Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
молекула Участник |
|
молекула Участник |
(septoplast @ 04.04.2020 23:40) А между тем, писали где- то, что в Россию вернулось с отдых 800 с лишним заражённых граждан из 78 стран. Сколько геномов вируса с различными мутациями и вызывающих разные по тяжести симптомы к нам ввезли! Не думаю, что из Японии много " лёгких" штаммов. Скорее, из Европы...Италия, Испания...с тяжёлыми осложнениями
|
septoplast |
(молекула @ 05.04.2020 00:38) А между тем, писали где- то, что в Россию вернулось с отдых 800 с лишним заражённых граждан из 78 стран. Сколько геномов вируса с различными мутациями и вызывающих разные по тяжести симптомы к нам ввезли! Не думаю, что из Японии много " лёгких" штаммов. Скорее, из Европы...Италия, Испания...с тяжёлыми осложнениями с количеством купленых NGS секвенаторов в россии 4000 зараженных в России геномы можно было отсиквинировать за неделю
|
молекула Участник |
(septoplast @ 05.04.2020 00:45) с количеством купленых NGS секвенаторов в россии 4000 зараженных в России геномы можно было отсиквинировать за неделю И провести ассоциацию с течением болезни и другими факторами. |
vb Постоянный участник |
|
Panaev Постоянный участник |
(Begemotik @ 03.04.2020 18:28) SARS-CoV-2 specific antibody responses in COVID-19 patients Nisreen M.A. Okba1*† , Marcel A. Müller2,3* , Wentao Li4* , Chunyan Wang4 , Corine H. GeurtsvanKessel1 , Victor M. Corman2,3 , Mart M. Lamers1 , Reina S. Sikkema1 , Erwin de Bruin1 , Felicity D. Chandler1 , Yazdan Yazdanpanah5, 6 , Quentin Le Hingrat5, 7 , Diane Descamps5, 7 , Nadhira Houhou-Fidouh7 , Chantal B. E. M. Reusken1, 8 , Berend-Jan Bosch4 , Christian Drosten2,3 , Marion P.G. Koopmans1 , & Bart L. Haagmans 1† 1Erasmus Medical Center, Rotterdam, the Netherlands; 2Charité-Universitätsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universität Berlin, Humboldt-Universität zu Berlin, and Berlin Institute of Health, Institute of Virology, Berlin, Germany; 3German Centre for Infection Research, associated partner Charité, Berlin, Germany; 4Utrecht University, Utrecht, the Netherlands; 5Université de Paris, IAME, INSERM, Paris, France; 6Hôpital Bichat-Claude Bernard, Infectious diseases department, AP-HP Nord, Paris, France; 7Hôpital Bichat-Claude Bernard, Virology department, AP-HP. Nord, Paris, France; 8RIVM, Bilthoven, the Netherlands. |
Panaev Постоянный участник |
(septoplast @ 05.04.2020 00:45) с количеством купленых NGS секвенаторов в россии 4000 зараженных в России геномы можно было отсиквинировать за неделю Сколько нужно материала для этого секвенирования? Наверное, нужно чистую культуру получать, вирус чистить, нет? |
Carbon Copy Постоянный участник So close no matter how far |
(Panaev @ 06.04.2020 14:35) Сколько нужно материала для этого секвенирования? Наверное, нужно чистую культуру получать, вирус чистить, нет? Не обязательно. Можно и из сопли нашотганить. |
молекула Участник |
The SARS-CoV-2 genome harbors unique 5´ UTR sequences which are significantly heterogeneous to any 5´ UTR sequences found in any other coronaviruses, and, in viruses in general. This unique 5´ UTR region seems to be responsible for the extreme replication rate of the SARS-CoV-2 virus, and, also, for its high mutation rate arising from the lack of proof-reading activity of RNA-dependent RNA polymerase while replicating its genome and transcribing its subgenomic structural RNAs. |
молекула Участник |
Genetic inactivation of ExoN activity in engineered SARS-CoV genomes by alanine substitution Сообщение было отредактировано молекула - 06.04.2020 20:07
|
vb Постоянный участник |
(молекула @ 06.04.2020 18:07) А некоторые учёные любят баловаться генной инженерией вирусов: Genetic inactivation of ExoN activity in engineered SARS-CoV genomes by alanine substitution это еще цветочки. некоторые балуются с нейротропными вирусами. вот где будут веселые истории.
|
vb Постоянный участник |
(Vladimirkox @ 31.03.2020 15:28) Сколько времени нужно для наработки S-белка в фаговом дисплее? А иммунизировать им можно? А торможение сыворотками реконвалесцентов делать можно? Тут ещё и Ковальчук с синхротронным излучением АГ-детерминанты локализовать может, судя по его обещалкам. Угу, между инфекционистом и реаниматологом - дистанция огромного размера. Кстати, о каком иммунитете он там лепечет? про специфические иммуноглобулины |
Carbon Copy Постоянный участник So close no matter how far |
(vb @ 06.04.2020 21:16) "Individuals interested in donating plasma can visit this link to find the nearest licensed plasma collection center to their location." DONATING ??? Типа кто сам кое-как выкарабкался, давайте, подможите бигфарме ни за понюшку табаку, которая из вашей дармовой плазмы сделает антисыворотку, чтобы за мешок $$$ впарить её потом нескольким умирающим от COVID-19 миллионерам.
|
vb Постоянный участник |
(Carbon Copy @ 06.04.2020 21:42) "Individuals interested in donating plasma can visit this link to find the nearest licensed plasma collection center to their location." DONATING ??? Типа кто сам кое-как выкарабкался, давайте, подможите бигфарме ни за понюшку табаку, которая из вашей дармовой плазмы сделает антисыворотку, чтобы за мешок $$$ впарить её потом нескольким умирающим от COVID-19 миллионерам. ну, насколько я знаю, в большинстве стран именно безвозмездное донорство является основой для производства препаратов крови. хотя,есть, конечно , и коммерческий сбор. но, он, кстати, распространен в бедных странах. |
молекула Участник |
(vb @ 06.04.2020 23:13) А ссылки есть на статьи? |
Panaev Постоянный участник |
(Carbon Copy @ 07.04.2020 00:42) "Individuals interested in donating plasma can visit this link to find the nearest licensed plasma collection center to their location." DONATING ??? Типа кто сам кое-как выкарабкался, давайте, подможите бигфарме ни за понюшку табаку, которая из вашей дармовой плазмы сделает антисыворотку, чтобы за мешок $$$ впарить её потом нескольким умирающим от COVID-19 миллионерам. donating - это необязательно free. Это просто сдача крови/плазмы. В Европе поощряется мотивированная бесплатная сдача. Но есть и платные варианты. В штатах больше платного. С сайта CSL: New donors can earn up to $400. Compensation and promotions for eligible, qualified donors vary by location and weight. Ask the center manager at your preferred donation location for details about your compensation. Но есть и система бесплатной. В общем, очень зависит от страны и системы сбора плазмы. В РФ формально донорам не платят, но выплачивают "компенсацию на усиленное питание". И тоже есть система СПК/ФМБА, а есть донорские пункты Микрогена, есть донорские пункты крупных больниц. Все по-разному. Сообщение было отредактировано Panaev - 07.04.2020 11:32 |
Asterix Постоянный участник |
10 wt and 10 S-ExoN plaque isolates from a single round of infection. The results showed a 21-fold increase in mutational frequency and 14-fold increase in mutation rate across the S-ExoN genomes compared with wt SARS-CoV. For both S-ExoN and M-ExoN, mutations were distributed across the genomes with no statistical bias for regions of the genome, for type of mutation (codon position, transversion, transition) or for synonymous, non-synonymous or non-coding mutations. The analysis was only performed on viable replication-competent populations or plaques, and therefore excluded lethal or pro-foundly deleterious individual or combination mutations. Thus, the results likely highly under-represent the numbers, types and locations of mutations that would be detected in analysis of total viral genomes from a round of replication that would include both non-viable or minor mutations and defective interfering genomes. When the mutation patterns in the genomes from each of the 10 plaque isolates of S-ExoN were compared, 100 muta-tions were identified, and both the individual mutations and the “mutation sets” for each genome were unique. Finally, the growth of multiple plaque isolates showed that all plaque isolates had growth patterns with defects compared to wt SARS-CoV but indistinguishable from the initial recovered S-ExoN population or from each other |
Carbon Copy Постоянный участник So close no matter how far |
Highlights • Ivermectin is an inhibitor of the COVID-19 causative virus (SARS-CoV-2) in vitro. • A single treatment able to effect ∼5000-fold reduction in virus at 48h in cell culture. • Ivermectin is FDA-approved for parasitic infections, and therefore has a potential for repurposing. • Ivermectin is widely available, due to its inclusion on the WHO model list of essential medicines.
|
vb Постоянный участник |
(молекула @ 07.04.2020 07:02) да поищите по ключам Langat Pletnev TBEV JEV Denge |
septoplast |
(Carbon Copy @ 06.04.2020 18:01) в Питере нашотганили в 30 раз больше мутаций чем в среднем по миру ессесно убрали Питерский геном COVID из GISAID
|
молекула Участник |
(ketti75 @ 07.04.2020 23:22) Коронавирус еще в 2015 году изобретали в США в Северной Каролине, а китайцы после того как там запретили работать с геном человека, продолжили в Ухани. Статья журнала nature... Искала гомологичные последовательности к геному нового коронавируса в нуклеотидном BLAST. Одна из близких последовательностей опубликована с привязкой к статье 2019 года о разнообразии SARS вирусов у летучих мышей. Исследование проводилось в Юхане. Выделяли и секвенировали геномы диких вирусов летучих мышей. Как они там хранили и утилизировали эти образцы нам неизвестно. Последовательности и ссылки на статьи исследователей из Юханя тут же " вываливаются". Без конспирологическая предположений. Просто факты. Сообщение было отредактировано молекула - 08.04.2020 09:27
|
молекула Участник |
(ketti75 @ 07.04.2020 23:22) Коронавирус еще в 2015 году изобретали в США в Северной Каролине, а китайцы после того как там запретили работать с геном человека, продолжили в Ухани. Статья журнала nature... ))) В смысле, изобретали?))) |
молекула Участник |
Гельфанд о вирусе |
Begemotik Участник |
Было у меня такое подозрение, с учетом Сообщение было отредактировано Begemotik - 08.04.2020 10:09 |
CowDoc Постоянный участник Middle East |
|
CowDoc Постоянный участник Middle East |
(Carbon Copy @ 07.04.2020 16:19) Вы только нарвак-Овцам не показывайте, а то вас всех завтра непоклоновцы заставят гиподектином обрабатываться |
Panaev Постоянный участник |
(молекула @ 08.04.2020 10:59) Смешно. Из разряда "настоящему мужчине всегда есть что сказать по любому поводу". Забавны его представления о химеризации вирусов. В природе, может и не столь часто явление, но лабораторно мы можем в тысячи раз повысить вероятность этих событий.
|
Carbon Copy Постоянный участник So close no matter how far |
(Begemotik @ 08.04.2020 08:07) Вот как оно обстоит. Было у меня такое подозрение, с учетом "Точность существующих ПЦР-тестов для выявления новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2 не более 70–80%. Такие данные представил директор клиники пульмонологии и респираторной медицины Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, руководитель клинического отдела НИИ пульмонологии ФМБА России, главный внештатный пульмонолог Минздрава Сергей Авдеев на конгрессе «Человек и лекарство» 7 апреля." Главный внештатный пульмонолог забыл отметить, что 70–80% - это точность SARS-CoV-2 тестов российского производства. Интересно было бы сравнить с зарубежными данными. Хотя уже известно, что точность китайских тестоб от Shenzhen Bioeasy Biotechnology, которые вернула Испания - 30%. |
молекула Участник |
15.00 сегодня О вирусах, мифах и способах борьбы с инфекциями. В честь 100-летия со дня смерти учёного Дмитрия Ивановского, выпускника #СПбГУ, который в 1892 году первым в мире открыл вирусы, пройдет онлайн-конференция, посвященная важнейшим вопросам отрасли. Об истории открытия вирусов, роли иммунитета и расшифровке генома российского варианта коронавируса расскажут: профессор и заведующий кафедрой микробиологии Александр Пиневич, профессор и автор учебника по вирусологии Алексей Потехин, руководитель Лаборатории мозаики аутоиммунитета Иегуда Шенфельд, старший преподаватель Елена Дмитриева (кафедра микробиологии), профессор, заместитель директора Центра алгоритмической биотехнологии Института трансляционной биомедицины Алла Лапидус. Модератор онлайн-конференции — профессор Рауль Гайнетдинов, директор Института трансляционной биомедицины, научный руководитель Клиники высоких медицинских технологий, один из самых цитируемых учёных в области фармакологии в мире. Начало конференции в 15 часов на YouTube-канале СПбГУ: |
alex017 Постоянный участник |
Эти толпы толкутся в аэропортах, общаются друг с другом и местными. Прилетающие домой в Россию постепенно заболевают и попадают в больницы. Оставшие в аэропортах экзотических стран туристы прекрасно себя чувствуют, только много нервничают. Уважаемые специалисты, объясните, почему эти не выехавшие туристы до сих пор не в реанимации, не в больнице и вполне неплохо себя чувствуют? Но по приезду заболеют?? Так все по приезду "оттуда" подхватывают орз, орви, грипп. Все мои знакомые обычно "простывают" по приезду из тропиков. Оставшимся в тропиках туристам лучше не возвращаться хотя бы пока? Это сохранит им жизнь. Где я ошибся? Просто интересно. Интересно, что все признаки моего хронического бронхита при обострении и последующим приездом в тропики (поездку же не отменить, приходилось ехать) проходили за три дня, а в Перми за два-три месяца. |
Хакусай |
(alex017 @ 09.04.2020 23:11) Везде читаю, что в Россию рвутся тысячи туристов уже много дней, наверное уже у многих срок рвения перевалил за две недели. Эти толпы толкутся в аэропортах, общаются друг с другом и местными. Прилетающие домой в Россию постепенно заболевают и попадают в больницы. Оставшие в аэропортах экзотических стран туристы прекрасно себя чувствуют, только много нервничают. Уважаемые специалисты, объясните, почему эти не выехавшие туристы до сих пор не в реанимации, не в больнице и вполне неплохо себя чувствуют? Но по приезду заболеют?? Так все по приезду "оттуда" подхватывают орз, орви, грипп. Все мои знакомые обычно "простывают" по приезду из тропиков. Оставшимся в тропиках туристам лучше не возвращаться хотя бы пока? Это сохранит им жизнь. Где я ошибся? Просто интересно. Интересно, что все признаки моего хронического бронхита при обострении и последующим приездом в тропики (поездку же не отменить, приходилось ехать) проходили за три дня, а в Перми за два-три месяца. |
Хакусай |
(alex017 @ 09.04.2020 23:11) Везде читаю, что в Россию рвутся тысячи туристов уже много дней, наверное уже у многих срок рвения перевалил за две недели. Эти толпы толкутся в аэропортах, общаются друг с другом и местными. Прилетающие домой в Россию постепенно заболевают и попадают в больницы. Оставшие в аэропортах экзотических стран туристы прекрасно себя чувствуют, только много нервничают. Уважаемые специалисты, объясните, почему эти не выехавшие туристы до сих пор не в реанимации, не в больнице и вполне неплохо себя чувствуют? Но по приезду заболеют?? Так все по приезду "оттуда" подхватывают орз, орви, грипп. Все мои знакомые обычно "простывают" по приезду из тропиков. Оставшимся в тропиках туристам лучше не возвращаться хотя бы пока? Это сохранит им жизнь. Где я ошибся? Просто интересно. Интересно, что все признаки моего хронического бронхита при обострении и последующим приездом в тропики (поездку же не отменить, приходилось ехать) проходили за три дня, а в Перми за два-три месяца. |
Carbon Copy Постоянный участник So close no matter how far |
(alex017 @ 09.04.2020 20:11) Везде читаю, что в Россию рвутся тысячи туристов уже много дней, наверное уже у многих срок рвения перевалил за две недели. |
Begemotik Участник |
(alex017 @ 09.04.2020 20:11) "здесь климат иной идут лавины одна за одной" |
Panaev Постоянный участник |
(alex017 @ 09.04.2020 23:11) Уважаемые специалисты, объясните, почему эти не выехавшие туристы до сих пор не в реанимации, не в больнице и вполне неплохо себя чувствуют? Но по приезду заболеют?? Фактов нет, но чисто гипотетически 1. Откуда вы знаете , что они себя хорошо чувствуют? 2. Тех, кто не падает, в тамошних больницах не очень-то ждут. Особенно голодранцев. 3. Те, кто падает и попадает в реанимацию, тех по ТВ не показывают. Мне кажется такой расклад. |
молекула Участник |
RaTG13 is the name, rank and serial number of an individual horseshoe bat of the species Rhinolophus affinis, or rather of a sample of its feces collected in 2013 in a cave in Yunnan, China. The sample was collected by hazmat-clad scientists from the Institute of Virology in Wuhan that year. Stored away and forgotten until January this year, the sample from the horseshoe bat contains the virus that causes Covid-19.
|
молекула Участник |
|
Panaev Постоянный участник |
|
banned sceptique-NMRguy Постоянный участник временной жизни |
Ага, да, само, конечно, и панголины в очередь на рекомбинацию с мышами и змеями выстроились, и прямо в Ухане, в пещерах рядом с городом, прямо под их вирусным центром. А космическая станция МКС бороздит просторы галактики. И с противо-человечьим эпитопом к ACE2, который, если его отдельно взять, с самого начала ни на что не бластился (в январе-феврале). А сейчас, вдруг, начал. Правда, запоздало на 2 месяца начал, но лучше же, для всякой подпендосной шушеры, которая за ГМО-организмы по всему миру топит и всякие секвенаторы-шмеквенаторы, чем совсем ничего. Что, мать-Nature им всем опять покроет и поможет с их мямленьем про мутагенез-шмутагенез у вирусов? Или всё же кого-то выведут на чистую воду? |
молекула Участник |
Потом на выпавшей странице тоже конпка BLAST Выпадут самые похожие последовательности из базы данных. (молекула @ 10.04.2020 14:52) Сообщение было отредактировано молекула - 10.04.2020 14:56 |
молекула Участник |
|
молекула Участник |
|
ABS |
(молекула @ 10.04.2020 14:31) Там и комментарии к статье хорошие. Про долгое замалчивание факта передачи вируса от человека к человеку. Есть Сообщение было отредактировано ABS - 10.04.2020 17:14 |
VeroE6 Участник |
(Panaev @ 06.04.2020 17:35) Сколько нужно материала для этого секвенирования? Наверное, нужно чистую культуру получать, вирус чистить, нет? нарастить в зеленой мартышке |
VeroE6 Участник |
(интеллектуал минус пятого левала @ 16.03.2020 16:24) Здесь мы будем собирать всю информацию , о Covid-19 , которая есть в интернете и не только , чтобы сформировать четкую , позицию , что это такое. |
VeroE6 Участник |
(молекула @ 05.04.2020 00:38) А между тем, писали где- то, что в Россию вернулось с отдых 800 с лишним заражённых граждан из 78 стран. Сколько геномов вируса с различными мутациями и вызывающих разные по тяжести симптомы к нам ввезли! Не думаю, что из Японии много " лёгких" штаммов. Скорее, из Европы...Италия, Испания...с тяжёлыми осложнениями в России 4 секвенированых изолята |
молекула Участник |
|
VeroE6 Участник |
|
молекула Участник |
Дж.Герайти. Краткий обзор дезинформации властей КНР и руководства ВОЗ об эпидемии коронавируса День за днем, месяц за месяцем мы проследим, как Китай и ВОЗ скрывали опасность коронавируса, и какой ущерб эта дезинформация нанесла всему миру. |
VeroE6 Участник |
(молекула @ 12.04.2020 19:20) Дж.Герайти. Краткий обзор дезинформации властей КНР и руководства ВОЗ об эпидемии коронавируса День за днем, месяц за месяцем мы проследим, как Китай и ВОЗ скрывали опасность коронавируса, и какой ущерб эта дезинформация нанесла всему миру. ADDENDA: Boy, if you’re not reading NR these days, you’re missing a ton. |
« Предыдущая тема · Беседа · Следующая тема » |