Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
ghost-ya Участник |
Первая попытка объяснить феномен деградации мРНК как совокупность экзо- и эндонуклеолитических актов была предпринята ещё в 1973 г. Апирионом. Деградация РНК рассматривалась как процесс, исключительно способствующий реутилизации рибонуклеотидов; процесс деградации мРНК не учитывался в контексте регуляции экспрессии генов, чья концентрация должна изменяться во времени. В настоящее время известно несколько ферментов, участвующих в деградации мРНК бактерий, но наиболее изученным остаётся РНКаза Е, впервые обнаруженный в E. coli. Наряду с РНКазой Е, являющейся эндорибонуклеазой, у E. coli существует ряд РНКаз с 3’-5’ экзорибонуклеазной активностью, но отсутствуют РНКазы с 5’-3’ экзорибонуклеазной активностью. Т. к. изначально все исследования по деградации бактериальных мРНК проводились на E. coli, то считалось, что у бактерий отсутствуют РНКазы с 5’-3’ экзорибонуклеазной активностью. Статья, недавно вышедшая в журнале Cell, опровергает данное предположение. У Bacillus subtilis не обнаружен ген гомологичный гену, кодирующему РНКазу Е у E. coli, и показано отсутствие 3’-5’ экзорибонуклаз; при этом у Bacillus subtilis существуют РНКазы с 5’-3’ экзорибонуклеазной активностью, что говорит о принципиально различных способах деградации мРНК. Известно, что РНКаза J1 в Bacillus subtilis, как и РНКаза Е у E. coli, участвует в деградации мРНК и созревании 16S рРНК из её предшественника. Таким образом, РНКаза J1 является функциональным аналогом РНКазы Е. Авторы статьи показали, что, несмотря на схожесть в функциональном отношении двух РНКаз, механизм реализации их функций принципиально различен. В созревании 16S рРНК из её предшественника у Bacillus subtilis принимают участие несколько РНКаз, в том числе и РНКаза J1. Методом праймер-экстеншена удалось продемонстрировать, что РНКаза J1 проявляет 5’-3’ экзорибонуклеазную активность (но не эндорибонуклеазную) при созревании 16S рРНК. Другим доказательством в пользу 5’-3’ экзорибонуклеазной активности РНКазы J1 послужило изучение кинетики деградации синтетического олигорибонуклеотида при 0°С (т. к. РНКаза J1 очень процессивна), который в одном случае был помечен на 5’-конце полинуклеотидкиназой и γP32-ATP, а в другом случае - P32-pCp на 3’-конце (рис. 1): наличие промежуточных радиоактивно меченных продуктов деградации в случае 3’-концевого мечения свидетельствовало о том, что РНКаза J1 является 5’-3’ экзорибонуклеазой. Кроме того, в работе показано, что интенсивно транслирующаяся мРНК не подвергается деградации РНКазой J1 вследствие того, что РНКаза J1 не может обойти рибосому (рис. 2). Рис. 1 . Кинетика появления 5’ и 3’ меченных рибонуклеотидов после обработки РНКазой J1 олигорибонуклеотидов, радиоактивно меченных по 5- или 3- концам. Рис. 2. Модель, объясняющая подавление деградации мРНК РНКазой J, при трансляции мРНК. По материалам журнала Cell 129, 681–692, May 18, 2007 - Картинки: RNase_J.jpg — (44.8к)
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 26.06.2007 15:13 |
Luana Постоянный участник Украина |
|
ghost-ya Участник |
|
guest: Виталий IP-штамп: fr04Qan1zmBhk гость |
Кто может поделиться штаммами Bacillus subtilis для трансформации и векторами для молекулярного клонирования: (pSG1151, pSG1154, pSG1156, pSG1164, pSG1170, pSG1729, pSG1186, pSG1187, pSG1190, pSG1191, pSG1194) Благодарю Вас за рассмотрение такой возможности. Виталий |
nigoal123 IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
as well as content |
nigoal123 IP-штамп: frAWeMdOsBSXM гость |
who have mastered the |
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |