Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* КОЛИНЕАРНОСТЬ -- Всегда ли? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Закрытая темаСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 09.04.2014 09:40     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Постулат о колинеарности ДНК (mРНК) последовательности нуклеотидов гена и последовательности аминокислот в кодируемом белке как бы очевиден и приведен в учебниках. Но попытки найти экспериментальные доказательства этого не на двух-трех белках, а на многих, не дали результата. Если есть ссылки на такое детальное и обширное исследование, дайте ссылку, пожалуйста.
guest: ммм
IP-штамп: frwHRv5zEzGDY
гость



 прочитанное сообщение 09.04.2014 11:33     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Дайте определение колинеарности?
--Но попытки найти экспериментальные доказательства этого не на двух-трех белках, а на многих, не дали результата.

Приведите ссылки на эти безрезультатные попытки.

--Если есть ссылки на такое детальное......
На какое такое детальное, что изучать то должны исследователи? Детали чего?

Когда сформулируете Pubmed вам в помощь ключевые слова в поисковую строку и вперед.
Guest
IP-штамп: frOMzGhUtCMYI
гость



 прочитанное сообщение 09.04.2014 12:36     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

(guest: ммм @ 09.04.2014 11:33)
Ссылка на исходное сообщение  Дайте определение колинеарности?
--Но попытки найти экспериментальные доказательства этого не на двух-трех белках, а на многих, не дали результата.

Колинеарность - точное и однозначное соответствие кодона или кодонов (в случае синонимии) кодируемым аминокислотам в белке.

Приведите ссылки на эти безрезультатные попытки.

Это мои попытки, возможно, недостаточные. В пабмеде не нашел.

--Если есть ссылки на такое детальное......
На какое такое детальное, что изучать то должны исследователи? Детали чего?


Должно быть однозначное соответствие  между кодоном и/или син. кодонами мРНК и кодируемыми ими аминокислотами.


Когда сформулируете Pubmed вам в помощь ключевые слова в поисковую строку и вперед.
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 09.04.2014 12:43     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Это был мой ответ.
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 09.04.2014 13:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

интересное кино- за что же тогда Корана Нобеля получил?
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 09.04.2014 13:16     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

да и что Корана! Что мне Гекуба...Я вот я последние 20 лет гены синтезирую, полагаясь на коЛЛинеарность, до сих пор без проколов. 20 лет-это мало? Боюсь, правда, до ста не дотянуть...А может, сначала Тотальный диктант автору написать, выучить правописание слов, а потом переосмысливать молбиологию?

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 09.04.2014 13:18     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

вот не пойму почему именно генетический код и кодоны и прочее привлекают всевозможных "исследователей"?
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 09.04.2014 13:40     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

(R.J.Dio @ 09.04.2014 14:13)
Ссылка на исходное сообщение  интересное кино- за что же тогда Корана Нобеля получил?

Корана к белковому коду имеет косвенное отношение. Модель ген. кода - это Нобель М.Ниренбергу (1968г.). Да и Ф. Крик внес существенный вклад - адапторная и Вобл-гипотезы.

Наш акад РАН Овчинников, однако, предложил идею ВТОРОРОГО ГЕН. КОДА. Слыхали?
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 09.04.2014 13:47     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

(ship @ 09.04.2014 14:18)
Ссылка на исходное сообщение  вот не пойму почему именно генетический код и кодоны и прочее привлекают всевозможных "исследователей"?

потому что слово "догма" -как красная тряпка быку. Со вторым началом термодинамики та же фигня

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): Дядя ФАКСер, ship, Mike Shelk
Участник оффлайн! Дядя ФАКСер
Постоянный участник
Nothern Maccaronia, Ticinum



 прочитанное сообщение 09.04.2014 13:55     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Овчинников- академик РАН?

P.S. Опять "торсионно-волновой фантом" залетел, что ли? smile.gif
Guest
IP-штамп: frjoQya/mDoAs
гость



 прочитанное сообщение 09.04.2014 15:27     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

(Smisl @ 09.04.2014 13:40)
Ссылка на исходное сообщениеНаш акад РАН Овчинников, однако, предложил идею ВТОРОРОГО ГЕН. КОДА. Слыхали?


Нет, не слыхали. Скорее просветите.
Участник оффлайн! Pharmaсol
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 09.04.2014 15:35     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

(Smisl @ 09.04.2014 14:40)
Наш акад РАН Овчинников, однако, предложил идею ВТОРОРОГО ГЕН. КОДА. Слыхали?


это как у мондошаванов что-ли?

user posted image

Сообщение было отредактировано Pharmaсol - 09.04.2014 15:36
Участник оффлайн! Tuco Ramires
Постоянный участник
Rio Grande



 прочитанное сообщение 09.04.2014 17:55     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Походу, снова на свет вылез ОН smile.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): xenopus
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 09.04.2014 22:50     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

[Овчинников Л.П., Московский Государственный Университет http://bio.fizteh.ru/student/files/biology...articles/f_4ai2]

ЧТО И КАК ЗАКОДИРОВАНО В мРНК

«Если мы за- дадим вопрос, можно ли, имея перед собой последовательность нуклеотидов какой-либо иРНК, таблицу генетического кода и зная, что трансляция иРНК идет в направлении от 5’- к 3’-концу, а белковая цепочка растет от N-конца к C-концу, написать последовательность аминокислот белка, закодированного в этой иРНК, то будем вынуждены ответить на поставленный вопрос отрицательно»

«Все приведенные примеры нарушения общих правил кодирования так или иначе связаны с суще- ствованием определенного контекста в мРНК. Этот контекст или перекодирующие сигналы иногда на- зывают вторым генетическим кодом» (стр. 14)

http://www.psn.ru/index.php?option=com_con...id=52&Itemid=57

http://dic.academic.ru/dic.nsf/enc3p/218006
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 09.04.2014 23:31     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

(Smisl @ 09.04.2014 20:50)
Ссылка на исходное сообщение  [Овчинников Л.П., Московский Государственный Университет http://bio.fizteh.ru/student/files/biology...articles/f_4ai2]

ЧТО И КАК ЗАКОДИРОВАНО В мРНК

«Если мы за- дадим вопрос, можно ли, имея перед собой последовательность нуклеотидов какой-либо иРНК, таблицу генетического кода и зная, что трансляция иРНК идет в направлении от 5’- к 3’-концу, а белковая цепочка растет от N-конца к C-концу, написать последовательность аминокислот белка, закодированного в этой иРНК, то будем вынуждены ответить на поставленный вопрос отрицательно»

«Все приведенные примеры нарушения общих правил кодирования так или иначе связаны с суще- ствованием определенного контекста в мРНК. Этот контекст или перекодирующие сигналы иногда на- зывают вторым генетическим кодом» (стр. 14)

http://www.psn.ru/index.php?option=com_con...id=52&Itemid=57

http://dic.academic.ru/dic.nsf/enc3p/218006

это называется "смотрю в книгу - вижу фигу".

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 09.04.2014 23:34     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

(R.J.Dio @ 09.04.2014 14:16)
Ссылка на исходное сообщение  да  и что Корана! Что мне Гекуба...Я вот я последние 20 лет гены синтезирую, полагаясь на коЛЛинеарность, до сих пор без проколов. 20 лет-это мало? Боюсь, правда, до ста не дотянуть...А может, сначала Тотальный диктант автору написать, выучить правописание слов, а потом переосмысливать молбиологию?

Да, вторая Л в слове коллинеарность, по мысли автора, запросто снимает проблему.
Но вы можете без проколов синтезировать ДНК последовательности до ста и более лет, но это никак не приблизит вас к пониманию истинной роли не синонимических кодонов, а их 32.
Стоит также вспомнить Признание Крика и Ниренберга в 1964 г. Январь. LXXXII, вып. 1
УСПЕХИ ФИЗИЧЕСКИХ НАУК
ФИЗИКА НАШИХ ДНЕЙ
576.1 + 547.963.3
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД*)
Ф. Крик, М. Ниренберг

"Белок, синтезируемый поли-U, состоит не только из лейцина, но и из фенилаланина, причем на каждую молекулу лейцина
приходится 20—30 молекул фенилаланина. При отсутствии в растворе фенилаланина поли-U использует лейцин в количестве, равном половине обычно используемого количества фенилаланина. Молекулярное объясне- ние этой неопределенности неизвестно".

Приведу также очень сильное высказывание Ф.Крика из его книги "Безумный поиск. Личный взгляд на научное открытие", стр. 98: "Важно отметить, что структура генетического кода не имеет очевидного смысла...". Что следует понимать, видимо, что он имел в виду НЕ ОЧЕВИДНЫЙ смысл генетического кода. Что это за смысл, видевшийся Ф.Крику, нам уже не узнать. Возможно, этот смысл увидел Л.П.Овчинников, как "второй генетический код"? Если дело обстоит так, то нужна ревизия основ генетического кодирования...
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 09.04.2014 23:40     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

(ship @ 10.04.2014 00:31)
Ссылка на исходное сообщение  это называется "смотрю в книгу - вижу фигу".

Позвольте спросить, а что видите Вы, кроме фиги?
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 10.04.2014 00:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

я вижу отличную образовательную статью, которую сам читал во времена поступления в аспирантуру.
статья про то, что мРНК это не просто молекула, кодирующая белок, но и в ней самой присутствует множество элементов, регулирующих ее функциональность. напрмиер последовательность Козака, наличие шпилек в 5'НТО, нынче вот еще и сайты микроРНК в 3'НТО, регулирующие стабильность можно добавить и тп.

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): AlexRez, Дядя ФАКСер
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 10.04.2014 08:07     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

(Smisl @ 10.04.2014 00:40)
Ссылка на исходное сообщение  Позвольте спросить, а что видите Вы, кроме фиги?

То же, что и Л.П.Овчинников. И больше.
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 10.04.2014 08:14     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

(ship @ 10.04.2014 01:08)
Ссылка на исходное сообщение  я вижу отличную образовательную статью, которую сам читал во времена поступления в аспирантуру.
статья про то, что мРНК это не просто молекула, кодирующая белок, но и в ней самой присутствует множество элементов, регулирующих ее функциональность. напрмиер последовательность Козака, наличие шпилек в 5'НТО, нынче вот еще и сайты микроРНК в 3'НТО, регулирующие стабильность можно добавить и тп.

Это все понятно. В биосинтезе белков находят все новые регуляторные функции. Однако парадокс - чем больше тактических деталей, тем дальше уходим от стратегии кодирования белков. И, как следствие, ГМ продукты питания, Синтии Крэйга Вентера, заселение планеты трансгенными растениями, животными, бактериями. Нарушение эволюционных темпов, однако. И возможный генетический коллапс биосферы.
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 10.04.2014 08:16     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

Неужели гениальный Ф.Крик ошибался в своем мнении о белковом коде?
Или мы хотим быть святее его?
Участник оффлайн! AlexRez
Постоянный участник
Екатеринбург



 прочитанное сообщение 10.04.2014 09:39     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

(Smisl @ 10.04.2014 09:14)
Ссылка на исходное сообщение  Это все понятно. В биосинтезе белков находят все новые регуляторные функции. Однако парадокс - чем больше тактических деталей, тем дальше уходим от стратегии кодирования белков. И, как следствие, ГМ продукты питания, Синтии Крэйга Вентера, заселение планеты трансгенными растениями, животными, бактериями. Нарушение эволюционных темпов, однако. И возможный генетический коллапс биосферы.


Вы покопайте поглубже и найдете кроме стандартного генетического кода еще с десяток нестандартных (например митохондриальный), и тогда вам совсем страшно жить станет в коллапсирующей биосфере

По моему, было бы гораздо неуютнее, если бы было все просто, линейно, а следовательно примитивно.

Сообщение было отредактировано AlexRez - 10.04.2014 09:45
Участник оффлайн! AlexRez
Постоянный участник
Екатеринбург



 прочитанное сообщение 10.04.2014 09:43     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #23 множественное цитирование

(Smisl @ 10.04.2014 09:16)
Ссылка на исходное сообщение  Неужели гениальный Ф.Крик ошибался в своем мнении о белковом коде?
Или мы хотим быть святее его?


Ну во первых "не сотвори себе кумира", а во вторых - в чем он ошибался? В том, что неосторожно сказал что сам не до конца еще все понял?
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.04.2014 10:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #24 множественное цитирование

весенне обострение. В Кащенко вы найдете- я уверен, и третий генетический код, заодно мидихлориан считать научитесь, не все на мондашаванов ссылаться, есть примеры и покруче!

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер
Guest
IP-штамп: frxGOYQklo76Y
гость



 прочитанное сообщение 10.04.2014 10:52     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #25 множественное цитирование

(Guest @ 09.04.2014 12:36)
Это мои попытки, возможно, недостаточные. В пабмеде не нашел.

Рассказали бы что-нибудь про свои попытки, что ли... Что за Д(Р)НК и белки?
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 10.04.2014 13:29     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #26 множественное цитирование

(AlexRez @ 10.04.2014 10:39)
Ссылка на исходное сообщение  Вы покопайте поглубже и найдете кроме стандартного генетического кода еще с десяток нестандартных (например митохондриальный), и тогда вам совсем страшно жить станет в коллапсирующей биосфере

По моему, было бы гораздо неуютнее, если бы было все просто, линейно, а следовательно примитивно.

Это уже школьниками дают: Код не универсален. Существует 18 белковых кодов для митохондрий и разных видов организмов: The Standard Code The Vertebrate Mitochondrial Code The Yeast Mitochondrial Code The Mold, Protozoan, and Coelenterate Mitochondrial Code and the Mycoplasma/ Spiroplasma Code The Invertebrate Mitochondrial Code The Ciliate, Dasycladacean and Hexamita Nuclear Code The Echinoderm and Flatworm Mitochondrial Code The Euplotid Nuclear Code The Bacterial and Plant Plastid Code The Alternative Yeast Nuclear Code The Ascidian Mitochondrial Code The Alternative Flatworm Mitochondrial Code Blepharisma Nuclear Code Chlorophycean Mitochondrial Code Trematode Mitochondrial Code Scenedesmus Obliquus Mitochondrial Code Thraustochytrium Mitochondrial Code

Но проблема-то не ушла. Те же триплетные коды, только некоторые кодоны поменяли семантику по сравнению со стандартным кодом. И та же проблема: половина кодонов - синонимы. Вторая половина остается с неоднозначным кодированием. То, что сразу обнаружил Ниренберг на одном примере UUU кодона. А таких еще 31. На самом деле кодируют дублеты кодонов. 3'-5' кодон-антикодоновые пары "воблируют", т.е.
случайны по Ф.Крику. Отсюда автоматическое разделения кодонов на две группы - 31 кодон синонимичны и однозначны, отсюда изоакцепторные тРНК. Другая половина кодонов неоднозначна. Что сильно обеспокоило У.Лагеквиста [Lagerkvist U. “Two out of Three”: an alternative method for codon reading.Proc. // Natl. Acad. Sci. USA., 1978.v. 75. p. 17591762. ], поскольку возможны как бы неизбежные ошибки при выборе аминокислот рибосомой на мРНК. Но чтобы спасти модель кода, Лагерквист соврал, что, мол, неоднозначные встречаются редко, поэтому-де не страшно.
И действительно, не страшно. Синтез белка исключительно точен. НО точен вопреки формальной и неправильной логике модели кода Ниренберга-Крика. Тут-то и работает "второй" код Овчинникова, хотя НИГДЕ пояснений от него не последовало, что за "второй". И не тут-ли "неочевидный" смысл структуры кода, на который намекнул Ф.Крик перед уходом в мир иной.

Сообщение было отредактировано Smisl - 10.04.2014 13:34
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.04.2014 13:57     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #27 множественное цитирование

На самом деле кодируют дублеты кодонов.

ну и ладушки, вот вы все себе и объяснили- чего общественность будоражить? Сделайте свой дизайн, пихните в колю, получите полипептид, определите аа состав, и продолжим трындеж
guest: smisl
IP-штамп: frOMzGhUtCMYI
гость



 прочитанное сообщение 10.04.2014 22:32     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #28 множественное цитирование

(R.J.Dio @ 10.04.2014 13:57)
Ссылка на исходное сообщение  На самом деле кодируют дублеты кодонов.

ну и ладушки, вот вы все себе и объяснили- чего общественность будоражить? Сделайте свой дизайн, пихните в колю, получите полипептид, определите аа состав, и продолжим трындеж

Общественности объяснить труднее. В колю пихать зачем, если уже есть анализ. По крайней мере, должен быть. Но не найду. Ведь вопрос не тривиальный. Модель кода - лажа или нет. Допустим, лажа, подгонка под Нобеля. Тогда как быть?
Участник оффлайн! Panaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.04.2014 06:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #29 множественное цитирование

(guest: smisl @ 10.04.2014 23:32)
Ссылка на исходное сообщение  Общественности объяснить труднее. В колю пихать зачем, если уже есть анализ. По крайней мере, должен быть. Но не найду. Ведь вопрос не тривиальный. Модель кода - лажа или нет.  Допустим, лажа, подгонка под Нобеля. Тогда как быть?


Вам никогда не говорили, что теория проверяется практикой?
Или вы не умеете в колю пихать?
Участник оффлайн! AlexRez
Постоянный участник
Екатеринбург



 прочитанное сообщение 11.04.2014 06:25     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #30 множественное цитирование

(guest: smisl @ 10.04.2014 23:32)
Ссылка на исходное сообщение ... если уже есть анализ. По крайней мере, должен быть. Но не найду.


Не найдете? Так может и нет? Может галики? С чего взяли, что должно быть?
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 11.04.2014 08:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #31 множественное цитирование

(Panaev @ 11.04.2014 07:13)
Ссылка на исходное сообщение  Вам никогда не говорили, что теория проверяется практикой?
Или вы не умеете в колю пихать?

Нет, ну это забавно. И в который раз. Как что-будь напишу в молбиоле, с моей точки зрения существенное, как тут же ошибочная комбинаторика моих ударов по клаве стирает текст. Не говоря уже о банных манипуляциях со мной. Ладно, не поленюсь и наберу еще раз.
Итак, благодарю за ценный совет насчет теории и практики. smile.gif
Экспериментальная проверка всегдашней или не всегдашней применимости принципа коллинеарности не так прост, как видится на первый взгляд. Беглый просмотр мРНК последовательностей по банкам данных в гугле показал, что не указывают точное положение кодонов, в т.ч. стартовых. И не сопоставляют с белками. Поэтому сопоставлять с аминокислотными последовательностями соответствующих белков невозможно. Опять же надо учитывать возможные прыжки рибосом по мРНК. Поэтому логический анализ по лит. данным становится проблематичным. А если самим взяться за практику, как вы советуете, то это большая и дорогая работа, не входящая в наши планы.
И главное. Меня вполне устраивает чисто логический анализ святой канонической таблицы классического генетического кода. Его проделал еще аспирантом каф. мол. биологии биол. ф-та МГУ. Только не забудьте о Криковском воблировании 3'-5' кодон-антикодоновой пары, НЕ УЧАСТВУЮЩЕЙ в кодировании. Гарантирую, получите несравненное удовольствие от ущучивания Нобелиатов. Но это и печально... weep.gif
Участник оффлайн! Panaev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.04.2014 08:57     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #32 множественное цитирование

Ну ладно, вы не умеете анализировать последовательности. Бывает.
А зачем вам вообще что-то искать в базах? Синтезируете ген с нужными вам кодонами, запихиваете в плазмиду, плазмиду в колю. Коля вам экспрессирует белок, сиквенируете белок, сравниваете две последовательности - ответ на вопрос.
А то чем вы занимаетесь здесь - словесный онанизм.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): R.J.Dio
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 11.04.2014 11:17     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #33 множественное цитирование

(Panaev @ 11.04.2014 09:57)
Ссылка на исходное сообщение  Ну ладно, вы не умеете анализировать последовательности. Бывает.
А зачем вам вообще что-то искать в базах? Синтезируете ген с нужными вам кодонами, запихиваете в плазмиду, плазмиду в колю. Коля вам экспрессирует белок, сиквенируете белок, сравниваете две последовательности - ответ на вопрос.
А то чем вы занимаетесь здесь - словесный онанизм.

Сир, вы недостаточно воспитаны. Что, вообще, является стилем и даже методом общения тут. То, что вы предлагаете, для меня не осуществимо и не очень интересно по многим причинам, часть которых указал. Да и не имеет смысла для меня. Так, из любопытства убедиться в собственной правоте. Мы работаем с другими уровнями генетического кодирования, эпигенетическими, которые, в частности, позволяют нам программировать стволовые клетки. И это косвенно доказывает, что кодирование белков - лишь часть генетических программ. И "второй" генетический код, тихо и без объяснений провозглашенный акад. РАН Л.П.Овчинниковым (кстати, без ссылки на меня... нехорошо, лёва...), составляет один из многих кодов.
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.04.2014 11:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #34 множественное цитирование

во. Тут собака порылась. Программирование стволовых клеток. Короче, бабло стричь с лохов, во всех видах и под прикрытием любых комбинаций умных слов. Все понятно с вами, идите в жопу

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): AlexRez
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.04.2014 12:35     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #35 множественное цитирование

конечно есть! на каждом шагу таких полно...ниспровергателей основ. А присмотришься-ба! бабло. Или вы считаете это клеветой? Отлично, тогда так: согласно моим оценочным суждениям- далее по тексту. И все, уже я чист перед законом, а вы идете в жопу, как и ранее
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 11.04.2014 12:52     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #36 множественное цитирование

Давайте, будем вести себя достойно.
Участник оффлайн! Дядя ФАКСер
Постоянный участник
Nothern Maccaronia, Ticinum



 прочитанное сообщение 11.04.2014 13:24     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #37 множественное цитирование

(Smisl @ 11.04.2014 07:08)
Ссылка на исходное сообщение  Его проделал еще аспирантом каф. мол. биологии биол. ф-та МГУ......  Только не забудьте о Криковском воблировании 3'-5' кодон-антикодоновой пары, НЕ УЧАСТВУЮЩЕЙ в кодировании.....

N-е пришествие...И что дедушке дома не сидится спокойно? lol.gif
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 11.04.2014 14:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #38 множественное цитирование

(AlexRez @ 10.04.2014 10:43)
Ссылка на исходное сообщение  Ну во первых "не сотвори себе кумира", а во вторых - в чем он ошибался? В том, что неосторожно сказал что сам не до конца еще все понял?

Несмотря на суровую критичность в конце своей жизни, Ф.Крик очень тонко и умнО оценил их с М.Ниренбергом работу. Он сказал о НЕ ОЧЕВИДНОСТИ знаковой структуры кода. Это означает, что он интуитивно чувствовал ее, эту не очевидность. Скорее всего, его мучал результат с поли-U РНК, когда выявилась НЕ ОДНОЗНАЧНОСТЬ кодирования аминокислот. Он и Ниренберг искали и не находили ответ о природе этой неоднозначности на молекулярном уровне. А ведь не однозначность кодирования, даже в случае одного триплета UUU, фактически опровергала их модель. Поиск ответа на молекулярном уровне был ошибкой. Не однозначность кодирования аминокислот и стопов следует из ЛИНГВИСТИЧНОСТИ генетического кодирования. А это уже совершенно иная область работы генома.
Участник оффлайн! AlexRez
Постоянный участник
Екатеринбург



 прочитанное сообщение 11.04.2014 16:31     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #39 множественное цитирование

(Smisl @ 11.04.2014 12:17)
Ссылка на исходное сообщение ... То, что вы предлагаете, для меня не осуществимо и не очень интересно по многим причинам,...


Ну если не осуществимо, так что вы лезете со своим бездоказательным бредом. Для большинства здесь присутствующих это осуществимо и проделано многократно и никаких проблем с генетическим кодом не возникало.
Участник оффлайн! AlexRez
Постоянный участник
Екатеринбург



 прочитанное сообщение 11.04.2014 16:58     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #40 множественное цитирование

(Smisl @ 11.04.2014 15:13)
Ссылка на исходное сообщениеОн сказал о НЕ ОЧЕВИДНОСТИ знаковой структуры кода. Это означает, что он интуитивно чувствовал ее, эту не очевидность. Скорее всего, его мучал результат ...


Вы придаете словам сложный магический смысл. Может не стоит выстраивать целую теорию всемирного заговора нобелевских лауреатов на паре не имеющих смысла фраз?
Участник оффлайн! AlexRez
Постоянный участник
Екатеринбург



 прочитанное сообщение 11.04.2014 17:35     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #41 множественное цитирование

(Smisl @ 11.04.2014 09:08)
Ссылка на исходное сообщение  ... Только не забудьте о Криковском воблировании 3'-5' кодон-антикодоновой пары, НЕ УЧАСТВУЮЩЕЙ в кодировании. Гарантирую, получите несравненное удовольствие от ущучивания Нобелиатов...


(Smisl @ 11.04.2014 15:13)
Ссылка на исходное сообщение  ... следует  из ЛИНГВИСТИЧНОСТИ генетического кодирования...


Как то пахнуло Гаряевским волновым геномом
Guest
IP-штамп: frOMzGhUtCMYI
гость



 прочитанное сообщение 11.04.2014 22:07     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #42 множественное цитирование

(AlexRez @ 11.04.2014 16:31)
Ссылка на исходное сообщение  Ну если не осуществимо, так что вы лезете со своим бездоказательным бредом. Для большинства здесь присутствующих это осуществимо и проделано многократно и никаких проблем с генетическим кодом не возникало.

Вы не понимаете простого: генетический код сам по себе и его модель в ваших головах - это не одно и то же. Еще раз - генетический код работает великолепно и является результатом либо миллиарднолетней эволюции, либо сознательным актом творения. О возможности последнего говорят блестящие исследования В.И Щербака, показавшего чисто математически, что генетический код оперирует понятием нуля, что недостижимо чистой физико-химии взаимодействия всех фигурантов белкового синтеза.
А вам, любезный и вежливый, полезно было бы посидеть над канон таблицей ген кода и увидеть, наконец, что половина кодонов (их дублеты) не однозначно кодируют аминокислоты и стоп-позиции. И еще раз, если отскакивает от медного лба, этот факт чисто экспериментально доказал М.Ниренберг на одном из неоднозначных кодонов, точнее, на поли U РНК. Не поняли гигантского значения этого ни он, ни Ф.Крик. Отсюда и пошел коленопреклоненный идиотизм почитания их модели кода, идиотизм, который таки осознал Ф.Крик. Даже пытался отказаться от Нобелевской.
Guest
IP-штамп: frOMzGhUtCMYI
гость



 прочитанное сообщение 11.04.2014 22:15     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #43 множественное цитирование

(AlexRez @ 11.04.2014 16:58)
Ссылка на исходное сообщение  Вы придаете словам сложный магический смысл. Может не стоит выстраивать целую теорию всемирного заговора нобелевских лауреатов на паре не имеющих смысла фраз?

Никакой магии и заговора, но чистая логика, из которой следует, что базовая концепция генетического кодирования, принятая пока повсеместно, - колосс на глиняных ногах, научный голем современности. Но колосс уже грохнулся, поскользнувшись на ГМО и Синтиях Мексиканского залива, где умирает все живое, включая людей на побережье. Такова цена ошибочной модели Ниренберга-Крика.
Участник оффлайн! Smisl




 прочитанное сообщение 11.04.2014 22:29     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #44 множественное цитирование

Это мой пост.
Участник оффлайн! Tuco Ramires
Постоянный участник
Rio Grande



 прочитанное сообщение 12.04.2014 11:33     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #45 множественное цитирование

(AlexRez @ 11.04.2014 18:35)
Ссылка на исходное сообщение  Как то пахнуло Гаряевским волновым геномом


lol.gif Коллега, без обид:

Посадили трех индейцев в тюрьму. В первый день Могучий Бизон пытался разогнуть решетку - не осилил. На второй день Проворный Олень пробовал выскочить в окошко - но и он не преуспел. И только на третий день Орлиный Глаз заметил, что в тюрьме отсутствует четвертая стена.

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): AlexRez, Дядя ФАКСер
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.04.2014 12:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #46 множественное цитирование

ура, Синтия. ГМО. НЛО. Инопланетяне на Луне. Взрыв кальдеры Йелустоуна. Астероид столкнется с Землей. Ванга предсказала конец света. HIV-биооружие, разработанное ЦРУ. Как страшно жить. Держитесь там, не теряйте Smisl жизни
Участник оффлайн! Tuco Ramires
Постоянный участник
Rio Grande



 прочитанное сообщение 12.04.2014 14:03     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #47 множественное цитирование

(R.J.Dio @ 12.04.2014 13:32)
Ссылка на исходное сообщение  ура, Синтия. ГМО. НЛО. Инопланетяне на Луне. Взрыв кальдеры Йелустоуна. Астероид столкнется с Землей. Ванга предсказала конец света. HIV-биооружие, разработанное ЦРУ. Как страшно жить. Держитесь там, не теряйте Smisl жизни

Еще Нибиру с рептилоидами!!! Не стоит их недооценивать.... umnik.gif
Участник оффлайн! R.J.Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.04.2014 14:14     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #48 множественное цитирование

каждый век рождает свои сказки. Мифы Греции, эпосы средневековья, далее западно-европейские сказки, наконец, нынешняя Si-fi и фэнтази. И все в таком духе. Нормально
guest: Smisl
IP-штамп: frOMzGhUtCMYI
гость



 прочитанное сообщение 12.04.2014 16:40     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #49 множественное цитирование

Вот вы, господа, как раз и живете главным мифом биологии. Ну ладно бы, тешились им как мифом, сказкой. Так нет же - в практику вводите. Неужто не видно, куда идем по мифическим путям? Сумасшествие какое-то, право дело. Зомбаж.
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.04.2014 17:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #50 множественное цитирование

ага... земля налетела на небесную ось?
петр петрович, кончайте кликушествовать.
идите на природу, пожарьте шашлыка, выпейте водки, потетешкайтесь со внуками... внуки-то есть?
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Закрытая темаСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.05.22 16:24
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft