Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Коллеги,помогите разрешить спор | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 06.01.2018 15:44 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1699601 |
Ответов: 12 |
Просмотров: 4 910
(Angarad @ 25.11.2017 09:02) 1.)Пиросеквенирование-тот же электрофорез,поэтому все работы по подготовке плашки с реагентами для пиромарка и катриджей к нему можно делать на открытом воздухе,а не в ламинар-боксе 2.)Ампликоны-не ДНК,нечего их бояться,какая контаминация,о чем вы вообще 3.)Все растворы для станции можно использоваться несколько раз подряд,ничего не будет,зачем менять,у вас все чисто будет 1) не понял, причем тут форез. а так да, можно и в боксе делать, можно и вне. 2) бред, ИМХО. ДНК засраться - надо приложить некоторые усилия, а вот ампликонами - запросто 3) можно. ничего там не контаминируется. даже если в промывочные растворы попадет толика ампликона с сефарозы, все равно, его концентрация будет такой ничтожно малой, что никак в последующих циклах пиросеквенирования себя не проявит. ЗЫ: а техник - девочка? можно имя... |
BioNumerics | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 15.12.2015 16:53 |
Софт |
link: #1594339 |
Ответов: 6 |
Просмотров: 7 883
при понимании того, что вам нужно сделать,хватает триальной полнофункциональной версии
|
секвенатор 3130 ABI | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 24.11.2015 16:57 |
Софт |
link: #1590572 |
Ответов: 2 |
Просмотров: 1 761
decoder
|
Безопасность в ПЦР - лаборатории | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 14.09.2015 08:40 |
Организация работы группы/лаборатории |
link: #1578181 |
Ответов: 7 |
Просмотров: 7 589
про ампликоны тоже есть документы(МУ 1.3.2569-09например): там и написано, что можно выносить а что нельзя
|
сравнение амплификаторов | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 24.07.2015 05:23 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1567553 |
Ответов: 28 |
Просмотров: 8 437
воспроизводимость и сертифицируемость - это объем, а не количество лунок. это раз.
робот конечно лучше, особенно в диагностике, кто бы спорил.он же всегда будет ошибаться одинаково. это два. ПЦР - это не только мастер-микс, но еще и пробы например. которые прекрасно пакуются и хранятся, а потом и разносятся из 386 8-каналкой хоть куда. это три за.....@ли некомпетентные теоретики. это четыре. |
сравнение амплификаторов | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 23.07.2015 16:58 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1567479 |
Ответов: 28 |
Просмотров: 8 437
А вы, окромя ПЦР, ничего в плашках не делаете?
Я их много для чего использовал, не только ПЦРил. |
сравнение амплификаторов | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 23.07.2015 07:39 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1567435 |
Ответов: 28 |
Просмотров: 8 437
ну, нормальные там объемы, мкл 80 точно упаковывается. И чем ее еще раскапывать, если нет робота? Только 8-каналкой.
Да, работал в таком формате, говорю, что знаю и знаю, о чем говорю :-) |
сравнение амплификаторов | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 20.07.2015 05:49 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1566981 |
Ответов: 28 |
Просмотров: 8 437
если эта рутинная работа связана не с научно-исследовательской деятельностью, а с диагностикой, то не парьте мозги ни себе, ни людям всякими ТТХ амплификаторов, адаптациями и оптимизациями!
Просто смотрите, какие прописаны и одобрены производителями ваших тест-систем. А потом прикидывайте ваши потоки и объемы: большие - см плашечные, поменьше - можно и на роторе поделать |
Хранение ДНК | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 01.07.2015 10:23 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1563632 |
Ответов: 67 |
Просмотров: 20 584
препарат нечистый, похоже.
депуринизация оснований, вот и валится все после нагрева. ЗЫ: а вообще, нифига тему подняли! с 10 года |
Фотографии и путешествия | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 30.04.2015 18:27 |
Беседа |
link: #1550499 |
Ответов: 2660 |
Просмотров: 265 148
|
Rotor Gene 6000 | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 23.04.2015 04:35 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1549208 |
Ответов: 8 |
Просмотров: 2 623
в течение, наверное, полутора лет наблюдаю, как Axygen 1,5 мл в центрифуге лопается! В обычной фуге, Миниспин, на максимальных оборотах. Хряь,хрясь - и потекло.
|
очистка продуктов сиквенсовой реакции | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 22.04.2015 10:41 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1549038 |
Ответов: 14 |
Просмотров: 3 725
(nfc @ 22.04.2015 07:42) Масштаб у нас действительно не такой, что бы работать в плашечном формате со спиртом (да и нормальной плашечной центрифуги нет). так в первом сообщении вроде написали, что вам нужно много секвенировать... А по поводу колонок: а вы не боитесь, что короткие фрагменты, получающиеся в процессе сиквенса, будут у вас улетать со свистом? Буфер подбирать запаритесь! Механика ПЦР-нцх колонок и колонко сиквенсных вроде бы разная должна быть! ПЦР - связать фрагмент относительно большого размера, позволив мелочи, праймерам и димерам улететь. А Сиквенс главное обессолить. ИМХО, лучше не изобретать велосипед, а пользоваться проверенными методами 1. биг дай - самый лучший вариант. 2. колонки центрисеповские - отлично для штучных проб. 3. для плашечного формата юзаю спирт-ЭДТА очистку. |
очистка продуктов сиквенсовой реакции | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 22.04.2015 04:22 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1548997 |
Ответов: 14 |
Просмотров: 3 725
|
Лондон месяц летом | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 27.03.2015 18:57 |
Европа и Англия |
link: #1543273 |
Ответов: 2 |
Просмотров: 8 425
Привет, коллеги!
Где бы в Лондоне месяц пожить (июль или август)? Бюджет - до 1000 фунтов Сингл, с удобствами. Кухню можно общую. Интернет, само собой. на парковку пофиг. Районы - Челси, Кенсингтон, Хаммерсмит, Вестминстер. Спасибо заранее |
микрогпипетки и наконечники | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 15.01.2015 17:37 |
Беседа |
link: #1527291 |
Ответов: 24 |
Просмотров: 4 912
цены на Rainin астрономические. Один наконечник - один бакс. Только оригинальный пластик подходит.
Но чертовски хорош, что и говорить.... Это я про пластик. Сами дозаторы мне не очень понравились: веса в них не хватает, что ли. |
художественный проект по завозу крыс в Лувр | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 05.08.2014 04:11 |
Беседа |
link: #1498792 |
Ответов: 9 |
Просмотров: 1 819
|
Секвенатор ABI prism 3500 | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 24.07.2014 16:30 |
Организация работы группы/лаборатории |
link: #1496592 |
Ответов: 20 |
Просмотров: 9 846
Прибору норм, а вот полимер сдыхает на порядок быстрее: кристаллизуется, падает его разделяющая способность. Буферы испаряются активно
|
Жилье в Сиднее | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 08.06.2014 10:49 |
Другие страны |
link: #1489228 |
Ответов: 9 |
Просмотров: 10 729
lДа, уже вценили... ценники еще без комуналки, да квартиры без мебели.
Правда, в ренту могут входить всякие приятные плюшки, типа бассейна или фитнесса в доме Блин, это же какие у них там зарплаты, если живут счастливо... |
Жилье в Сиднее | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 05.06.2014 16:39 |
Другие страны |
link: #1488776 |
Ответов: 9 |
Просмотров: 10 729
Здравствуйте, друзья.
Сестра поступила в сиднейский универ. Встал вопрос, какой вариант жилья выбрать. Что-то не можем понять: действительно в кампусе 2000 AUD месяц стоит!???? |
Регенерация капилляров | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 25.02.2014 11:08 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1470049 |
Ответов: 42 |
Просмотров: 12 873
4337456 Набор реагентов для секвенирования ДНК ABI PRISM ® BigDye ® Terminator v3.1 Ready Reaction Cycle Sequencing Kit, 1000 реакций 601 893,50 руб.
|
Умер Фредерик Сенгер | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 22.11.2013 04:45 |
Беседа |
link: #1449307 |
Ответов: 6 |
Просмотров: 1 675
Этот человек явно все успел. Очень успешно потрудился, а потом, памятуя о том, что после определенного возраста тормозящее влияние в какой-либо области деятельности прямо пропорционально предшествующему вкладу в эту же область, просто свалил. И посвятил жизнь семье и хобби.
|
Фотографии и путешествия | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 13.11.2013 07:07 |
Беседа |
link: #1446449 |
Ответов: 2660 |
Просмотров: 265 148
А мои путешествия временно закончились (хотя, по правде, как сказать)
Зато материала для фотографий теперь вагон |
45 мышей, 15 гекконов, 6-8 монгольских песчанок, 20 улиток | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 25.05.2013 10:46 |
Беседа |
link: #1409312 |
Ответов: 11 |
Просмотров: 3 172
прошу почтить память героически погибших животных вставанием....
|
Полимер кристаллизовался в камере насоса для подачи полимера | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 04.05.2013 17:35 |
Молекулярная и клеточная биология |
link: #1405742 |
Ответов: 3 |
Просмотров: 2 032
water wash делайте. водичку берите теплую (до 40) и прогоните процедуру несколько раз
|
Анекдоты | |
afanasev-max Постоянный участник Irkutsk-Moscow-Irkutsk |
Отправлено: 05.02.2013 15:48 |
Беседа |
link: #1384072 |
Ответов: 7034 |
Просмотров: 904 003
|
страницы (82): 1 2 3 > » |
Есть новые сообщения Нет новых сообщений Тема с вашим участием |
Горячая тема (есть новые сообщений) Горячая тема (нет новых сообщений) Важная тема |
Опрос — есть новые голоса Опрос — нет новых голосов Опрос с вашим участием |
Объявление Закрытая тема Перемещённая тема |