Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Подскажите, как отрезать часть живой амебы?
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Закрытая темаСоздать новую темуСоздать голосование
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 17.01.2017 10:20     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Есть желание провести ряд экспериментов связанных с цитоскелетом. А именно:

сохранит ли отрезанная часть какую либо подвижность? Имеет ли цитоскелет распределенную систему управления своей динамикой или есть некий центр синхронизации, управления и отрезанная часть без него сразу обездвиживается (парализуется). Что будет если разрезать амебу строго по центру? Будет ли наблюдаться подвижность в той части где остался "центр" (предполагаю, что центр управления в центросоме), или амеба при повреждении мембраны обречена сразу на погибель.. т.е. много вопросов.

От сюда вопросы.
В наличии есть микроскоп ЛОМО и прямые руки. Как провести увлекательный и интересующий меня эксперимент?
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 17.01.2017 15:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Начните с мухи, оторвитите ей попу и изучите вопрос дальнейшего распределенного управления живым.

Это просто - даже микроскоп не нужен. Многие биологи этим начинают свою карьеру лет в 5-6.

Сообщение было отредактировано sceptique - 17.01.2017 15:49

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): Zaec, ksm, Vorona
Участник оффлайн! Zaec




 прочитанное сообщение 17.01.2017 16:40     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Прямых рук недостаточно, для работы с клеткой необходим микроманипулятор наподобие вот такого советского ММ-1 (вдруг где-то в старых помещениях заброшенных лабораторий завалялся?!)
user posted image
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 17.01.2017 17:44     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

sceptique, а я думал этот форум для ученых и где пишут ученые, а не фрики какие-то хлопающие друг друга по попе.


Zaec спасибо. Попробую поискать, может и найду на аукционах.

Как думаете, сможет ли амеба в принципе, перенести разрез мембраны и части цитоплазмы? (обширные и малые)
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 17.01.2017 19:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(guest: Лаборант @ 17.01.2017 15:44)
Ссылка на исходное сообщение Как думаете, сможет ли амеба в принципе, перенести разрез мембраны и части цитоплазмы? (обширные и малые)


Если заштопать образовавшуюся дырку, то может выжить. Если не заштопать, то помрёт. Она ведь одноклеточная. Лучше тренироваться на гидре. Она многоклеточная и штопки не требует. wink.gif
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 17.01.2017 19:44     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Меня интересует именно что-то крупное из одноклеточных с подвижными элементами.

Заинтересовался вопросом - клетка имеет единый центр управления подвижностью или имеет место распределенная система контроля подвижности (этакая клеточная нейросеть)?

Если отрезанная часть амебы окажется резко парализована, то это уже наведет на определенные мысли.

Вот возможная ионная утечка ("разряд" мебраны), возможная разница давлений в среде и внутри амебы, серьезные побочные мешающие эксперименту факторы.
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 17.01.2017 19:50     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

А что если манипулятором пробить отверстие и аккуратно сделать внутреннюю отсечку, не выходя потом из клетки?
Теоретически разорванный скелет, прекратит передачу управляющих сигналов, это должно проявиться по поведению клетки, я думаю должен быть вызван частичный параличь, можно будет так же определить его сектора (если совсем повезет).
Участник оффлайн! Zaec




 прочитанное сообщение 17.01.2017 20:22     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

(guest: Лаборант @ 17.01.2017 17:44)
Ссылка на исходное сообщение
Как думаете, сможет ли амеба в принципе, перенести разрез мембраны и части цитоплазмы? (обширные и малые)

Запросто! Ещё в 80-х А.Л. Юдин проводил операции на амебах с целью замены целых органоидов (ядра в частности).
user posted image

Сама процедура носит название микрургия и известна с 20-х годов прошлого века.

Из современных книг можно почитать: Методы микроманипуляции и ультрамикроанализа в биологии и медицине [Максимовский, Микичур, 1989, ISBN 5-02-028700-8]

Сообщение было отредактировано Zaec - 17.01.2017 20:23

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): dk
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 18.01.2017 15:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

Над мухами издеваться все же удобнее и дешевле (в техническом плане), чем над амёбами.

К тому же, роль тех или иных органелл и микроструктур доказывается и без порчи объекта исследования. Для этого люди выясняют какой-нибудь белок, который встречается только в интересной им органелле, навешивают ему на не особо значимый в функциональном плане домен, светящийся от флуоресцентной накачки, и снимают нормальное видео с флуоресцентного микроскопа с включенной функцией автослежения в поле зрения и охлаждаемым жидким азотом или пельтье детектором.

Насколько я помню, всякие цитоскелетные исследования уже лет 10-15 назад на простейших были закончены - наверняка можно заказать уже генетически модифицированных амеб (или инфузорий или еще кого, кто есть) с меченным флуоресцентным тагом актином. Выглядит это все красиво, но никакого практического значения, кроме съемок фильмов, не имеет.
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 19.01.2017 09:25     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Zaec спасибо за подсказки, почитаю.

sceptique, мне интересно изучить на каком принципе клетка управляет своей подвижностью. Муха имеет нервную систему, мышци и т.д. а клетка, должна как-то уместить всю эту сложную систему на своем "борту".

И тут напрашивается сам собой вопрос - допустим псевдоподии той же амебы, действуют автономно ? (например рецепторы на мебране, дают команды на соответствующую реконструкцию из трубок) или имеет место быть некое центральное управление, неким протеиновым процессором (предположительно в р-не центросомы) который управляет динамикой цитоскелета.

Отсечка (повреждение волокон скелета) должна дать ответы. Если подвижность сохраниться , значит имеем распределенную систему, если нет - значит есть центральный "процессор" в р-не центросомы. А это уже открывает обширнейший горизонт еще более увлекательных тайн, как он устроен, как им управляет геном, как им можно управлять, как программировать, как задать определенную динамику, как геном задает динамику (особенно при эмбриогенезе)....

Естественно есть лабы с хорошим оснащением и методами, но мне это не доступно frown.gif, а исследовать очень хочется, поэтому исхожу из того, что имею в наличии.

// Насколько я помню, всякие цитоскелетные исследования уже лет 10-15 назад на простейших были закончены

и где ответы на вопросы - как и чем управляется цитоскелетная динамика той же амебы?, где комп. модели в конце концов?
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 19.01.2017 17:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

"Управляется" рецепторным хемотаксисом на базе "вытесняющей многозадачности", которая происходит сама по себе, как функция локального отклика рецепторов на "успешность" элонгации псевдоподии в том или ином направлении. Если элонгация не подкрепляется рецептором - она "вянет", освобождая ресурсы на те конкурентные направления элонгации, которые хорошо "подкрепляются" рецепторами.

У инфузории и всех жгутиковых это наверняка работает НЕ в виде стимулирующей внутренней обратной связи элонгации цитоскелета, а в виде подавляющей обратной связи на движение жгутиков с той стороны клеток, которая находится ближе к "хорошим" стимулам. Соответственно, в этом направлении отталкивание глушится, и при сохранении активности в других клетка продвигается туда, где "приглушены" жгутики.

https://www.youtube.com/watch?v=ZNMwnBm2dSc

А это - еще одно свидетельство, что биологические существа были СОЗДАНЫ (а также то, что ученые говорят в страхе перед сектой эволюционистов, отрицая очевидное):

https://youtu.be/a_5FToP_mMY

Сообщение было отредактировано sceptique - 19.01.2017 17:32
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 19.01.2017 18:16     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

sceptique в этом я вас поддержу, я так же пришел к выводу, что по-видимому все живое на этой планете есть инженерный продукт. Уж слишком все ступенчато развивалось, время для развития мало, да и планетка наша маловата по размерам для случайной эволюции из хаоса.
Для таких сложных механизмов, которые есть даже в той же жгутоковой бактерии. Не говоря уже про такие вещи как электрошокер ската, светлячков, жуков бомберов, гусеницу морфирующую в бабочку и т.д. ....

Что касается псевдоподий. Меня интересует именно сам механизм:
рецептор> команда на перестройку цитоскелета. Т.е. конструкционно почему он именно так строится и как он строится. Попытка понять распределенная ли система или есть центральный синхроузел, лишь откроет от чего рыть механизмы этого строительства.

я почему-то думаю, что на самом деле имеет место быть вот что:
активируется рецептор >идет сигнал по нитям к центросоме >анализ, обработка информации, сравнение с другими сигналами>команда на изменение скелета по векторам>отправка по нитям векторов соответствующих командных протеинов>трансформация скелета и следовательно псевдоподий

Что касается хаотично "болтающихся" в цитоплазме градиентов концентраций, ну трудно вериться, что "высшие инженеры" сделали бы такой нерациональный механизм, почему-то думаю, что в клетке упорядоченная жесткая система, где каждая молекула не болтается как у быка ... а при деле smile.gif и место в клетке экономится и все там для дела.
Участник оффлайн! Zaec




 прочитанное сообщение 19.01.2017 18:33     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Зачем изобретать велосипед?
https://en.wikipedia.org/wiki/Amoeboid_movement или же её русскоязыный вариант, там и литература имеется

В инете полно статей по регуляции клеточного движения простейших, поиск по "protozoa regulation of movement"

Сообщение было отредактировано Zaec - 19.01.2017 18:34

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): sceptique
Участник оффлайн! ИНО
Постоянный участник
Донецк



 прочитанное сообщение 20.01.2017 01:14     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

Классическая теория эволюции рассматривает процессы, происходящие в живых организмах, а не в неживых, таким образом проблема появления жизни на Земле - не ее предмет. Ее предмет - то, что было дальше. И покамест весь фактический материал лишь подтверждает правоту этой теории, так же как и теории относительности (хотя на Эйнштейна нападает не меньше фриков, чем на Дарвина). Самое интересное что теория эволюции признана даже Ватиканом, то есть церковников уже не смущает. Или в Вашем, Лаборант, понимании создатель, чей "продукт" - живые организмы, - не Бог, а зеленые человечки ("высшие инженеры" каике-то, во множественном числе), проводящие на этой планете некий таинственный эксперимент? Аннунаки и все такое? В таком случае их самих кто сынженерил и возвел в ранг "высших"? Сам потом куда делся?

Сообщение было отредактировано ИНО - 20.01.2017 01:16

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ksm
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 20.01.2017 05:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

"анализ, обработка информации, сравнение с другими сигналами" анализом амеба не занимается, информацию не обрабатывает, и так далее сквозь ваше бессмысленное блаблабла.
"Покажите мне вероятность," биология не занимается "показами" вероятностей. Предмет биологии - изучение жизни причем такой, как она есть.
"какова вероятность появления бактерии на нашей планете?" - ответ очевиден - ровно 1, т.к. мы их наблюдаем.
"принять на веру (без сухих выкладок вероятностей и т.д.), что (например) млекопитающие появились от (утрирую) утконоса" - нет, вы совсем глупы: утверждается, что утконос и млекопитающие произошли от одного предка, причем, утконос гораздо раньше млеков.
"ship к чему такой тон?" - тон вполне под стать вашим низкосортным рассуждениям, также далеким от биологии как и от теории вероятностей, и от научных прений, и от здравого смысла

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Vorona
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 20.01.2017 09:22     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

ship //ответ на что?
- Имеет ли цитоскелет распределенную систему управления своей динамикой или есть некий центр синхронизации,

и т.д.

//Вы либо очередной шизик со "сверхценной идеей" аля Гаряев или Муханин, либо просто невежа или недалекий человек. Тут такие постоянно появляются.
Ну а если все таки вы адекватный - то ищите вот эту книжку https://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_Bio...Cell_(textbook) и будет вам счастье.

Повторяю - науке еще не известен сам механизм управления(!) динамикой и постройкой скелета. Возможно я что-то не нашел из последних публикаций, не увидел, так подскажите, буду рад.
Термины не использую, по ряду причин, (долго рассказывать да и ненужно, не так поймут).
Я в начале хотел сделать 3д визуальную комп модель постройки скелета, начал искать инфу, по принципам его постройки, допустим почему та же инфузория-туфелька имеет именно такую форму и её потомки тоже, а не другую. Поэтому начал копать глубже и понял, что на самом деле это огромное белое неизведанное пятно в биологии.
Поэтому приходиться рыть самому. И узнать (распределенный контроль или центральный) см выше это первые очевидные шаги.

И какие сверхценные идеи тут? Мне просто это интересно. Любопытство если хотите.
-----------------

ИНО
//... Самое интересное что теория эволюции признана даже Ватиканом, то есть церковников уже не смущает.

Вы же понимаете надеюсь, это не аргумент, это некие авторитетные мнения, о которых психология скажет как о инструменте манипуляций, для возникновения веры. Я не хочу уверовать, я хочу узнать. Биологический организм это не какая-то магия, а сложная химическая машина, которую можно "посчитать" (и уверен уже считали), т.е. есть известна вариабельность, известен объем, известно количество выборки перебора вариантов, известно время, пусть дарвинисты высчитают вероятность и скажут всему миру, вероятность самопроизвольной эволюции бактерии такой -то такая-то. Или эволюции слонов из вида такого-то в такой-то (известна примерная численность особей, временной период) такая-то и мы узнаем во первых примерную достоверность самопроизвольной эволюции и получим например формулу эволюции вида (зная , время, кол-во особей, скорость размножения и т.д.) но этого нет, догадываетесь почему?

Поэтому можете верить в ТЕОРИЮ дарвина, это ваше право, я толерантен к верующим. Хотя не очень люблю когда веру насильно навязывают. Лично для меня важнее сухие цифры.
С уважением.

Что касается предположений, кто же создавал, я склонен считать, что во вселенной все же присутствуют самопроизвольные эволюционные процессы (там масштабы куда более значительны и вероятность случайного появления сложных существ, вполне может быть достоверным событием). Так вот появление множества сложных эволюционирующих, конкурирующих за ресурсы инженеров, более достоверно, чем появления сразу некого высшего единого абсолюта, который начнет создавать примитивные формы играясь с червями в постепенно умирающей солнечной системе. Вбросы типа анунаков, я игнорирую (не интересно).

-----------------------
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 20.01.2017 10:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

Лаборант! Вам вопрос: На баке с водой стоит поплавковый регулятор. По достижении поплавком определенного уровня срабатывает клапан и перекрывает подачу воды в бак. Внешнее воздействие на систему открытие и закрытие сливного крана в баке. Вопрос это централизованное управление или распределенное?
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 20.01.2017 11:58     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

Vorona
//Дико извиняюсь, но вероятность достоверного (т.е. произошедшего) события равна 1.

Да, но мы говорим о ПРИЧИНАХ произошедшего события, есть некоторые теории, одна из них теория Дарвина (появление клеток, видов, из хаоса, путем случайных процессов) и я спрашиваю о вероятность появления, в плоскости науки, которая как раз и занимается случайными процессами.

МММ
//Лаборант! Вам вопрос: На баке с водой стоит поплавковый регулятор. По достижении поплавком определенного уровня срабатывает клапан и перекрывает подачу воды в бак. Внешнее воздействие на систему открытие и закрытие сливного крана в баке. Вопрос это централизованное управление или распределенное?

Распределенное.

Центральное будет в случае если есть процессор, который будет собирать информацию от группы датчиков-поплавков и спускать в низ команды на электро-клапана подачи воды.

(по крайней мере, я так вижу)
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 20.01.2017 15:27     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

Ну, так вот! Все живые системы(от клетки до популяций) работают исключительно на распределенном управлении, по вашей терминологии. Никаких центральных процессов в регулировании - нет. По крайней мере никаких процессоров до сих пор не обнаружено все регулирующие изученные процессы работают именно как распределенные(в вашей терминологии). Они могут быть много ступенчатые и многоуровневые они могут реагировать на сигналы из соседних контурах управления, но никакого "центрального процессора", собирающего и обрабатывающего информацию от множественных сигналов различных контуров и действующего в соответствие с какой-то программой управления предусматривающей алгоритмы управления, для различных наборов сигналов системы, не обнаружено. Есть центральная программа онтогенеза(развития), но она есть только у многоклеточных организмов. И это просто последовательность действий по строительству здания(нечто вроде проекта строительного регламента).

Обо всем этом вы можете прочитать в рекомендованном вам учебнике Ал(ь)бертса "Молекулярная биология клетки". там более или менее суммированы основные результаты по изучению таких процессов на уровне от одиночной клетки, до многоклеточных организмов(виды и популяции там практически не рассматриваются).

Что бы не изобретать велосипед, я рекомендую проштудировать этот учебник(в любом виде хоть на русском 20 летней давности перевода, хоть более современный на английском(если вы с английским дружите. (можно поискать в сети).

Удачи! И упорства.
guest: Лаборант
IP-штамп: frqDMj/TkD5ko
гость



 прочитанное сообщение 20.01.2017 21:08     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

Я бы написал больше, но странные тут иногда люди начнут сейчас нападать наверно.
Ну ладно, не буду потом обращать внимание.

например (одно из первых видео попавшихся в ютубе)
https://www.youtube.com/watch?v=9B8RnkaVKaQ

если присмотреться, можно заметить, что некоторые псевдоподии выбрасываются синхронно, на других видео (если порыть, в ютубе долго искать) иногда заметно примерно 7 таких одновременных синхронных движений псевдоподий, особенно когда амеба очень активна.

матрица и изображение выведенное на комп и потом раскадрированное, кроме лучшего восприятия глазами, позволяет более точно обнаруживать эти синхронности и улавливать зоны на поверхности амебы, которые позже, опять так же синхронно двигаются.

Есть у меня ряд смелых выводов, но пока делиться ими тут не буду, вангую - посыпятся тонны насмешек от всяких Ксмов и подобных. Это меня злит, а когда я злой то буду мотивирован писать тут на форуме ответы, это затянет и истратит в пустую время.
Участник оффлайн! avor
moderator



 прочитанное сообщение 21.01.2017 09:37     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

Тема закрывается. Если Лаборант зарегистрируется на форуме и напишет личное письмо мне тема может быть открыта и Лаборант будет назначен куратором.
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Закрытая темаСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 20.04.24 02:24
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft