Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* моделирование процесса эмбрионального развития. (в .т.ч. и реверсное)
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Dark Templar




 прочитанное сообщение 27.04.2015 16:59     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Как думаете есть в этом смысл?

Идея появилась создать 3д модель клетки, а именно цитоскелета + очертания мембраны т.е. смоделировать придание внешних очертаний 1ноклеточного и анатомии много клеточного организма, который будет в программе развиваться делениями от 1 клетки до взрослого многоклеточного организма.

Механизм, ядро процесса, сделать из того, что уже известно науки + все белые пятна разработать с 0ля используя логику и с подходом - а как бы я это сделал будучи инженером клеток, словно мы сами разрабатываем клетку.

В итоге получится программка, которая по виртуальному ген. коду сможет "развернуть " цитоскелет, придать форму виртуальной клетки, а в многоклеточный организм сможет смоделировать эмбриональное развитие из 1ной клетки в многоклеточный организм.

Предположительно, с хорошим програмером это дело 3х месяцев работы (может кто согласится smile.gif ). Мне ничего с этого особо не нужно, есть исключительно только научный интерес. Интересуюсь этим как энтузиаст, хоть образование и есть, но работать по диплому не сложилось, ушел в небольшой бизнес.

вариант механизма № 1 (оч. кратко)

(одноклеточное)

(программирование размеров и внешней границы очертаний клетки)
нужна центральная точка. Нужен узел, которые задаст вектора (направления) волокон цитоскелета.

Нужна система, контроля длин этих трубок (столько то звеньев по вектору такому-то)на концах трубок - горизонтальный скелет, который соединит соседние вектора.

возможно наличие нескольких таких узлов, связанных между собой.

(многоклеточное)

Вектора используются как линии передачи данных - информационных макромолекул, которые (вариант) создают на поверхности мембран в "стыковочных узлах" некие информационные комплексы, которые сигнализируют стадии и пути дифференцировки клетки, данные о её местоположении в дифференцированных комплексах. Таким образом, формируется что-то вроде сети и это уже позволит строить многоклеточные организмы.

я сделал группу энтузиастов по тематике биопрограммирования, может кому-то будет интересно.
https://vk.com/club73676772

Сообщение было отредактировано Dark Templar - 27.04.2015 17:03
Участник оффлайн! Diusha
Участник
Питер



 прочитанное сообщение 28.05.2015 12:15     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Уточните, Вы хотите создать просто «демку» (мультик, показать как это выглядит внешне) или смоделировать реальность (со всеми (по возможности) процессами в клетке)? Во втором случае, думаю, 3 месяца – это не срок разработки, а срок выполнения разработанной программы wink.gif, о времени разработки даже боюсь задумываться.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Bear
Участник оффлайн! Dark Templar




 прочитанное сообщение 28.07.2017 18:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

(Diusha @ 28.05.2015 13:15)
смоделировать реальность (со всеми (по возможности) процессами в клетке)?
Почти, все процессы в клетке описывать не получится, да и не известны они все.

Описать взаимодействия мембран, упрощенная динамика цитоскелета и учитывать известные науке данные связанные именно с эмбриогенезом.

Пока попытки не удачны, т.к. все завязано на виртуальную среду 3д среду, столкновения, запрет пересечений, 3д геометрия... и т.д.
А желание есть большое. Чтоб не изобретать велосипед начинаю рыть готовые 3д движки.

Хотел бы, чтоб кто-то что-то умное посоветовал.
Участник оффлайн! pApA2017




 прочитанное сообщение 19.09.2017 17:14     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Проект звучит очень интересно. Однако, такой сложный проект без методологии управления проектами будет очень трудно тянуть. И чем дальше, тем сильнее будет нарастать энтропия. Пока просто не надоест. Я бы начал с того, что четко определил продукт проекта. Изучил бы PMBOK. Привлек бы к проекту комманду по проектному менеджменту. Утвердил бы распорядок и планерки. Обязательно вести протокол совещаний.
Я к тому, что непонятно, что Вы хотите и какими методами хотите к этому придти. И какие задачи хотите решить.
И опять же - это для себя, для хобби, для обучения, или нацеленность на коммерциализацию?

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 17.10.17 18:06
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft