Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
microb Участник |
Пожалуйста помогите разобраться!!! А существует-ли инструкция на более или менее понятном языке? Help-help!!!
|
Rhizon Участник |
|
Guest IP-штамп: fr4nm6i88vv/M гость |
|
guest: Microb IP-штамп: fr0Z0l8Lk2e9g гость |
|
Guest IP-штамп: fr4nm6i88vv/M гость |
В Арлекине есть образцы файлов, с которыми работает программа, посмотрите, как там организованы данные. |
microb Участник |
"Вообще, частоты аллелей можно посчитать и без Арлекина". Во всех статьях по иммуногенетике частоты аллелей считают по этой программе. Очень хочется в ней разобраться. |
Guest IP-штамп: fr4nm6i88vv/M гость |
Какая у Вас, кстати, версия программы? Я Вам пишу для 2.0 Откройте с помощью текстового редактора файл из папки datafiles из проекта Microsat с названием 2popmic.arp. Посмотрите, там представлены данные по двум выборкам диплоидных организмов, по 4 локусам. Вы можете создать такой файл в любом редакторе или воспользоваться опцией Project Wizard из самой программы, - укажите тип данных, чем они разделены и.т.д. Потом Вам будет надо только вставить туда свои данные. Все строчки, начинающиеся со знака # - это примечания, которые можно опустить. Сделайте такой файл, выберите его из программы, укажите анализы, которые Вы хотите провести и нажмите кнопку RUN. Результаты будут записаны в отдельный файл.
|
Guest IP-штамп: fr0Z0l8Lk2e9g гость |
|
Sveta Tim Постоянный участник |
|
aekalashnikov Постоянный участник Москва |
|
Sveta Tim Постоянный участник |
(aekalashnikov @ 10.03.2010 17:48) У нас просто стоит ссылка на путь к запускающему (exe) файлу нашего браузера. |
Den-N Постоянный участник |
(Sveta Tim @ 10.03.2010 21:58) А при чём тут браузер? Browse - значит "просмотр". А путь нужно указать к текстовому редактору. Проще всего к блокноту: С:\WINDOWS\NOTEDAD.EXE. Но это только если у вас: 1) Стоит операционная система WINDOWS, 2) Она стоит на диске C:\ и 3) При установке папка не переименовывалась и называется WINDOWS. Иначе нужно проследовать туда, где есть к/л текстовый редактор. |
PIVOvarich |
Подскажите пожалуйста – у нас в лаборатории встал вопрос использования arlequin 3.11 для генетического анализа RFLP, но, что называется, сломались в самом начале пути – не можем составить матрицу. Понимаю, что вопрос, вероятно, уже неоднократно обсуждался, но поиски в интернете пока не принесли результатов, поэтому спрашиваю помощи на форуме. Если не трудно, подскажите, как загнать в программу данные? Исходно у нас есть матрица, состоящая из 1710 «0» и «1» для каждой популяции (всего популяций 14ть). Эта матрица загнана в виде файлов программы Treecon (пример файла приложил к письму). Собственно, не можем понять, как эти данные загнать в «Арлекина», подскажите, пожалуйста. Если есть возможность – скиньте пример матрицы, может, так будет проще разобраться. Всем заранее спасибо! |
PIVOvarich |
>1.Semga Sop. 0000000011110101100000100000100000000000001000110000000010001111000110110000011100001001001000000101 00100010100100000100001100101010110101000000000000101101101010010010111 (и т.д., всего 1710 значений) >2.Semga Utch. 0000000011110000100000100000100000000000101000010001000010001111001110110000001100001001101000000101 00100010100100000100001100101010100101000000101001101101101010010010111 (и т.д., всего 1710 значений в каждой популяции и всего 14ть популяций). |
Sonya |
|
-Эн- |
|
alisa83 |
Подскажите пожалуйста как вводить в Арлекин данные тетраплоидов (микросателлиты). По статьям известно, что возможно. Но когда вводим, программа ругается, говорит, что данные прочесть невозможно. |
silory |
|
guest: great IP-штамп: frj5GEfdEWR5M гость |
|
guest: 123 IP-штамп: frJhOCvSv9ICE гость |
|
guest: 123 IP-штамп: fr4iy3.kHUw02 гость |
|
guest: 123 IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ гость |
|
guest: 123 IP-штамп: frAWeMdOsBSXM гость |
|
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема » |