molbiol.ru -> Partec CyFlow ML.....

> Все форумы > Тематические форумы > Клеточные технологии

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Partec CyFlow ML..... -- ...pros and contras --

Компания Biocommerce - официальный дистрибьютер продукции компаний Miltenyi Biotec GmbH (Германия) и RanD S.r.l. (Италия).

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

20.03.2008 23:03

URL #1

...В общем, коллеги - юзает ли кто-нибудь в течение длительного времени сей дивайс? Хотелось бы узнать и потраблшутить.
Интересует интенсивный юз в максимальной конфигурации (анализатор, 13 PMT).
Ибо подозрительно, что при заявленных скоростных и дигитайзных характеристиках, сей дивайс стоит почти в 3 раза меньше, нежели LSR-II в подобной же по возможностям конфигурации (2х2х6х3)
Какие будет соображения?

gamma-delta

01.04.2008 16:18

URL #2

Похоже, пользователей сего инструмента в России не много. Честно говоря, все приборы Partec прекрасно выглядят в рекламных буклетах, что далеко не всегда подтверждается на практике... Интересно было бы на него посмотреть...

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

03.04.2008 16:27

URL #3

Дык, я не про Россию.
Впрочем, уже инфу получил. И из первых рук, и от юзеров.

gamma-delta

07.04.2008 08:56

URL #4

Может поделитесь впечатлениями? Думаю, всем будет интересно

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

07.04.2008 12:06

URL #5

1) Лазеры - твердотелка, стабильная - ОК
2) Оптический тракт - "жеский" ("кубики") - закрытая ситсема, кою не нужно юсировать (другое решение - волоконка у BD)
3) Флоу чамбер - вот тут есть закавычка: если гнать на высокой скорости - то бабблить начинает. Посему, сей дивайс для высокоскоростного аквизишена- не слишком пригоден.
4) Софт - простецкий (по сравнению даже с CellQuestPro или с DiVA)- но поддерживает все форматы, посему ничего не мешает офф-лайн анализ делать в другом софте. Да, нет полной автокомпенсации (как у BD)
5) Цена - за 12 цветку с 3-мя лазерами ниже, чем у аналогичной конфигурации LSR-II почти в 2.5 раза (и дешевле Canto II 8 цветной в 1.4 раза)
6) Компактный зверЪ

Резюме - для ресеча не особо торопливого подойдет ( особенно, если суппорт есть рядом - что в нашем случае выполняется, ибо до Мюнстера ехать километров 800 всего)

Поблагодарили (2): gamma-delta, AlexanderL

Volodka

14.11.2008 17:06

URL #6

Может кто нибудь подскажет, есть ли у CyFlow ML IVD сертификат или он только для ресёча?

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

14.11.2008 17:10

URL #7

IVD - у CyFlow Space и PAS-ов и примитивов (SL, CCA)
ML - только для ресеча

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

14.11.2008 17:11

URL #8

http://www.partec.com/preview/cms/front_content.php?idcat=43

guest: Vik
IP-штамп: fr52oFUZgXGwk
гость

27.07.2016 15:18

URL #9

Что значит ML - только для расчетов, и что такое сертификат IVD?

ship
Постоянный участник
Moscow

27.07.2016 17:22

URL #10

IVD -in vitro diagnostics - если хотите использовать девайс для анализов - то его надо сертифицировать в минздраве, как прибор медициного назначения

Гульнара Бикчантаева

16.09.2016 21:06

URL #11

Подскажите, можно перенести работу с FacsCalibur на Partec и делать аналогичные анализы? Такое ощущение ,что Facs за тебя уже все сделал, а на Partec ничего не понятно.Вообще с этим зверем можно как-то сдружиться?

Леонид В
Постоянный участник
Квебек

17.09.2016 06:18

URL #12

(Гульнара Бикчантаева @ 16.09.2016 14:06)

А можно подробнее, пожалуйста? Какое “всё“ сделал Calibur? Любой цитометр делает одно и то же: замеряет светорассеяние и флюоресценцию прошедшего через лазер объекта и выводит на экран в виде точки на графике. Измеряет, разумеется, с известной чувствительностью плюс-минус погрешность. Чувствительность регулирует оператор, цитометру это пока недоступно.
Всё остальное — красоты программ для обработки результата. Программы существуют зачастую независимо от цитометров. С чем именно у Вас трудности?

Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер

Леонид В
Постоянный участник
Квебек

17.09.2016 23:16

URL #13

(Гульнара Бикчантаева @ 17.09.2016 02:17)

Понимаете,на Facs видна картинка четкого разделения клеток+ автокомпенсация.

Разделение по FSC/SSC или по флюоресценции?
“Нечеткое“ разделение популяций имеет множество причин. В первую очередь Вам следует удостовериться, что Ваш цитометр в рабочем состоянии. Т.е. прогнать стандартные ... ммм ... бусы? шарики? beads одним словом. Они должны быть в “наборе“ с цитометром.
После того как Вы убедитесь, что прибор работает нормально, можно продолжать разбираться. Если прибор стоял без использования долгое время, то его надо просто помыть. Т.е. загнать детергент в систему на двое суток, а потом прогнать большое количество воды.

Под автокомпенсацией Вы подразумеваете вычисление программой компенсационной матрицы на основании результатов с окрашенными только одним цветом клетками/бусами с дальнейшим использованием оной матрицы для обработки результатов?

(Гульнара Бикчантаева @ 17.09.2016 02:17)

Нельзя прибор пришить к другой программе?

для получения данных — нет
для обработки — сколько угодно.

Сообщение было отредактировано Леонид В - 17.09.2016 23:17

Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер

Гульнара Бикчантаева

18.09.2016 21:09

URL #14

Да, по FSC/SSC нет четкого разделения.По калибровочным частицам(синие и красные) настраивал инженер .Говорят,тренируйтесь, потом увидите гейты. Я хочу узнать, дело в самом прточнике или в специалисте. Можно скинуть гистограммы? По ним же можно сделать выводы?

Леонид В
Постоянный участник
Квебек

19.09.2016 02:38

URL #15

(Гульнара Бикчантаева @ 18.09.2016 14:09)

Да, по FSC/SSC нет четкого разделения. Можно скинуть гистограммы? По ним же можно сделать выводы?

По гистограммам судить о FSC/SSC крайне сложно. Лучше всего dot plot (увы, не знаю, как по-русски) стандартного образца. Например нативные, нефиксированные, мононуклеары периферической крови человека (PBMC)

(Гульнара Бикчантаева @ 18.09.2016 14:09)

По калибровочным частицам(синие и красные) настраивал инженер .Говорят,тренируйтесь, потом увидите гейты.

Инженер — наше всё, но каждый пользователь обязан время от времени проводить контроль качества по частицам. Поэтому, сначала проведите КК, а потом прикрепите, пожалуйста, к сообщению dot plot FSC/SSC.

Прежде чем рассуждать о сложностях необходимо элементарно убедиться, что прибор в рабочем состоянии.

Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

20.09.2016 11:50

URL #16

Alignment проверить надобно. И настройки по каналам (на calibrite и rainbow).

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

20.09.2016 11:51

URL #17

А вот софтинка на CyFlow да- кривая зело

Guest
IP-штамп: frHmB/cc7J4qI
гость

20.09.2016 17:29

URL #18

Сегодня промыли,прочистили .Прогнали синие частицы,все попадает в заданные параметры.Опять сняли изотип и CD3/CD8. Данные даже рядом не стоят ни с лейкоформулой, ни с Facs (кстати эти двое четко коррелируют ).Хотела скинуть картинки на форум, программа не дает даже скопировать. Вообще можно что ли одолеть это все или просто сдаться "немцу".

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

20.09.2016 18:12

URL #19

Чтобы прикрепить картинки, надо схранить их в .jpg формате а потом прикрепить к сообщению (загрузив сохраненнные - кликните на кнопку "more Options"-откроется расширенная форма сообщения).

А ежелисофтинка недает дотплоты сохранить как картинки(что странно,ибо даже у Паретковского кривого софта эта опция есть)- то откройте .fcs файлы в любом ином цитометрическом софте -и экспортируйте оттуда.

В принципе,можете через ЛС обратиться- дам вам е-мейл,скинете туда FCS-ки- посмотрю

Кстати,а Вы не прогоняли в параллели тот же самый образец на другом цитометре?

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

20.09.2016 18:12

URL #20

(Guest @ 20.09.2016 16:29)

Сегодня промыли,прочистили .Прогнали синие частицы,все попадает в заданные параметры.

Что именно попадает?

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

24.09.2016 21:47

URL #21

Образец- цельная кровь или после фиколла?

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

24.09.2016 21:50

URL #22

Вольтаж по SSC и FSC поменьше надо б. Бидзы должны быть в середине второй декады, а не после третьей. Тогда и лимфоциты на месте будут.

А изотипический контроль не интересен (только для морфологии). Выложите пожалуйста картинки с окрашенным образцом.

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

24.09.2016 21:52

URL #23

Похоже, лимфоциты ваши- в самом верхнем гейте (на скаттере). А в зеленом - дохляк

Гульнара Бикчантаева

25.09.2016 10:31

URL #24

А если внизу все это дебрис, как его отсечь? В программе не нашла ничего такого, чтобы установить фильтр.

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

25.09.2016 13:25

URL #25

Пардон,присмотрелся- у вас SSC по венртикали

Я привых к диаграмме наоборот.
R2-все ж лимфоциты.
Увеличьте FSC до 170-180.

Для "красивых популяций"-перейдите в режим density plot или contour plot, и наберите хотя бы 50-100 тысяч событий.

И форму R2 измените- некорретный гейт.

Для дебриса - Treshold по FSC выставить на уровне примерно 25-30

P.S. И уберите с фенотипических дотплотов out-of-the-gate события- они картинку только засоряют.

P.P.S. У вас многоцветный цитометр.Почему работа с двухцветкой всего? Уже давно гемато-киты сертифицированные идут на 5-6 цветов.

Гульнара Бикчантаева

25.09.2016 20:24

URL #26

у нас вся работе на FacsCalibure велась до сих пор .Оттого и антитела так закуплены. А Partec только осваиваем,поэтому много вопросов. Все же прибор тогда дает достоверные результаты? И где эти режимы у него искать?

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

25.09.2016 22:05

URL #27

(Гульнара Бикчантаева @ 25.09.2016 19:24)

у нас вся работе на FacsCalibure велась до сих пор

Так на Калибуре 4 цвета можно смотреть.

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

25.09.2016 22:06

URL #28

(Гульнара Бикчантаева @ 25.09.2016 19:24)

Все же прибор тогда дает достоверные результаты?

Да. Просто с настройками у любого прибора надобно "поиграться".
Чувствительности разные, динамические диапазоны, дискретизация сигнала и т.п.

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

25.09.2016 22:08

URL #29

А режимы визуализации- в софте переключаются,само собой.
Равно как и настройки по каналам.

К сожалению, у меня в данный момент нет на компе Partec-овского софта (последний раз с ним "забавлялся" лет 6 назад).

Гульнара Бикчантаева

26.09.2016 07:22

URL #30

Понятно.Спасибо. Будем дальше "забавляться", выбора все равно нет.

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

26.09.2016 09:33

URL #31

Кстати, интересный момент: у вас же КДЛ, а Partec CyFlowML- RUO (для клиники не сертифицирован).

Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum

26.09.2016 13:36

URL #32

(Гульнара Бикчантаева @ 26.09.2016 06:22)

Понятно.Спасибо. Будем дальше "забавляться", выбора все равно нет.

Так спрашивайте, форум для этого и создан.

Леонид В
Постоянный участник
Квебек

26.09.2016 16:26

URL #33

(Дядя ФАКСер @ 26.09.2016 06:36)

Так спрашивайте, форум для этого и создан.

А если на форуме выходной, а сдаваться немцу не хочется (хотя весьма странный тип организации работы, видимо суверенный на скрепах. В норме при покупке прибора, фирма-поставщик посылает специалиста, который два-три дня целиком проводит с будущим оператором и показывает ему всё от А до Z. На дворе 21 век, почему результаты от пациентов тестируют в режиме изобретения велосипеда ? Я думал Вам для исследований ... уму не растяжимо ...)

Так вот в режиме изобретения велосипеда следует включать смекалку солдатскую (война ведь кругом ...). Если Вы гейты поставите в FL1/FL2, a в FSC/SSC попросите показать только клетки из гейта, то однозначно увидите лимфоциты, ибо редкая нелимфоцитарная птица летает по сосудам с маркерами CD3/CD4 на поверхности.

Извините за резкость, но, полагаю Вы согласитесь, что для клиники подобное гадание на виртуальной гуще недопустимо. Разумеется весь этот фонтан возмущения адресован не Вам, а Вашему начальству, которое реально не ведает, что творит. Вы-то вынуждены варить суп из топора.

Не завидую ...

Guest
IP-штамп: frB9jMcng4PC.
гость

26.09.2016 23:35

URL #34

Вообще сама сегодня до этого дошла, и вправду получилась красиво.

Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер

Леонид В
Постоянный участник
Квебек

27.09.2016 00:06

URL #35

(Guest @ 26.09.2016 16:35)

Вообще сама сегодня до этого дошла, и вправду получилась красиво.

ну вот и славно ...
теперь Вы знаете, где лимфоциты
следующий шаг: отказаться от художественного шитья при создании гейт. Овальчик или даже квадратик вполне подойдут. Всё равно FSC/SSC это весьма приблизительные параметры для разграничения лимфоцитов и ошметок, моноцитов и грануляров.
Впрочем, на вкус и цвет фломастеры все разные, поэтому если затейливые гейты Вам больше нравятся — рисуйте. Вреда не будет.

Гульнара Бикчантаева

27.09.2016 20:17

URL #36

Спасибо за сотрудничество и поддержку.Будем расти .

Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость

02.01.2017 16:16

URL #37

(Гульнара Бикчантаева @ 16.09.2016 21:06)

https://www.sysmex-europe.com/fileadmin/med...ow_Space_EN.pdf

No Problem

Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость

03.01.2017 12:35

URL #38

(Гульнара Бикчантаева @ 25.09.2016 20:24)

PARTEC 5 lasers 14 fluos, Calibur 2 lasers 4 fluos

watchesonline89
Постоянный участник

05.01.2023 12:08

URL #39

https://62e8ce2ae5d50.site123.me/
https://www.vingle.net/posts/4647029
https://eatsleepride.com/c/383272
https://anotepad.com/notes/prkpsawt
https://demo.wowonder.com/1665548793521727_195426
https://linktr.ee/omegawatches89
https://omegawatches89.gumroad.com/p/reason...replica-watches
https://omegawatches93.mystrikingly.com/
https://writer.zoho.com/writer/open/k3enw04...fea14e95e0ee806
https://www.edocr.com/v/rakkz4oq/omegawatch...-replica-online
https://diigo.com/0pigfx
https://62e8ce2ae5d50.site123.me/blog/reaso...replica-watches
https://www.worldranklist.com/preview/bookm...s-Online-Store-
https://omegawatches89-95.webselfsite.net/contact
https://form.jotform.com/223252982096057

watchesonline89
Постоянный участник

09.01.2023 11:53

URL #40

https://omegawatches89.mystrikingly.com/
https://www.deviantart.com/omegawatches89/j...pular-930508248
https://eatsleepride.com/c/383270
https://fortunetelleroracle.com/fashion/ama...s-online-737627
https://www.intensedebate.com/people/omegawatches89
https://fortunetelleroracle.com/fashion-acc...-popular-737613
https://anotepad.com/notes/ykiydhnj
https://medium.com/@omegawatches89/amazing-...ne-b4863ed55af0
https://omegawatches90.mystrikingly.com/
https://62e8ce2ae5d50.site123.me/blog/repli...ve-items-online
https://62e8da780bf7c.site123.me/
https://padlet.com/omegawatches89/9ibenzfwbcer7k71
https://omegawatches89.simplesite.com/452939012
https://62e8da780bf7c.site123.me/blog/excit...-replica-online
https://62e8ce2ae5d50.site123.me/blog/advan...replica-watches

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.