Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Craig Venter IP-штамп: fr5enyRTdaqzM гость |
If you've got questions of your own, we want to hear them. Type your queries here:
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 22.05.2010 11:21 |
Craig Venter IP-штамп: fr5enyRTdaqzM гость |
|
Craig Venter IP-штамп: fr5enyRTdaqzM гость |
|
Гест Гестович Постоянный участник Россия |
Сообщение было отредактировано Гест Гестович - 21.05.2010 18:11 |
Guest IP-штамп: frURH0ohZLtp2 гость |
|
dlinnosheee Постоянный участник |
|
Esya Постоянный участник PA, USA |
(dlinnosheee @ 21.05.2010 15:32) интересно, а кто-нибудь знает, сильно ли отличаются между собой эти бактерии? меня интересует вопрос как незнакомые транскрипционные факторы смогли распознать чужие промотеры. ведь для этого нужня нехилая гомология. а если так, то этот метод может работать только с очень близкими видами бактерий? для house-keeping transcription не нужно много транскрпционных факторов
|
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
|
mlog Постоянный участник |
(dlinnosheee @ 22.05.2010 00:32) интересно, а кто-нибудь знает, сильно ли отличаются между собой эти бактерии? меня интересует вопрос как незнакомые транскрипционные факторы смогли распознать чужие промотеры. ведь для этого нужня нехилая гомология. а если так, то этот метод может работать только с очень близкими видами бактерий? ну привет, у меня два разных подкласса растений - и то распознают (а чего делать, жить-то всем хочется ), а уж один род - воооще фигня |
dlinnosheee Постоянный участник |
(Esya @ 22.05.2010 01:16) как-то все равно не очень понятно. допустим много не нужно, но что-то же нужно. |
dlinnosheee Постоянный участник |
(mlog @ 22.05.2010 02:03) ну привет, у меня два разных подкласса растений - и то распознают (а чего делать, жить-то всем хочется ), а уж один род - воооще фигня распознают что? транскрпционные факторы распознают промотеры чужого растения? |
Esya Постоянный участник PA, USA |
(dlinnosheee @ 21.05.2010 17:28) это уже научная постановка вопроса, RNAP, ribosome нужна точно, она узнает чужие последовательности в очень широком диапазоне после определенной лаг фазы, она по идее может насинтезировать все необходимое
|
Esya Постоянный участник PA, USA |
Сообщение было отредактировано Esya - 22.05.2010 02:13
|
Guest IP-штамп: frURH0ohZLtp2 гость |
-Профессор ваше творение гениально, вы создали нового человека! -А зачем? Когда любая баба... |
petr Постоянный участник |
Забавно. Сообщение было отредактировано petr - 22.05.2010 04:58 |
Griva Постоянный участник Philadelphia, PA, USA |
|
Griva Постоянный участник Philadelphia, PA, USA |
(petr @ 22.05.2010 02:44) Пробежался по комментам к статье на майл.ру Забавно. ya dumau nado proverit ne poyavilis li kamenty ili kartinki na UDAVe. eto mozhet byt interesnei |
mlog Постоянный участник |
(dlinnosheee @ 22.05.2010 02:33) Ну да. Обычное дело - растение с собственным геном убитым, но трансформированное конструкцией с ортологичным геном из другого вида. Чаще всего работает. |
Гест Гестович Постоянный участник Россия |
|
Guest IP-штамп: frtYc13fBFnts гость |
(mlog @ 22.05.2010 07:51) Ну да. Обычное дело - растение с собственным геном убитым, но трансформированное конструкцией с ортологичным геном из другого вида. Чаще всего работает. Про ген понятно - что угодно можно вставить (Вентеровские ребята повставляли свои емэйлы и имена насколько я понял). Вопрос в том, что происходит, если заменены не только гены, но и промотеры? |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Что получилось. Клетка Mycoplasma capricolumу нас уже была, внимание, ее никто не создавал искусственно, взяли готовую. Из нее толко вытряхнули собственное геномное содержимое и внедрили JCVI-syn1.0, после чего клетка успешно считала геном, насинтезировала того, чего надо и начала размножаться. Затем этот геном из нее опять выделили и перечитали. Оказалось, что за время синтеза и трансплантации смутировало 8 новых нуклеотидов, впрыгнул мобильный элемент генома - транспозон из E.coli и произошло 85 удвоений генов, при этом вырубились 2 гена, которые очевидно не явились критическими.
|
dlinnosheee Постоянный участник |
(Vadim Sharov @ 22.05.2010 12:27) Оказалось, что за время синтеза и трансплантации смутировало 8 новых нуклеотидов, впрыгнул мобильный элемент генома - транспозон из E.coli и произошло 85 удвоений генов, при этом вырубились 2 гена, которые очевидно не явились критическими. интересно, о чем говорят удвоения генов? |
dlinnosheee Постоянный участник |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
(dlinnosheee @ 22.05.2010 10:12) Извините, я случайно опять сюда вляпался (не знал, что мои полномочия для новостей и в "Беседе" действуют ). Думаю, что обсуждение целесообразнее перенести в ЖЖ
|
mlog Постоянный участник |
(Guest @ 22.05.2010 12:00) Про ген понятно - что угодно можно вставить (Вентеровские ребята повставляли свои емэйлы и имена насколько я понял). Вопрос в том, что происходит, если заменены не только гены, но и промотеры? Такое тоже было, например, вот не с промотором, правда, но с интроном, в котором регуляторные элементы. Тоже действует, хотя сильно хуже.
|
dlinnosheee Постоянный участник |
(mlog @ 22.05.2010 13:51) Такое тоже было, например, вот не с промотором, правда, но с интроном, в котором регуляторные элементы. Тоже действует, хотя сильно хуже. Among 29 Brassicaceae species, several other motifs, but not the LFY and WUS binding sites identified previously, are largely invariant. Using reporter gene analyses, we tested six of these motifs and found that they are all functionally important for the activity of AG regulatory sequences in A. thaliana. Although there is little obvious sequence similarity outside the Brassicaceae, the intron from cucumber AG has at least partial activity in A. thaliana. ОК, но в данном случае это говорит как раз о том, что для распознания транскрпционными факторами требуется гомология. То есть можно заменив геном бактерии, сделать чуть-чуть отличающуюся бактерию (а ведь для этого вовсе не обязательн менять весь геном), но таким методом нельзя сделать принципиально другую бактерию. |
klav Постоянный участник Москва |
(Vadim Sharov @ 22.05.2010 12:27) В JCVI-syn1.0 оставлено 382 наинеобходимейших генов из 485. |
klav Постоянный участник Москва |
|
АНК Участник Moscow |
ПС А Я бы сейчас акций института его имени прикупил бы - это как начало пирамидки, так что должно быть выгодно пока.... |
Esya Постоянный участник PA, USA |
(Vadim Sharov @ 22.05.2010 04:36) Извините, я случайно опять сюда вляпался (не знал, что мои полномочия для новостей и в "Беседе" действуют ). Думаю, что обсуждение целесообразнее перенести в ЖЖ Хороши у нас мрдераторы, которым для чтения таких текстов требуется перевод с объяснениями из жж. |
mlog Постоянный участник |
(dlinnosheee @ 22.05.2010 15:00) ОК, но в данном случае это говорит как раз о том, что для распознания транскрпционными факторами требуется гомология. То есть можно заменив геном бактерии, сделать чуть-чуть отличающуюся бактерию (а ведь для этого вовсе не обязательн менять весь геном), но таким методом нельзя сделать принципиально другую бактерию. Насчёт гомологии - гомология как общность происхождения, там, конечно, была, просто потому что это интроны ортологичного гена. Но сходство последовательностей очень мало - кроме этих самых сайтов связывания, у них ничего общего почти нет. Но я согласна, что синтетическая биология вряд ли поможет создавать организмы с принципиально новыми свойствами. Оосбенно эукариот. |
TAOLI Участник |
(Guest @ 21.05.2010 19:19) Микоплазму "сделали"...точнее скопировали (интересно сравнить ее инфекционность с природной) ...по размеру она меньше некоторых вирусов да и внутриклеточная...новою веху эта работа не открывает - не поддавайтесь крикам журналюг и шоуменам от науки Огромная беда Русских ученых - это чрезмерная скромность. Нам нужно у них только поучиться делать из каждой вещи конфетку |
Esya Постоянный участник PA, USA |
(TAOLI @ 22.05.2010 14:14) Огромная беда Русских ученых - это чрезмерная скромность. Нам нужно у них только поучиться делать из каждой вещи конфетку |
dimi4 Участник |
|
Esya Постоянный участник PA, USA |
(dimi4 @ 22.05.2010 17:37) Мну интересует в этой работе не создание нового генома как такового, а удешевление синтеза ДНК, чего пока не наблюдается. откройте фирму с реактивами для синтеза по демпинговым ценам Вообще-то, олиги за 15 лет раз в 15 подешевели. |
dimi4 Участник |
(Esya @ 23.05.2010 03:28) откройте фирму с реактивами для синтеза по демпинговым ценам Вообще-то, олиги за 15 лет раз в 15 подешевели. 0.3-0.4 бака сейчас, 1-1.5 бака лет 10 назад. Да и олиги мне не интересны, что-нибудь как минимум от 5 кб и побыстрее чем за две-четыре недели |
чайник555 Постоянный участник Сибир-р-р-ръ |
(dimi4 @ 23.05.2010 04:00) 0.3-0.4 бака сейчас, 1-1.5 бака лет 10 назад. Да и олиги мне не интересны, что-нибудь как минимум от 5 кб и побыстрее чем за две-четыре недели Препаративная Long-PCR ? Уже нужно ? |
dimi4 Участник |
(чайник555 @ 23.05.2010 07:48) Лонг-ПЦР фигня. А вот когда нужно мутировать не один десяток тирозинов на предмет фосфорилирования, да потом еще комбинации смотреть. |
guest: димон IP-штамп: frEh4rh.kRSjs гость |
|
Гест Гестович Постоянный участник Россия |
(guest: димон @ 02.06.2010 14:32) Под чьим контролем? ФСБ? РПЦ? Ермаковой?
|
Guest IP-штамп: fr5enyRTdaqzM гость |
(guest: димон @ 02.06.2010 13:32) |
Цолымба Участник 46, XY |
|
Nastja Постоянный участник Новосибирск |
|
Чайник556 Участник |
Попытаюсь коротко нарисовать возможный сценарий развития событий по Синтиям. Сейчас начнется бум технологий, предложенных Вентером для получения все новых линий, типов, штаммов Синтий. Это нормально и естественно. Закрутятся большие деньги. Кто не успел - тот опоздал. В этом угаре получения больших контрактов мало кто будет задумываться, что ПОКА Синтии, по меткому слову Гельфанда, есть ХИМЕРЫ, как в относительно точном смысле этого слова, так и образно. С Гельфандом согласен, но уточнил бы, сказав, что Синтии - супердорогие мутанты. Они - результат экзо- и эндогенных неосознанно лингвистических манипуляций с геномом-донором, т.е. прообразом будущей Синтии - мутантной химеры (МуХи). Иногда в шутку буду называть Синтии МУХАМИ. Так что же будет с мухами? Замах у Вентера и у других не кремлевских мечтателей огромный. Мухи – пожиратели нефти (Мексиканский залив, залитый нефтью), мухи – пожиратели пестицидов и др. ядов, мухи – синтетики лекарств, мухи – продляющие нашу жизнь, мухи-лекари и т.д. Сфера огромная, сфера благодатная, сфера благородная. |
чайник555 Постоянный участник Сибир-р-р-ръ |
Чувствую себя хорошо, полёт нормальный... |
чайник555 Постоянный участник Сибир-р-р-ръ |
Ученым удалось искусственно синтезировать митохондриальный геном мыши "в пробирке" за один прием (митохондрии - клеточные органеллы, вырабатывающие энергию и обладающие своей собственной ДНК). Статья исследователей опубликована в журнале Nature Methods, а коротко работа описана на портале Nature News. Исследователи начались "собирать" геном длиной около 16,3 тысячи нуклеотидов из отдельных одноцепочечных фрагментов по 60 "букв", которые также были синтезированы искусственно. ДНК существует в форме двухцепочечной спирали, причем соединение одноцепочечных фрагментов в пары происходит однозначно - соединяются только отрезки, последовательности которых комплементарны (говорят также, что они сочетаются как ключ и замок). Авторы методики подобрали условия синтеза таким образом, что в реакционной смеси происходило эффективное объединение одноцепочных фрагментов. Сформировавшиеся двухцепочечные отрезки ученые помещали в клетки кишечной палочки Escherichia coli, где они объединялись в более длинные фрагменты. В разработанной учеными системе они могли отбирать только те бактериальные клетки, в которых сборка итоговых фрагментов прошла правильно. На последней стадии процесс эти фрагменты объединялись так, чтобы получить митохондриальный геном мыши. Пока авторы не проверяли, "работает" ли собранный геном, однако, по их словам, предложенный процесс намного более точен, чем сборка из коммерчески синтезируемых длинных фрагментов (сейчас ученые могут заказать синтез длинных - вплоть до полногеномных - последовательностей у биотехнологических компаний). Недавно коллектив ученых под руководством того же исследователя, что и в данной работе - Дэниеля Гибсона (Daniel Gibson) - получил бактерию с полностью синтетическим геномом. Авторы химически синтезировали геном паразитического микроорганизма Mycoplasma mycoides и вставили его в клетку родственной бактерии Mycoplasma capricolum. Итоговый организм обладал всеми признаками M. mycoides, что подтверждало тот факт, чт искусственный геном "прижился". Подробнее об этой работе можно прочитать здесь. |
Nastyferg12 Участник |
<a href="https://reptilescentury.com/product/yellow-giant-parsons-chameleon-for-sale/" rel="dofollow">Yellow Giant Parson’s Chameleon</a> <a href="https://reptilescentury.com/product/orange-eye-parsons-chameleon-for-sale/" rel="dofollow">Orange Eye Parson’s Chameleon</a> <a href="https://reptilescentury.com/product/pastel-highway-ball-python/" rel="dofollow">Pastel Highway Ball Python</a> <a href="https://reptilescentury.com/product/green-anaconda-for-sale-online/" rel="dofollow">green-anaconda for sale online</a> <a href="https://reptilescentury.com/product/yellow-anaconda-for-sale-online/" rel="dofollow">yellow anaconda for sale online</a> and <a href="https://reptilescentury.com/" rel="dofollow">BABY HYPO BLUE BAR DUNNER LEATHERBACK BEARDED DRAGON</a> <ahref="https://kaufenrechtlichenfahrerlizenz.com/" rel="dofollow">fuehrerschein kaufen</a> <ahref="https://kaufenrechtlichenfahrerlizenz.com/" rel="dofollow">deutschen führerschein kaufen</a> <a href="https://420medicalstore.com/product/italian-ice-weed-strain" rel="dofollow">italian ice weed strain</a>. <a href="https://420medicalstore.com/product/zheetos-strain/" rel="dofollow">zheetos strain</a> <a href="https://420medicalstore.com/product/super-lemon-cherry-strain" rel="dofollow">super lemon cherry strain</a> <a href="https://420medicalstore.com/product/jungle-fire-strain/" rel="dofollow">jungle fire strain</a> and <a href="http://420medicastore.com/" rel="dofollow">wham strain</a> (<a href="420medicalstore.com/" rel="dofollow">rainbow runtz strain</a> <a href="https://420medicalstore.com/product/jeeter-juice-live-resin/" rel="dofollow">jeeter juice live resin </a> <a href="https://420medicalstore.com/product/clear-chronic-carts/" rel="dofollow">clear chronic carts</a> <a href="https://420medicalstore.com/product-category/budz-strains/" rel="dofollow">blue zushi strain</a> <a href=https://420medicalstore.com/product-category/cart-flavors/" rel="dofollow">boutiq carts</a> <a href="https://420medicalstore.com/product-category/cart-flavors/" rel="dofollow">friendly farm carts </a> <a href="https://420medicalstore.com/product/sauce-carts/" rel="dofollow">sauce cart </a> <a href="https://420medicalstore.com/product/mad-lab-disposable/" rel="dofollow">mad lab disposable </a> <a href="http://420medicalstore.com/" rel="dofollow">jungle boys disposable </a> Buy quality RUNTZ at 420medicalstore.com and have it deliver to you discretely. |
« Предыдущая тема · Беседа · Следующая тема » |