Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Arlequin
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! microb
Участник



 прочитанное сообщение 13.02.2007 08:55     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Кто-нибудь считал статистику по Арлекину? wall.gif
Пожалуйста помогите разобраться!!! А существует-ли инструкция на более или менее понятном языке? confused.gif Help-help!!!

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): malteze
Участник оффлайн! Rhizon
Участник



 прочитанное сообщение 13.02.2007 13:31     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

А что Вы хотите считать? И где Вы?
Guest
IP-штамп: fr4nm6i88vv/M
гость



 прочитанное сообщение 15.02.2007 15:40     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Вам уже отвечали!
guest: Microb
IP-штамп: fr0Z0l8Lk2e9g
гость



 прочитанное сообщение 19.02.2007 12:57     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Я хочу посчитать частоты аллелей генов HLA и других. Но как это сделать в Арлекине, не знаю.
Guest
IP-штамп: fr4nm6i88vv/M
гость



 прочитанное сообщение 20.02.2007 10:33     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Где Вы? Вообще, частоты аллелей можно посчитать и без Арлекина.
В Арлекине есть образцы файлов, с которыми работает программа,
посмотрите, как там организованы данные.
Участник оффлайн! microb
Участник



 прочитанное сообщение 20.02.2007 12:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Я нахожусь в Челябинске, это что так важно?
"Вообще, частоты аллелей можно посчитать и без Арлекина". Во всех статьях по иммуногенетике частоты аллелей считают по этой программе. Очень хочется в ней разобраться.
Guest
IP-штамп: fr4nm6i88vv/M
гость



 прочитанное сообщение 20.02.2007 14:24     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Если бы Вы были, скажем в Питере, я бы Вам показал.
Какая у Вас, кстати, версия программы? Я Вам пишу для 2.0
Откройте с помощью текстового редактора файл из папки datafiles
из проекта Microsat с названием 2popmic.arp. Посмотрите, там представлены данные по двум выборкам диплоидных организмов, по 4 локусам.
Вы можете создать такой файл в любом редакторе или воспользоваться
опцией Project Wizard из самой программы, - укажите тип данных, чем они разделены и.т.д. Потом Вам будет надо только вставить туда свои данные.
Все строчки, начинающиеся со знака # - это примечания, которые можно опустить.
Сделайте такой файл, выберите его из программы, укажите анализы, которые Вы хотите провести и нажмите кнопку RUN. Результаты будут записаны в отдельный файл.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): malteze
Guest
IP-штамп: fr0Z0l8Lk2e9g
гость



 прочитанное сообщение 22.02.2007 11:15     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Спасибочки за помощь, надеюсь разберусь!
Участник оффлайн! Sveta Tim
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.05.2007 18:55     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

Подскажите, пожалуйста, на файл какого расширения нужно ссылаться на вкладке Arlequin configuration в графе «текстовый редактор» для программы Arlequin 3.1. Очень нужно.
Участник оффлайн! aekalashnikov
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 10.03.2010 16:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Меня интересует тот же вопрос, что и Свету.
Участник оффлайн! Sveta Tim
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.03.2010 18:58     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

(aekalashnikov @ 10.03.2010 17:48)
Ссылка на исходное сообщение  Меня интересует тот же вопрос, что и Свету.


У нас просто стоит ссылка на путь к запускающему (exe) файлу нашего браузера.
Участник оффлайн! Den-N
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.03.2010 20:52     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

(Sveta Tim @ 10.03.2010 21:58)
Ссылка на исходное сообщение  У нас просто стоит ссылка на путь к запускающему (exe) файлу нашего браузера.

А при чём тут браузер? Browse - значит "просмотр". А путь нужно указать к текстовому редактору. Проще всего к блокноту: С:\WINDOWS\NOTEDAD.EXE.
Но это только если у вас:
1) Стоит операционная система WINDOWS, 2) Она стоит на диске C:\ и 3) При установке папка не переименовывалась и называется WINDOWS. Иначе нужно проследовать туда, где есть к/л текстовый редактор.
Участник оффлайн! PIVOvarich




 прочитанное сообщение 05.04.2010 14:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Здравствуйте!

Подскажите пожалуйста – у нас в лаборатории встал вопрос использования arlequin 3.11 для генетического анализа RFLP, но, что называется, сломались в самом начале пути – не можем составить матрицу. Понимаю, что вопрос, вероятно, уже неоднократно обсуждался, но поиски в интернете пока не принесли результатов, поэтому спрашиваю помощи на форуме. Если не трудно, подскажите, как загнать в программу данные? Исходно у нас есть матрица, состоящая из 1710 «0» и «1» для каждой популяции (всего популяций 14ть). Эта матрица загнана в виде файлов программы Treecon (пример файла приложил к письму). Собственно, не можем понять, как эти данные загнать в «Арлекина», подскажите, пожалуйста. Если есть возможность – скиньте пример матрицы, может, так будет проще разобраться. Всем заранее спасибо!
Участник оффлайн! PIVOvarich




 прочитанное сообщение 05.04.2010 14:53     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

Простите, нажал «прикрепить файл», когда писал предыдущее сообщение, но файл не прикрепился… Вот, привожу здесь текстом, в каком виде у нас есть матрица:

>1.Semga Sop.
0000000011110101100000100000100000000000001000110000000010001111000110110000011100001001001000000101
00100010100100000100001100101010110101000000000000101101101010010010111 (и т.д., всего 1710 значений)
>2.Semga Utch.
0000000011110000100000100000100000000000101000010001000010001111001110110000001100001001101000000101
00100010100100000100001100101010100101000000101001101101101010010010111 (и т.д., всего 1710 значений в каждой популяции и всего 14ть популяций).
Участник оффлайн! Sonya




 прочитанное сообщение 16.08.2012 12:12     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

Подскажите, можно ли рассчитать Fst если известны только частоты аллелей (STR)?
Участник оффлайн! -Эн-




 прочитанное сообщение 19.08.2012 21:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

Наверное, нет, потому, что нужно знать вдобавок их вариансу. Формула расчета Fst= Var(p)/(p_средн*(1-p_средн)).
Участник оффлайн! alisa83




 прочитанное сообщение 03.10.2013 14:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

Доброго все времени суток!
Подскажите пожалуйста как вводить в Арлекин данные тетраплоидов (микросателлиты). По статьям известно, что возможно. Но когда вводим, программа ругается, говорит, что данные прочесть невозможно.
Участник оффлайн! silory




 прочитанное сообщение 16.01.2017 11:11     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

Здравствуйте, а есть более/мение понятная инструкция на версию 3,5? нужно посчитать частоты HLA
guest: great
IP-штамп: frj5GEfdEWR5M
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  31.10.2018 17:26     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

Positive site, where did u come up with the information on this posting?I have read a few of the articles on your website now, and I really like your style. Thanks a million and please keep up the effective work.
http://www.naturalhealthbase.com
guest: 123
IP-штамп: frJhOCvSv9ICE
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  31.05.2022 09:13     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

SINCE LAUNCHING AMB CASINO HIS INVASION OF UKRAINE, RUSSIA'S FC SLOT PRESIDENT VLADIMIR PUTIN 88KTC HAS FACED AN UNPRECEDENTED 11HILO GLOBAL RESPONSE, FROM CULTURAL BOYCOTTS TO 123GOAL COUNTRIES RADICALLY 123VEGA TRANSFORMING THEIR ALLBET FOREIGN POLICIES. BUT THE สูตรสล็อต LONGER THE CONFLICT CANDY BURST GOES ON, THE MORE SIGNS THERE ปั่นสล็อต ARE OF DIVISIONS.
guest: 123
IP-штамп: fr4iy3.kHUw02
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  06.06.2022 12:50     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

South Korea 123VEGA and the US launched WAZDAN eight missiles WM CASINO on Monday, in AFFILIATE response to a ลิงค์รับทรัพย์ volley of ballistic missiles fired by North Korea the 123GOAL previous day. It comes 88KTC as Pyongyang continues FC SLOT to escalate its AMB CASINO missile tests. South 11HILO Korea's president Yoon Suk-yeol.
guest: 123
IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  08.06.2022 11:42     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

South Korea 123VEGA and the US launched WAZDAN eight missiles WM CASINO on Monday, in AFFILIATE response to a ลิงค์รับทรัพย์ volley of ballistic missiles fired by North Korea the 123GOAL previous day. It comes 88KTC as Pyongyang continues FC SLOT to escalate its AMB CASINO missile tests. South 11HILO Korea's president Yoon Suk-yeol.
guest: 123
IP-штамп: frAWeMdOsBSXM
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  11.06.2022 10:49     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #23 множественное цитирование

Saxon Mullins 123VEGA says she once had PRAGMATIC PLAY romantic dreams of what her 'first time' would ICONIC GAMING be like. In none was หวยปิงปอง she paralysed by fear in a Sydney ปั่นสล็อต alleyway, aged 18, with a 123GOAL man she had met only minutes earlier. Ms 88KTC Mullins has always maintained FC SLOT this incident - in 2013 - was rape. It spurred AMB CASINO her to push for legal 11HILO reform in Australia, after a long court battle ended with a judge finding the man involved did not realise she hadn't consented to sex.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 29.03.24 08:18
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft