Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
slavak4609 Участник |
Для разработки в будущем эффективных стратегий диагностики и лечения рака необходимы знания о генах, нарушения в которых связаны с развитием злокачественных опухолей. Только ограниченное количество связанных с раком генов сравнительно часто (>20%) мутирует в злокачественных опухолях данного типа. Большинство из них мутирует с промежуточной частотой (2-20%). С целью оценить возможность создать детальный каталог раковых генов авторы проанализировали соматические точечные мутации (мононуклеотидные замены, малые моно-, ди- и олигонуклеотидные делеции и инсерции) в 4.742 парах опухоль/нормальная ткань 21 типа рака. Количество пар различных типов варьировало от 35 до 892. В работе использовались ранее созданные базы данных The Cancer Genome Atlas (TCGA) и некоторых других проектов. Достоверность анализа оценивалась по «глубине» секвенирования, чистоте и плоидности образцов опухолей и составляла более 90%. Частота мутаций среди образцов одного типа и различных типов варьировала в пределах пяти порядков и составляла от 0,03 до 7.000 на МВ. Спектры мутаций также сильно варьировали. Проведенный широкомасштабный анализ выявил мутации в практически всех ранее известных связанных с раком генах. Кроме того, идентифицированы 33 гена ранее не ассоциировавшихся с раком. Новые гены связаны с процессами пролиферации, апоптоза, со стабильностью генома, структурой хроматина, уклонением от действия защитных механизмов иммунитета, процессингом РНК, гомеостазом белков. Из этих 33 генов 5 мутировало с частотой более 10%, а 15 - более 5%. Для создания каталога генов, мутирующих с высокой и средней частотой требуется секвенировать в среднем по 2.000 опухолей из 50 типов рака, т.е. ~100.000 опухолевых геномов. Задача является весьма актуальной: в мире ежегодно от рака умирают ~8 миллионов человек. И она представляется решаемой как с технологической, так и с экономической точек зрения. За последние 10 лет время анализа существенно сократилось, а стоимость секвенирования ДНК уменьшилась в миллион раз и, вероятно, будет еще снижаться. Подпись к рисунку: Количество образцов опухолей, требующееся для идентификации наиболее значимых генов, мутирующих в опухолях, как функция от средней частоты мутаций при различных типах опухолей. Черными точками обозначено количество образцов, проанализированных в данной работе. Источник: Lawrence MS, Stojanov P, Mermel CH, Robinson JT, Garraway LA, Golub TR, Meyerson M, Gabriel SB, Lander ES, Getz G.
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 17.02.2014 15:29 |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
pollard45p Участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
sclub365 IP-штамп: frXkFtWqamLPg гость |
|
50만원소Ꮌ IP-штамп: fraK0s5ehzFug гость |
Theme of blog is excellent there is almost everything to read, Brilliant post cupom amazon |
먹튀검증 IP-штамп: fraK0s5ehzFug гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
Write my essay IP-штамп: frxtrvzKgPF9k гость |
|
jad12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
jad12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
Ufa1688 IP-штамп: frAafNuYANUh2 гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ гость |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ гость |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: frdN6q3cADZrs гость |
|
fashionicon Постоянный участник |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
466773030 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
watchesonline89 Постоянный участник |
|
PowerISO Crack IP-штамп: fraoPU0Lh.juM гость |
|
shutdown168 IP-штамп: frqaYaYx2Y2ds гость |
face flight cancellations after major US airlines grounded |
guest: Ufa1688 IP-штамп: frqaYaYx2Y2ds гость |
|
« Предыдущая тема · Колонка новостей · Следующая тема » |