Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Правильность использования метода главных компонент
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! d-taras




 прочитанное сообщение 20.04.2016 12:07     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Здравствуйте!
Имеется списки видов, относящиеся к разным классам растительности. Для каждого вида приведена качественная характеристика (по жизненной форме, географическому распространению и т. п.). Мы сделали сравнение видового состава классов по отдельным параметрам. Теперь необходимо показать различия в комплексе. Правомочно ли преобразовать качественные характеристики в цифровые и использовать метод главных компонент, как это показано в книге «Наглядная статистика...» рис. 40?
Участник оффлайн! Nikolya

Россия



 прочитанное сообщение 20.04.2016 16:10     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Дайте ссылку на этот рисунок. Легче будет рассуждать на эту тему.
Участник оффлайн! ИНО
Постоянный участник
Донецк



 прочитанное сообщение 20.04.2016 16:29     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Nikolya, Вы явно избрали неправильную тактику освоения данного форума. Думается, конкретно на эту тему рассуждать Вам еще рановато, уж лучше про осиных "царей и крестьян".
Участник оффлайн! PS2004R
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.04.2016 10:52     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(d-taras @ 20.04.2016 12:07)
Ссылка на исходное сообщение  Здравствуйте!
Имеется списки видов, относящиеся к разным классам растительности. Для каждого вида приведена качественная характеристика (по жизненной форме, географическому распространению и т. п.). Мы сделали сравнение видового состава классов по отдельным параметрам. Теперь необходимо показать различия в комплексе. Правомочно ли преобразовать качественные характеристики в цифровые и использовать метод главных компонент, как это показано в книге «Наглядная статистика...» рис. 40?


Можно перевести показатели описывающие виды из номинальной и порядковой шкал в dummi и выполнить PCA. Но стоит сначала попробовать multiple correspondence analysis.
Участник оффлайн! Den-N
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.04.2016 22:35     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(d-taras @ 20.04.2016 15:07)
Ссылка на исходное сообщение  Здравствуйте!
Имеется списки видов, относящиеся к разным классам растительности. Для каждого вида приведена качественная характеристика (по жизненной форме, географическому распространению и т. п.). Мы сделали сравнение видового состава классов по отдельным параметрам. Теперь необходимо показать различия в комплексе. Правомочно ли преобразовать качественные характеристики в цифровые и использовать метод главных компонент, как это показано в книге «Наглядная статистика...» рис. 40?

Книга «Наглядная статистика...» не является учебником по практическому использованию многомерных методов. Для вас она одну из своих задач выполнила - привлекла внимание красивым рисунком. Далее нужно разбираться с теорией и пакетами.
1) Нужно разобраться с линейностью. РСА - исключительно линейная техника: вся нелинейность уйдёт в ошибку + исказится ординация. Может лучше нелинейный анализ главных компонент или даже анализ главных координат с более подходящей мерой сходства/расстояния?
2) РСА, как и анализ соответствий (CA), - непринудительная (unconstrained) ординационная техника, или по одной из классификаций - техника непрямого градиентного анализа. Т.е. она анализирует всю изменчивость, не отделяя независимые переменные (регрессоры) от зависимых (откликов). Может имеет смысл принудить пакет искать только ту изменчивость, которая вызвана переменными-регрессорами? Т.е. использовать не главные компоненты, а анализ избыточности (Redundancy analysis), или не СА, а канонический анализ соответствий (ССА)?
И.т.д.
Посмотрите раздел про ординацию в книге: Джонгман - Анализ данных в экологии сообществ (есть в сети). Для начала...

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 22.10.17 18:38
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft