Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Помогите разработать реал-тайм ПЦР для полиморфизма!
Кураторы темы:* Natali217
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Natali217




 прочитанное сообщение 08.03.2021 23:59     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование
Важно!
Уважаемые коллеги!
Возможно, эта тема уже обсуждалась и не раз, но нет времени физически все просматривать.
Прошу помочь разработать реал-тайм ПЦР для исследования полиморфизма rs4988235.
Я не новичок в молекулярной генетике, но с реал-тайм у меня опыта очень мало.
Прибор 7300 Applied Bisystems.
Буду очень признательна за помощь!
Участник оффлайн! Natali217




 прочитанное сообщение 09.03.2021 00:16     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Помогите, пожалуйста, сделать аллельспецифичные праймеры.
Мне один раз понять, как это делать, и я уже дальше сама смогу разобраться.
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 14.03.2021 16:25     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Тема - не для "Беседы", это надо в МКБ.
В простейшем случае если вам надо SNP, то делаете небольшой компл. праймер, ваш нуклеотид на 3' конце последний, перед ним - однозначно некомпл. Подбираете темп.гибр. чтобы ПЦР шла только при специф. отжиге. Всё проверяется на геле, а потом, если если всё удалось - ставьте с интеркал. красителем. Если такманы - то проще отдать разработку на аутсорсинг, пусть там голова болит.
Участник оффлайн! banned sceptique-NMRguy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 15.03.2021 08:05     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

МКБ уже нет, оттуда все модеры разбежались не делегировав полномочия по наведению конституционного порядка...
Участник оффлайн! Гест Гестович
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 16.03.2021 18:50     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(banned sceptique-NMRguy @ 15.03.2021 09:05)
Ссылка на исходное сообщение  МКБ уже нет, оттуда все модеры разбежались

А мат-методы тоже фсё? А то у меня там вопросец...
Участник оффлайн! NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 16.03.2021 21:09     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Да, тоже всё. Аглая больше не с нами.
Участник оффлайн! бутанол
Постоянный участник
Новосибирск



 прочитанное сообщение 22.03.2021 20:48     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

еще советую посмотреть вторичные структуры например есть такая функция на IDT.

если аллельспецифичные праймеры то можно иногда вторую или третью букву от 3 конца поменять.. и замены пуринов на пиримидины могут быть проблемой, важно и с 3` концом разбираться и с температурой отжига праймеров, чтоб она не отличалась на комплементарных вариантах. Я еще иногда делал хвосты на 3 конце (разные) чтобы повысить селективность без существенного снижения эффективности реакции.

если аллельспецифичный зонд.. как повезет smile.gif важно и чтобы вторичные структуры не мешали и обычно зонд ложится на снип почти серединкой, с некоторым смещением на 5 конец. но были успешные зонды у которых 5`конец ложился точно на SNP

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Беседа · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 29.03.24 02:04
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft