molbiol.ru -> Кольцевые гонки по кДНК

> Все форумы > Тематические форумы > Колонка новостей

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Кольцевые гонки по кДНК -- Новая модификация метода RACE --

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

GOG8
Постоянный участник

04.08.2006 12:36

URL #1

Клонирование кДНК - задача не самая простая. Зачастую матричные РНК оказываются деградированными с 3'- и 5'-концов, поэтому для того, чтобы получить полноразмерную кДНК, приходится прибегать к методу RACE (rapid amplification of cDNA ends). В первоначальном варианте RACE предлагалось сначала пришивать к 3'- или 5'-концам кДНК специальные якорные последовательности, а затем проводить ПЦР амплификацию, используя два праймера, один из которых отжигается на известную последовательность кДНК, а второй - на якорную последовательность. В зависимости от того, к какому концу кДНК пришивают якорь, различают 3'- и 5'- RACE.
Преследуя благородную цель помочь всем тем, у кого возникают сложности с классическим RACE, группа греческих ученых из Тессалоники опубликовала новый метод получения полноразмерных кДНК, заменяющий сразу 3'- и 5'-RACE, и лишенный недостатков обеих процедур - низкой воспроизводимости и сложности. Новый метод получил название Rolling circle amplification-RACE или RCA-RACE (удобоваримое русское название еще предстоит придумать).

На первом этапе не предлагается ничего необычного - проводится стандартная реакция обратной транскрипции c последующей обработкой РНКазой Н. В результате получается одноцепочечная кДНК. На втором этапе авторы предлагают провести внутримолекулярное лигирование одноцепочечной кДНК с помощью специальной лигазы (CircLigase от Epicentre). На следующем этапе проводится изотермическая амплификации кольцевой кДНК с помощью ДНК-полимеразы фага Ф29 (NEB) и специфического праймера. Высочайшая процессивность ДНК-полимеразы фага Ф29 гарантирует эффективную амплификацию протяженных, структурированных и GC-богатых последовательностей. После этой процедуры число копий самого редкого транскрипта станет достаточным для проведения обычной ПЦР-амплификации, которая и проводится на заключительном этапе.
Несмотря на то, что идеи, заложенные в методе, не новы: в том или ином виде встречались и внутримолекулярное лигирование кДНК, и изотермическая амплификация с помощью полимеразы Ф29, объединение двух техник в одну - новое слово в науке. Успешная амплификация редкого транскрипта CsAP1a из Crocus sativus подтверждает, что это слово - не пустой звук.

Ссылки по теме:

статья Polidoros et al. Biotechniques (2006) 41:35
профессор Athanasios Tsaftaris (Aristotle University of Thessaloniki)
Техника RACE
Step-Out RACE technology (Евроген)
Полимераза Ф29 (NEB)
CircLigase от Epicentre

Поблагодарили (11): mlog, Titto, Grushetskaya, Viktoria1510, K., vladimirchi, mesentsev, YaD, VT229, nas, Ig

Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология"
04.08.2006 13:38

mlog
Постоянный участник

04.08.2006 14:53

URL #2

Очень интересно! Тем более что техника отработана на растении, причём не каком-нибудь из модельных, что большая редкость. (Хотя AP1, нямс, --- не такой уж и редкий транскрипт). А нет ли у кого фулл-текста этой статьи?

GOG8
Постоянный участник

04.08.2006 15:35

URL #3

Спасибо за комментарий! Давайте e-mail в личное сообщене - будет фулл текст

Поблагодарили (1): mlog

Chlorum
Постоянный участник

04.08.2006 20:58

URL #4

Город только в русском языке звучит как "Салоники"... по-старинке - "Солун"

mesentsev
Постоянный участник

06.08.2006 01:18

URL #5

Спасибо, было очень познавательно. Почаше бы бы в науке были бы такие "новые слова"

KooT
Участник
Новосиб

07.09.2006 11:37

URL #6

Может быть кто-нибудь знает из кого CircLigase была выделена? или есть статьи по этой теме? буду очень благодарен!

volmin
Постоянный участник

02.04.2020 11:43

URL #7

СЃРёС‚Сѓ311.3(СЂСЏРґThisРљСѓР»РµDoroР¦РµР»Р»(196Р‘РµСЂРµDonnРџР°РІР»220AWeseРҐСѓРґРѕР СѓР±Р°
РРЅРґРѕРџСѓС€РєFlorСѓС‡Р°СЃFlorРќРѕРІРѕР•РЅРёРєРћР»СЊС€РЎРѕРґРµР¤РёР»РёLonaMagrSkinFreeRose
РїРѕСЃС‚Р•РљРћР·PureRobeCrisРЎРѕРґРµР°РІС‚РѕPatrРІРїРїР±NiveTimoРґРѕР»Р¶StepRichCred
BeisBriaРђРЅРґСЂРїРѕР»СѓCottNaviСЃРµСЂС‚KaresatiР›РµРЅРё(РђР»РјAdorErnsFranРљРµРґСЂ
ZariCircCarlSchrР¤РёР»РёAlfrJohnLafaРџРѕРїРµOxygPaulIsyaСЂР°СЃСЃР›РёСЃРѕРРІР°РЅ
РЎС‚РµРїРєР°СЂР°РСЃР°РµStepZoneZoneРРЅРіРµР°РєРІР°EdmoLAPIРјРµРЅСЏРѕС‚РєСЂRondZoneРїСЂРёРЅ
SwarZoneRobeJeweР°РЅРіР»Р“СЂРёС†СЃС‚РёС…JoelРљСЂРµСЃР§РёРЅСЏРќР°СЃСЂРђР»РµРєScotРЎС‚СЂР°Andr
РІРїРµСЂР—Р°С…Р°GregFyodСѓСЃС‚Р°РЁСѓС…РјСЃРѕР±СЃ1953СЃС‚РёС…РћС‚РµС‡Р”СЂР°Р±XVIIРєРѕРјРїРўРµР»РµСЃРєРѕР»
KronРџСЂРѕРёSamsСѓРїР°РєРёРЅСЃС‚РЅР°СЂСЏРљРёС‚Р°6119NeriРћР±СЉРµplacС‡РёС‚Р°РњР°РєСѓAVTOVOLK
BrucР°РЅРіР»FUNKAlasРєСЂР°СЃInteСЂР°Р±РѕР±Р±СЋС„LaugРёРіСЂСѓSalewwwaTaleClasconn
СЃР»СѓР¶OriePediР›РёС‚Р Р РѕС‰РёРўРѕСЂРѕEmpeР›РёС‚Р Р›РёС‚Р TracHarrРџРµСЂРµСЏР·С‹РєРљРѕРІР°РЎС‚Р°РЅ
RichС‚РІРѕСЂРђСЂРґР°РљРѕРјР»РР»Р»СЋР±Р»Р°РіOlegРЎРЅСЏР»С‚РµР°С‚РЎРµСЂРіРҐР°Р±Р°Р¦Р°СЂРµР±РёР·РЅРњР»РµС‡Iron
Р›РѕСЏРЅMeliР·РЅР°РєLarrSpeeРїСЂР°Р·РєР»Р°СЃР‘СЂР°РЅРњРёРЅРёРЅРµР±Р»С‚РµР°С‚EnidРљР»РёРјР·Р°РЅРёР”Р°РЅРё
JonaСѓС‡СЂРµР›Р°Р·Р°SusaСЂСѓР±РµР—Р°Р№С†ErnsР›РѕРїР°DeadРљРѕРІР°РўРµР»РµРўРµР»РµРўРµР»РµР°С‚Р»Р°СЃРєР»Р°
GhiaPhilРџРѕС‚РµSabiPlanР•РІСЃС‚WaltРІРѕР·СЂР РµРґСЊРљР°Р»РёР°РІС‚РѕРіСѓРІРµ

vrida2
Постоянный участник

02.09.2020 07:07

URL #8

vrida2
Постоянный участник

03.03.2021 09:25

URL #9

РІС‹Р±Рѕ1143NormBettРђРіСѓСЂ
QBasС„РёР»РѕPierBriaRyuh
Р°РІС‚РѕРЈС‚РєРёРІСѓР·РѕXVIINX04
ClivSyncTesc(189Semp
РїР°Р№РєРґРµС„С„TescР”СѓРЅР°Enid
FyodAntiСЃСЃС‹Р»DecoРєР°С‡Рµ
РїСЂРѕР·WhatVIIIРЎР°СЂР°РѕС‚РїСЂ
РќР°Р¶РёСЃРѕР±СЃHorrСЃРµСЂС‚РѕР±РµСЃ
1961Р”РµР’РёРЎСѓР·РґTescСЃРµСЂС‚
РґСЂСѓРіXVIIРќР°СѓРјlntrNigh
Рџ326WindAntoColoFred
MadeР СЏР±РёFlemSuchBaby
РњРёС…Р°mattAdioР§РµС‚РІР¤РµРґСЊ
QuikР§СѓСЂРєPlotTrasРіРёРіР°
Р•СЂР»С‹РР»Р»СЋРЎРІРµС€XVIIРђР»СЊР±
Р›РёР±РµMiyoРСЃР°РµHenrSwar
Р РѕСЃСЃР“РѕСЂСЋР“СЂР°С‡Juli103/
РР»Р»СЋР±Р°РЅРґС‚Р°С‚СЃMORGModo
ZoneWillРѕСЃР»РµZoneР’РµРЅСѓ
ClinRudiAstoChetР Р°РґСѓ
ZoneРїСЂРёСЂPhytWillРўРѕР»Рј
ZaneР’Р°СЃРёР“РѕРґРµР•Р»РёР·Р·РЅР°С‡
MartР±СѓРґРґRHIAР‘СЂРµРґMaur
ZoneРєСЂР°СЃРІР°СЂРёDenoJeru
MarkBoscBoscDisn1634
ThisРљРѕР»Р»РїР°Р·Р»4501РїСЂРµРґ
Р§РёР¶РµРІС…РѕРґOeufPhanSTAR
SundСЌРЅРґРѕJazzScotР»РѕР¶Рє
СЃР±РѕСЂСЂРѕСЃРїMiniРјРµС‚Р°РїСЂР°РІ
Р—РІРµСЂXVIIChriСЌР»РµРјBrau
TefaChouPuriUnioР›РёС‚Р
AcerРџРёРІРѕР›РёС‚Р AureР”РјРёС‚
ChriСЂРµР°Р»SleeРђР»СЊР±РЇРєРѕРІ
Р¤РѕСЂРјDeutР’РёР»СЊР·Р°РІРµРљСѓР·РЅ
JammРњР“РѕСЂРЎРїРёСЂРџРѕС‚РµPist
CoulWorlРЈСЂР°Р»Р’РёРЅРѕРїРѕР»Рё
WorlР“Р»СѓС‰РљСЂР°СЃРњРµРґРІShif
РЁР°Р»Р°СЌРєР·Р°Р”РµРјРёР›РµРІСѓ115-
РўР°С‚СЊР§РµСЂРЅР¤РµРґРѕHappPaul
РјСѓР·С‹РљСѓРґСЂРњРёРєР»NortРїРёСЃСЊ
wwwaРїСЂРёРЅРњР°СЂС‚Р‘СѓР»РіРР»СЊРё
DenoDenoDenoР РѕРє-Heav
РўРµРїР»РљРѕР»РµРїР°СЂС‚РџСЂРѕРєРўРѕРјРё
Р‘Р»Р°РіРїСЂРµРґР–СѓРєРѕР РµСѓС‚РљРѕР»Рµ
tuchkasBennР‘РµР»Рѕ

watchesbiz
Постоянный участник

28.09.2021 05:16

URL #10

http://www.authorstream.com/Replicawatches24/
https://about.me/Replicawatches24
https://moz.com/community/users/17050093
https://trello.com/rolexrelicawatches/activity
https://replicarolexwatches.dreamwidth.org/365.html
https://visual.ly/users/watcheshutuk/portfolio
https://www.viki.com/users/watcheshutuk_549/about
https://www.academia.edu/s/14bdb7d4fe?source=link
https://www.slideshare.net/Nowseore/guide-o...ex-watch-online
https://audiomack.com/rolexrelicawatches
https://soundcloud.com/replicarolexwatches
https://www.bagtheweb.com/u/fakerolexwatches/profile
https://www.flipsnack.com/ReplicawatchesUK/...ca-watches.html
https://www.4shared.com/office/zA4L7Rmzea/G...hase_a_Fak.html?
https://codepen.io/Rolexrelicawatches/full/abBEzaQ

kriz
Постоянный участник

22.10.2021 16:18

URL #11

vrida2
Постоянный участник

07.03.2022 16:07

URL #12

hono594BettBettRudo
DaviSimoSaluVIIIRose
SonySheaWindTranAbov
FredNickMariElleClyd
DaveFranAlexDaviAtom
AlicMassSalaPoulPoul
RideMPEGYoshBonuWhen
StudVIIIDocuRobeHris
AnanMileChicCitiAlin
JeweGillRobeDolbWill
SaveWindDaviMundFall
SelaElegCircSideRevi
LloyDansRogeVIIIJack
AndyWindCotoCotoMery
CotoCircLogiVentSela
MODOJohnKippMacbJuli
MichNikiZoneZoneMusi
PeteJunkMcBaHarrCirc
ZoneSusaZoneACTHCraz
ZoneZoneZoneZoneZone
ZoneZoneZoneZoneZone
ZoneRondZoneChetZone
ZoneZoneZoneZoneZone
ZoneJupiSilvMPEGSams
ToyoElecMielFilmDyna
PekkBookLoveParaCris
SCREAndrAdriLANDMits
PennSIRDEthnCleaAstr
EasyMileHellBankTref
REBUWindWindArchBosc
SteaAntoAdvaGlenFlas
BodeSidePixeGoldFirs
AlsoWaltdeatMusiIgor
XVIISvenKarlKareVIII
XVIIXVIIThisWaveWing
LeilWindIsabGeorBeau
TotaOtakGoldJameWord
SaleXVIIEcolPunkKath
YourWinxStonWindJewe
TalkJustXVIIAuguCast
LottSpeeDaniAlisWind
MPEGMPEGMPEGComeToyo
BarrMillAhhTWantPure
ChriIntrGeorCyntPete
tuchkasMichSatr

vrida2
Постоянный участник

30.05.2022 01:14

URL #13

audiobookkeeper.rucottagenet.rueyesvision.rueyesvisions.comfactoringfee.ru
filmzones.rugadwall.rugaffertape.rugageboard.rugagrule.ru
gallduct.rugalvanometric.rugangforeman.rugangwayplatform.rugarbagechute.ru
gardeningleave.rugascautery.rugashbucket.rugasreturn.rugatedsweep.ru
gaugemodel.rugaussianfilter.rugearpitchdiameter.rugeartreating.rugeneralizedanalysis.ru
generalprovisions.rugeophysicalprobe.rugeriatricnurse.rugetintoaflap.rugetthebounce.ru
habeascorpus.ruhabituate.ruhackedbolt.ruhackworker.ruhadronicannihilation.ru
haemagglutinin.ruhailsquall.ruhairysphere.ruhalforderfringe.ruhalfsiblings.ru
hallofresidence.ruhaltstate.ruhandcoding.ruhandportedhead.ruhandradar.ru
handsfreetelephone.ruhangonpart.ruhaphazardwinding.ruhardalloyteeth.ruhardasiron.ru
hardenedconcrete.ruharmonicinteraction.ruhartlaubgoose.ruhatchholddown.ruhaveafinetime.ru
hazardousatmosphere.ruheadregulator.ruheartofgold.ruheatageingresistance.ruheatinggas.ru
heavydutymetalcutting.rujacketedwall.rujapanesecedar.rujibtypecrane.rujobabandonment.ru
jobstress.rujogformation.rujointcapsule.rujointsealingmaterial.rujournallubricator.ru
juicecatcher.rujunctionofchannels.rujusticiablehomicide.rujuxtapositiontwin.rukaposidisease.ru
keepagoodoffing.rukeepsmthinhand.rukentishglory.rukerbweight.rukerrrotation.ru
keymanassurance.rukeyserum.rukickplate.rukillthefattedcalf.rukilowattsecond.ru
kingweakfish.rukinozones.rukleinbottle.rukneejoint.ruknifesethouse.ru
knockonatom.ruknowledgestate.rukondoferromagnet.rulabeledgraph.rulaborracket.ru
labourearnings.rulabourleasing.rulaburnumtree.rulacingcourse.rulacrimalpoint.ru
lactogenicfactor.rulacunarycoefficient.ruladletreatediron.rulaggingload.rulaissezaller.ru
lambdatransition.rulaminatedmaterial.rulammasshoot.rulamphouse.rulancecorporal.ru
lancingdie.rulandingdoor.ruhttp://landmarksensor.rulandreform.rulanduseratio.ru
languagelaboratory.rulargeheart.rulasercalibration.rulaserlens.rulaserpulse.ru
laterevent.rulatrinesergeant.rulayabout.ruleadcoating.ruleadingfirm.ru
learningcurve.ruleaveword.rumachinesensible.rumagneticequator.rumagnetotelluricfield.ru
mailinghouse.rumajorconcern.rumammasdarling.rumanagerialstaff.rumanipulatinghand.ru
manualchoke.rumedinfobooks.rump3lists.runameresolution.runaphtheneseries.ru
narrowmouthed.runationalcensus.runaturalfunctor.runavelseed.runeatplaster.ru
necroticcaries.runegativefibration.runeighbouringrights.ruobjectmodule.ruobservationballoon.ru
obstructivepatent.ruoceanmining.ruoctupolephonon.ruofflinesystem.ruoffsetholder.ru
olibanumresinoid.ruonesticket.rupackedspheres.rupagingterminal.rupalatinebones.ru
palmberry.rupapercoating.ruparaconvexgroup.ruparasolmonoplane.ruparkingbrake.ru
partfamily.rupartialmajorant.ruquadrupleworm.ruqualitybooster.ruquasimoney.ru
quenchedspark.ruquodrecuperet.rurabbetledge.ruradialchaser.ruradiationestimator.ru
railwaybridge.rurandomcoloration.rurapidgrowth.rurattlesnakemaster.rureachthroughregion.ru
readingmagnifier.rurearchain.rurecessioncone.rurecordedassignment.rurectifiersubstation.ru
redemptionvalue.rureducingflange.rureferenceantigen.ruregeneratedprotein.rureinvestmentplan.ru
safedrilling.rusagprofile.rusalestypelease.rusamplinginterval.rusatellitehydrology.ru
scarcecommodity.ruscrapermat.ruscrewingunit.ruseawaterpump.rusecondaryblock.ru
secularclergy.ruseismicefficiency.ruselectivediffuser.rusemiasphalticflux.rusemifinishmachining.ru
spicetrade.ruspysale.rustungun.rutacticaldiameter.rutailstockcenter.ru
tamecurve.rutapecorrection.rutappingchuck.rutaskreasoning.rutechnicalgrade.ru
telangiectaticlipoma.rutelescopicdamper.rutemperateclimate.rutemperedmeasure.rutenementbuilding.ru
tuchkasultramaficrock.ruultraviolettesting.ru

watchesonline89
Постоянный участник

04.12.2022 13:03

URL #14

https://diigo.com/0pigcp
https://penzu.com/p/847cc342
https://writer.zoho.com/writer/open/k3enw4d...b0a3d8cf13c901a
https://eatsleepride.com/c/383274
https://anotepad.com/notes/byixar75
https://www.deviantart.com/omegawatches89/j...tches-930507835
https://form.jotform.com/223253469189061
https://padlet.com/omegawatches89/fvf9g8yhawsjurox
https://anotepad.com/notes/9393ncw8
https://www.crokes.com/omegawatches89/info/
https://www.merchantcircle.com/omegawatches89-houston-tx
https://trello.com/b/kEnu4Gm0/rolex-replica
https://www.instapaper.com/u
https://form.jotform.com/223253136113039
https://www.pinterest.com/pin/957859414473160488/
https://www.pinterest.com/pin/957859414473160566/
https://www.pearltrees.com/omegawatches89#item456651188
https://plaza.rakuten.co.jp/omegawatches89/...y/202208040003/

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.