
Ссылка на исходное сообщение  Петрович, во всех приведенных статьях (из первого залпа) автор пишет о wobbl. Внимательно почитайте .

Все статьи есть в открытом доступе - вбивайте название сюда

http://scholar.google.com/

и открывайте.

Суть в том что этот автор (Patel) объясняет  wobbl с позиции квантовой теории
Искренне Ваш

Игорь



http://nsovetnik.ru/ugolovnaya_otvetstvenn...nie_maloletnih/
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  30.12.2017 22:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #45 множественное цитирование

(Bern5 @ 30.12.2017 23:08)



https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A0%D0%B8%...%B0%D0%B2%D0%BE
Участник оффлайн! Gariaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 23:06     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #46 множественное цитирование

(ihlindham @ 30.12.2017 22:54)
Ссылка на исходное сообщение  Петрович, во всех приведенных статьях (из первого залпа) автор пишет о wobbl. Внимательно почитайте .

Все статьи есть в открытом доступе - вбивайте название сюда

http://scholar.google.com/

и открывайте.

Суть в том что этот автор (Patel) объясняет  wobbl с позиции квантовой теории
Искренне Ваш

Игорь

Это нужный аспект. Но в бесконечном ареале свойств белкового кода меня интересует, с моей точки зрения главное, это ментальное-речевое его измерение. Ведь в начале было мысле-слово.
Участник оффлайн! ihlindham
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 23:17     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #47 множественное цитирование

(Gariaev @ 31.12.2017 00:06)
Ссылка на исходное сообщение  Это нужный аспект. Но в бесконечном ареале свойств белкового кода меня интересует, с моей точки зрения главное, это ментальное-речевое его измерение. Ведь в начале было мысле-слово.


Human Development VIII: A Theory of “Deep” Quantum Chemistry and Cell Consciousness: Quantum Chemistry Controls Genes and Biochemistry to Give Cells and Higher Organisms Consciousness and Complex Behavior

Deep quantum chemistry is a theory of deeply structured quantum fields carrying the biological information of the cell, making it able to remember, intend, represent the inner and outer world for comparison, understand what it “sees”, and make choices on its structure, form, behavior and division. We suggest that deep quantum chemistry gives the cell consciousness and all the qualities and abilities related to consciousness. We use geometric symbolism, which is a pre-mathematical and philosophical approach to problems that cannot yet be handled mathematically. Using Occam’s razor we have started with the simplest model that works; we presume this to be a many-dimensional, spiral fractal. We suggest that all the electrons of the large biological molecules’ orbitals make one huge “cell-orbital”, which is structured according to the spiral fractal nature of quantum fields. Consciousness of single cells, multi cellular structures as e.g. organs, multi-cellular organisms and multi-individual colonies (like ants) and human societies can thus be explained by deep quantum chemistry. When biochemical activity is strictly controlled by the quantum-mechanical super-orbital of the cell, this orbital can deliver energetic quanta as biological information, distributed through many fractal levels of the cell to guide form and behavior of an individual single or a multi-cellular organism. The top level of information is the consciousness of the cell or organism, which controls all the biochemical processes. By this speculative work inspired by Penrose and Hameroff we hope to inspire other researchers to formulate more strict and mathematically correct hypothesis on the complex and coherence nature of matter, life and consciousness.
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 23:35     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #48 множественное цитирование

(ihlindham @ 31.12.2017 00:17)



читай журнал Хочу Все Знать на СТС
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 23:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #49 множественное цитирование

(ihlindham @ 31.12.2017 00:17)

инхтлд ХАМ нрскока ронял енто к ХОХ лам lol.gif lol.gif lol.gif
Участник оффлайн! Bern5
Участник



 прочитанное сообщение 30.12.2017 23:45     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #50 множественное цитирование

(ihlindham @ 31.12.2017 00:17)


понимаете девушка я 40 лет женат shuffle.gif
   *
« Предыдущая тема · Мусорница · Следующая тема »
Добавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 16.04.24 07:36
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft