Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
danilaman Участник Київ, Україна |
Ученые University of California, Santa Cruz решили подойти к данной проблеме с другой стороны: они обратили внимание не на теломеразу, а на сами теломерные повторы. Известно, что они имеют склонность к образованию так называемых G-квадруплексных фолдов – это специфические структуры ДНК, характерные для последовательностей, обогащённых гуаниновыми нуклеотидами. В G-квадруплексах четыре остатка гуанина формируют стабильную планарную структуру посредством последовательного образования водородных связей между собой и координационных связей с одновалентным катионом (как правило, натрием). В одном G4-фолде может быть две или три такие планарные структуры, расположенные одна под одной. Известно также, что G-квадруплексы являются нестабильными, поэтому в нативном виде не могут заблокировать активность теломеразы. Большинство известных до этого методов структурной биологии имели недостаточную разрешающую способность для измерения этой силы. Заслуга группы исследователей состоит в том, что они разработали новый метод точного измерения граничной силы, необходимой для изомеризации G4-фолдов. Суть подхода состоит в объединении методов резонансного переноса энергии по Фёрстеру для одной молекулы (single-molecule Förster resonance energy transfer - smFRET) и метода магнитных щипцов (принцип действия описан под рисунком), что позволяет ученым работать в пико-Ньютоновом (10-12 Н) диапазоне измерений. Кроме чисто фундаментального результата (точная энергия изомеризации G-квадруплекса), авторы также разработали очень чувствительный метод для дальнейшего исследования динамики G4-фолдов под действием различных агентов белковой и небелковой природы. Поиск соединений, способных увеличить механическую прочность упомянутых структур на теломерах, позволит в будущем выйти на новые стратегии противоопухолевой терапии. Конечно, такая стратегия ещё очень далека от использования в клинике, так как несет в себе несколько потенциальных угроз. Во-первых, G-квадруплексы также найдены в структурах промоторов многих генов, следовательно, их стабилизация может привести к глобальным изменениям профиля экспрессии в клетке, что может привести к непрогнозируемым последствиям. Во-вторых, блокирование сохранения длинны теломер может негативно отразиться на нормальных тканих с высоким пролиферативным индексом (прежде всего эпителиях и системе кроветворения). В-третьих, на разных экспериментальных системах показано, что нестабильность теломер в неопластических клетках является одним из двигателей генетической нестабильности и прогрессии опухоли. Так что исследования в этом направлении продолжаются. Принцип метода, разработанного учеными University of California, Santa Cruz. Создается специальная ДНК-конструкция, которая состоит из G-квадруплекса и боковых цепей ДНК каноничного строения: одна цепь присоединяется к адгезивной поверхности, которой в данном случае служит биотин-стрептавидиновая система, а к другой – ковалентно присоединяется магнитная частичка. Свободный конец ДНК-конструкции притягивается магнитом с известной силой. Для получения информации о конформационном переходе G-квадруплекса в режиме реального времени используется метод smFRET (флюорохромы, между которыми происходит перенос энергии показаны звездочками). Слева представлена схема строения G-фолда. Оригинальная статья (высылается по требованию) Mechanical unfolding of human telomere G-quadruplex DNA probed by integrated fluorescence and magnetic tweezers spectroscopy Nucleic Acids Research, 2013; DOI: P.S. Также почитайте сообщение xenopus за 1 февраля 2013 про исследования по выявлению G-квадруплексов по всему геному челокека: Сообщение было отредактировано danilaman - 27.04.2013 11:03
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 01.05.2013 14:07 |
kriz Постоянный участник |
|
champak12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
jad12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
Ufa1688 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
watchesonline89 Постоянный участник |
|
Ufa1688 Постоянный участник |
|
raymondavis Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Колонка новостей · Следующая тема » |