У этой группы авторов (Коротков и др.) вышла уже целая серия статей по этой тематике и впечатление об этих работах вполне можно составить и на основании доступных текстов.

Не могли бы Вы дать ссылки на работы, о которых Вы упоминали?

  я один из авторов. Некоторые статьи можете скачать из bioinf.narod.ru
Метод изложен в Phys.let.A, на сайте есть.
Постараюсь выложить свежие публикации.
Насчет того, Что авторы "не  знают как использовать полученные данные" - это гипотеза. Скорее авторы не говорят на сегодняшний момент этого и готовят серию новых публикаций, где это феномен будет использован. На все нужно время...

Предмет публикаций непростой, может не все было понятно. Если есть вопросы, пишите, постараюсь ответить, хотя много времени форуму уделить будет трудно.

  ... интереснее и как нам кажется и более важно искать общие свойства у негомологичных белков, которые обладают одинаковой третичной структурой или одинаковой биологической функцией. На наш взгляд это открывает возможности для предсказания биологической функции новых аминокислотных последовательностей и может еще кое-что....

  To:daniil_naumoff
можно использовать термин "высоко подобные последовательности" , это будет адекватно. Т.е. мы не задавались именно явными гомологами, как Вы пишите, это получилось несколько автоматически. Алгоритм ищет как раз высокоподобные последовательности к циклическому профилю. И уже потом оказалось, что очень часто эти понятия для циклического профиля сильно пересекаются...

Пример есть - это NAD+ связывающий сайт. Он обнаруживается у разных белков, но для него удалось создать несколько близких к друг другу циклических профилей с помощью которых этот сайт можно при помощи профильного анализа найти и в новых аминокислотных последовательностях. Это публикация в Мол. Биол, 2003.

  To:daniil_naumoff
можно использовать термин "высоко подобные последовательности" , это будет адекватно. Т.е. мы не задавались именно явными гомологами, как Вы пишите, это получилось несколько автоматически. Алгоритм ищет как раз высокоподобные последовательности к циклическому профилю. И уже потом оказалось, что очень часто эти понятия для циклического профиля сильно пересекаются...

  
Резюмируя:
Один из смыслов работы по NAD+  состоял в том, что последовательности NAD+ часто не подобны друг другу (по данным литературы),  в то же время обладают идентичной или очень похожей пространственной структурой (Россман фолд) и мы нашли, что эти последовательности имеют также похожий скрытый период. Поэтому Вы, вероятно, "ломитесь в открытую дверь"...

  вот эта работа вероятно продолжение
Using Triplet Periodicity of Nucleotide Sequences for Finding Potential Reading Frame Shifts in Genes
F.E. Frenkel and E.V. Korotkov

доступ тут
http://dnaresearch.oxfordjournals.org/cgi/...abstract/dsp002

число классов триплетной периодичности сопоставимо с числом известных биологических функций...

  видимо, специфичность к биологической функции проявляется не только на "длинных" волнах (кратных трем основаниям, например 27 оснований), что можно также видеть на аминокислотных последовательностях, но также и на  минимальной длине равной трем основаниям. Возможно, что триплетная периодичность как периодичность массы может определять спектр собственных колебаний  гена как линейной цепочки (это физики хорошо знают) и этот спектр может быть зачем-то нужен, может быть для  процессов распознования белками определенных последовательностей или для связывания только определенных белков.

  ИМХО, навскидку, не читая, - бредддддд.
Как можно "рецептор сиквенировать более тщательно"???? Вы что пьёте?

  Остатки аспартата и глутамата способны формировать внутримолекулярные водородные связи с атомами остова полипептидной цепи.
Кстати, препараты на основе аспартата и глутамата применяются для усиления вкуса вызывая по видимому управляемые мутации генов, отвечающие за вкусовые рецепторы.
[url=  http://www.mce.su/rus/presentations/p24935/]глутамат и аспартат[/url]

  Хотя конечно, проще сказать, что бред, не затрудняя себя хотя бы малейшей попыткой подумать.

  
А можно, прежде чем обнародовать собственные досужие предположения и тем более выдавать их за чужие опубликованные факты, немного подумать.

  Покажите, пожалуйста, то место в ссылке, где сказано про мутации. Тем более управляемые. Это так, кстати.
А можно, прежде чем обнародовать собственные досужие предположения и тем более выдавать их за чужие опубликованные факты, немного подумать.

  Много другого, полезного и более интересного. А думать я умею, доказательство - CV.
Полный сиквенс генома лежит в Pubmede. Уже лежит.

P.S. Опечатку исправил.