Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Технологии секвенирования следующего поколения. -- Куда двигаться дальше? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Чёрный список: R-J-Dio, hopfen, valiksharov, guest0008, kadik sharoff, Bern8
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 28.12.2018 11:00     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(banned sceptique-NMRguy @ 28.12.2018 08:21)
Ссылка на исходное сообщение  Они и Сибэнзим теперь продают!! Ааааа!!!!  jump.gif
А это вообще невероятно: https://helicon.ru/brends/syntol/  mol.gif  jump.gif

Зато от Thermo отказались frown.gif теперь не знаю как свои любимые фьюжены покупать. frown.gif
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 31.12.2018 11:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

В ноябре стартовала программа тотального секвенирования геномов всех (1,5 млн.) видов эукариот:
https://www.sanger.ac.uk/news/view/launch-g...plex-life-earth
Правда, это не более чем голая идея, предлагающая объединить усилия мирового сообщества под общим флагом. Но замахнулись эти товарищи неплохо. Тем более, что стоимость этого удовольствия оценивается всего в $4,7 млрд. wink.gif
"То ли еще будет, ой-ёй-ёй !" tongue.gif

С наступающим Новым годом! beer.gif beer.gif beer.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): banned sceptique-NMRguy
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.04.2019 19:04     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Удалил. А программу конференции можно оставить?

Файл/ы:

скачать файл ___________2019__09_04_.doc
размер: 46.5к
кол-во скачиваний: 15


Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 12.04.2019 11:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Генсек, оставь презентацию - кому мешает ссылка-то? Если УФлазарю хочется поэксгибиционировать своими публикациями (к тому же не относящимися к теме ветки) - для этого есть "Беседа".
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.04.2019 14:09     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

O.K.

Секвенирование - 2019:
https://yadi.sk/i/9fi8glATPB3Org

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): semi, dk
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 14.04.2019 21:39     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Ещё раз решил выложить программу конференции. На сей раз в формате pdf:

скачать файл _________________________________2019.pdf
размер: 84.35к
кол-во скачиваний: 41



Конференция "День ДНК - 2019" состоится, естественно, в День ДНК. Т.е. 25 апреля. И продлится с утра (10-00) до позднего вечера. По плану - до 17-10, но это если удастся выдежать регламент. И если не будет обсуждения и заключительных выступлений.

В самом начале ожидается доклад С.Э.Шноля, который обещал вспомнить молодость и рассказать правду о том, кто именно придумал двойную спираль. Причём это были совсем не Джеймс Уотсон и Френсис Крик. Изюминкой программы должен стать доклад О. Кузнецовой, которая специально ради этой конференции приедет из Оксфорда и расскажет о самых последних веяниях в нанопоровом секвенировании. Да и прочие доклады долджны быть весьма интересными. Например, Д.Коростин будет рассказывать о своём опыте работы на китайском секвенаторе MGISEQ-2000.

Зал вместительный (Пущино, ул. Институтская, д.3, 4-й этаж ИТЭБ РАН).
Вход свободный.
Будем рады всем. beer.gif jump.gif wink.gif

P.S.: автобус из Москвы до Пущино теперь ходит от метро Лесопарковая. Останавливается напротив ИТЭБ (остановка Лесная зона). Обычно доезжает за полтора часа. А иногда и быстрее.
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 15.04.2019 03:13     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Охренеть программа, я всё брошу и приеду! А с докладчиками пообщаться можно? Или они прочитают и сразу домой/в Москву?
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 15.04.2019 10:47     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Шноль опять про "зелёные тетради" Тимофеева-Ресовского будет рассказывать? Уже даже Дж.Уотсон ответил - что он этих работ и в глаза не видел, т.к. опубликованы они были в каком-то захолустном немецком журнале. Да и идея и модель - это две большие разницы. Так-то всю натурфилософию можно свести к Аристотелю. Вывод из всей той истории один: хотите чтобы вас знали - пишите в приличные журналы, а не в "мурзилки".
А нет ли возможность эти лекции в Интернетах посмотреть-послушать? Вроде, лекции сейчас не проблема на Ютуб "залить"?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 15.04.2019 21:26     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

День ДНК на сайте ИТЭБ РАН:
http://web.iteb.psn.ru/den-dnk-2019.htm
http://web.iteb.psn.ru/den-dnk-2019-program.htm
http://web.iteb.psn.ru/den-dnk-2019-transport.htm

Объявление:

скачать файл DNA_DAY_2019.doc
размер: 155к
кол-во скачиваний: 30



картинка: DNADAY___2019.png
Программа:

Файл/ы:

скачать файл DNA_DAY___2019__Program.pdf
размер: 84.35к
кол-во скачиваний: 36


Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 16.04.2019 11:11     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Генсек, так что насчёт трансляции лекций? Вне-Пущино - совсем не удастся нигде посмотреть-послушать?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 17.04.2019 14:41     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Репортаж о конференции будет на YouTube. Во всяком случае, в прошлом году был:
https://www.youtube.com/watch?v=5gpFDspaAF4
Ключевые доклады постараемся выложить. Прямой трансляции не будет. Так что лучше приезжайте:
http://web.iteb.psn.ru/den-dnk-2019-transport.htm
Заодно и с докладчиками сможете пообщаться.

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): dk, NMR-guy
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  18.04.2019 23:18     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

https://www.skygen.com/novosti/meropriyatiy...nk-v-pushchino/

Картинки:
картинка: DNA_Day___2019.png
DNA_Day___2019.png — (137.68к)   

Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 20.04.2019 06:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(dk @ 15.04.2019 08:47)
Ссылка на исходное сообщение  А нет ли возможность эти лекции в Интернетах посмотреть-послушать? Вроде, лекции сейчас не проблема на Ютуб "залить"?

Генсек, так что насчёт трансляции лекций? Вне-Пущино - совсем не удастся нигде посмотреть-послушать?


Прямая трансляция будет на следующий год ("День ДНК - 2020"). В этом году спецы попробуют организовать трансляцию, но только в тестовом режиме. И пока непонятно, на каком сайте будут транслироваться доклады. Ссылку на сайт смогу выложить не раньше среды. Так что шансы посмотреть трансляцию конференции есть, но гарантий нет. rolleyes.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 05.05.2019 08:26
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 22.04.2019 12:30     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Какие спецы, это сейчас школьник делает за 5 минут. У детей-геймеров спросите как это делается если сами не можете.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.04.2019 19:25     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(banned sceptique-NMRguy @ 22.04.2019 10:30)
Ссылка на исходное сообщение  Какие спецы, это сейчас школьник делает за 5 минут. У детей-геймеров спросите как это делается если сами не можете.


https://www.youtube.com/watch?v=a3lF56O-f8E
https://pro-stream.ru/

Картинки:
картинка: on_line.png
on_line.png — (37к)   

Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.04.2019 18:59     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Видеотрансляцию конференции можно будет посмотреть с камеры, установленной в конференц-зале ИТЭБ РАН:
https://www.ivideon.com/tv/camera/100-c9da2...393216/?lang=ru
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 25.04.2019 21:43     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

можно купить камеру Microsoft Live! с хардверным кодером H.264 для ноутбука, кабель с интернетом кинуть в зал и жмякнуть кнопку "Транслировать" на Ютубе из аккаунта gmail. камеру поставить на штатив на стол рядом с проектором, так чтобы было видно и экран и докладчика на трибуне.

звук запускать в ноут с линейного выхода звуковой системы зала и проверить что уровень достаточен, включить нормализацию, если нужно.

всё.

операторы и инженеры - это довольно странно для обычного стрима в сети. это если прямо охота свадьбу транслировать или вручение нобелевской премии, не меньше.

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 25.04.2019 21:43
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 26.04.2019 16:57     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Пробная трансляция выявила несколько проблем, с которыми понемногу будем разбираться. Через год трансляция должна быть нормальной.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ЫльЦынЦентр
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 27.04.2019 16:53     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Мы верим, что у вас всё получится! Главное - это интернет по кабелю с устойчивой широкой полосой.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ЫльЦынЦентр
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 29.05.2019 14:17     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

По ходу, genseq, Вас обошли коллеги из СПбГУ, они уже давно втихаря полногеномно генотипировали россиян, типа делая аналог 1000G-программы СШП. Но у них популяционные частоты и все особенности геномов будут стратифицированы дополнительно ещё по принадлежности к десятку-другому основных этносов РФ, причём они генотипируют "тройками" "предки -2" - "предки -1" - потомок, что позволяет ещё и гаплотипы достоверно выяснять.

Понятно, что 2 программы такого масштаба в одном государстве никто затевать не будет. Тему можно закрывать по понятным причинам. Коммерсанты, даже если все объединятся (что крайне маловероятно) своими базами, такой проект не потянут.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 06.06.2019 20:50     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Немного свежей информации к размышлению:
"Задачи отечественного секвенаторостроения (июнь, 2019 г.)"
https://habr.com/ru/post/455156/

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): LMP
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 07.06.2019 14:54     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Вы, кажется, не поняли - после создания банка геномов, который уже начали создавать имеющимися приборами потихонечку, секвенаторы будут нужны отечественные не больше, чем отечественные электрочайники или утюги.

Вы необратимо опоздали, товарищи. Ахбио и Нанофор защищены не только патентами, но и реальными ноу-хау (примерно как инсулин-сырец Ново Нордиска), а через 20 лет, когда вы разработаете свой "утюг", он уже не будет никому нужен.

Нанофоры британские хороши только для судебки и микробиологии с военщиной. Для поиска соматических мутаций (в той же онкологии) прибор, который ошибается раз на 100 нуклеотидов принципиально не пригоден.

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 07.06.2019 14:56
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 07.06.2019 16:55     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Про "NGS способно потеснить обычную ПЦР-диагностику" - это Вы конечно безжалостно натянули сову на глобус. И как правильно и неоднократно уже было замечено уважемыми участнегами дискуссии - основная проблема - в целеполагании. Кому нужны дорогие длинные риды с ошибками? Особенно когда подавляющее большинство применений NGS - это дешёвые короткие риды, или уж вообще упрощая - клинические опухолевые PCR панели. Каково практическое использование, кроме как "мы тоже могём не хуже буржуев"? Может если обозначить хотя бы приблизительно область применения, то и инвесторы бы нарисовались?
Участник оффлайн! Vadim Sharov
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 09.06.2019 03:48     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

NMRguy,07.06.2019 12:54]Ссылка на исходное сообщение  защищены не только патентами, но и реальными ноу-хау (примерно как инсулин-сырец Ново Нордиска), а через 20 лет, когда вы разработаете свой "утюг", он уже не будет никому нужен.

Вы привели неадекватный пример.
Патент на инсулин? Он когда закончился? Есть патенты на пролонгированный инсулин. Но такие не только у Нова Нордикса.
С другой стороны, в России есть полный цикл инсулина, у "Герофарма". То что ему не дают заполонить Россию,это условия инвестиционных контрактов с Бигфармой.
Свои разработки нужны. Кстати, пролонгированный инсулин есть у "Герофрама".

Чтобы выжить и другим помочь:

САНКТ-ПЕТЕРБУРГ, 6 июня. /ТАСС/. Российская компания "Герофарм" заключила с венесуэльской Espromed Bio соглашение о сотрудничестве в области поставки и организации производства российских инсулинов в Венесуэле. Как сообщается в пресс-релизе Минпромторга, церемония подписания соглашения прошла в присутствии главы ведомства Дениса Мантурова в рамках Петербургского международного экономического форума. https://tass.ru/ekonomika/6516431
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 09.06.2019 12:44     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(Vadim Sharov @ 09.06.2019 04:48)
Ссылка на исходное сообщение  NMRguy,07.06.2019 12:54]Ссылка на исходное сообщение  защищены не только патентами, но и реальными ноу-хау (примерно как инсулин-сырец Ново Нордиска), а через 20 лет, когда вы разработаете свой "утюг", он уже не будет никому нужен.

Вы привели неадекватный пример.
Патент на инсулин? Он когда закончился? Есть патенты на пролонгированный инсулин. Но такие не только у Нова Нордикса.
С другой стороны, в России есть полный цикл инсулина, у "Герофарма". То что ему не дают заполонить Россию,это условия инвестиционных контрактов с Бигфармой.
Свои разработки нужны. Кстати, пролонгированный инсулин есть у "Герофрама".

Чтобы выжить и другим помочь:

САНКТ-ПЕТЕРБУРГ, 6 июня. /ТАСС/. Российская компания "Герофарм" заключила с венесуэльской Espromed Bio соглашение о сотрудничестве в области поставки и организации производства российских инсулинов в Венесуэле. Как сообщается в пресс-релизе Минпромторга, церемония подписания соглашения прошла в присутствии главы ведомства Дениса Мантурова в рамках Петербургского международного экономического форума. https://tass.ru/ekonomika/6516431

Я не про субстанцию говорю. А про производство сырца, который кроме Ново Нордиска никто в мире не делал. И который пытались запилить лет 20 всеми адекватными силами советской (не чета нынешней) биотехнологии. И который сейчас и варит Герофарм, как Вы, наверняка, знаете.

Если сейчас то же самое начнётся и с Нанопорами - то смею заметить товарищу Шарову, что даже ему 20 лет подряд 5% бюджета РАН на эти машинки никто тратить не даст сейчас. И что защитой от воспроизведения там являются наверняка не только патенты, но и то, о чём в них умолчано.

Если у ихней расходки срок хранения/годности - полтора месяца, то они в любом случае идут лесом мимо нашей медицины, у нас месяц только преодоление таможни будет занимать.

А россиян уже вовсю секвенируют в Питере на иллюминах. После которых, конечно, останутся белые пятна, причём весьма важные, протяжённые повторы, но секвенировать де ново весьма вероятно будут все на китайских секвенаторах (где людей не кидают с производством расходки через пару лет после покупки прибора). Наши же секвенаторы как всегда останутся для секвенирования ёжиков на дачах их изобретателей.

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 09.06.2019 12:54
Участник оффлайн! Vadim Sharov
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 09.06.2019 14:02     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

"Герофарм" делает то, что называете Вы "сырец". Да, это доведенная до конечного производства советская разработка. Инсулин пролонгированного действия сделали "герофармовцы" сами. "Сырец" делался и на производстве в ИБХ. Обошлись без ноу хау Ново Нордикса. "Сырец" есть в Китае. И, уж, конечно, собственный "сырец" есть у американской Эли Лилли и у французской Санофи. Я написал Вам про производителей именно"биотехнологического сырца", про "Ферейн" не пишу.
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 11.06.2019 17:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(Vadim Sharov @ 09.06.2019 15:02)
Ссылка на исходное сообщение  "Сырец" есть в Китае. И, уж, конечно, собственный "сырец" есть у американской Эли Лилли и у французской Санофи.

Сильно в этом сомневаюсь (сомневаюсь что Эли и Санофи способны такое разработать). Скорее всего там не свой сырец, а лицензированный у НовоНордиска. Который после того, как сырец всё же биохакнули в ИБХ в Союзе, стал очень сговорчивым и радостно начал продавать лицензии всем, боясь остаться вообще без всего после заполнения рынка советскими лицензиями и сырцом. Насчёт китайцев - эти бы могли, думаю, но времени и денег нужно бы было немеряно. Но китайцам лицензию на сырец Ново продавать бы никогда не стал.

Кстати, если сырец всё же есть в Китае - то эту область можно закрывать, демпинга с таким внутренним спросом как у них, никто не выдержит.

Сообщение было отредактировано banned sceptique-NMRguy - 11.06.2019 17:35

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 24.06.19 12:51
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft