Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Картирование плазмид
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! HayBiol

Волгоград



 прочитанное сообщение 13.07.2016 12:50     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Здравствуйте! Помогите с таким вопросом, с помощью каких методов биоинформатики происходит картирование плазмид. Где можно почитать об этом? Как происходит нахождение определенной последовательности или сайта в плазмиде с помощью компьютера. Заранее премного благодарен.
Участник оффлайн! Flyamer
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  13.07.2016 14:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Ctrl+F
Участник оффлайн! Sergeant
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.07.2016 15:29     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Как происходит нахождение определенной последовательности или сайта в плазмиде с помощью компьютера.

Если вам на школьном уровне, то банально двумя вложенными циклами можно ограничиться. Если хотите серьезно в вопросе разобраться и нетривиальные методы изучить - читайте нестареющую классику:
Гасфилд Дэн
Строки, деревья и последовательности в алгоритмах: Информатика и
вычислительная биология / Пер. с англ. И. В. Романовского. — СПб.: Невский
Диалект; БХВ-Петербург, 2003. — 654 с: ил.

Но эта книга требует серьезных усилий для освоения матерьяла.
Участник оффлайн! HayBiol

Волгоград



 прочитанное сообщение 13.07.2016 15:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(Sergeant @ 13.07.2016 16:29)
Ссылка на исходное сообщение  Если вам на школьном уровне, то банально двумя вложенными циклами можно ограничиться.  Если хотите серьезно в вопросе разобраться и нетривиальные методы изучить  - читайте нестареющую классику:
Гасфилд Дэн
Строки, деревья и последовательности в алгоритмах: Информатика и
вычислительная биология / Пер. с англ. И. В. Романовского. — СПб.: Невский
Диалект; БХВ-Петербург, 2003. — 654 с: ил.

Но эта книга требует серьезных усилий для освоения матерьяла.

Нет, хотелось бы именно серьезно разобраться, потому что хочу об этом подробнее узнать , а не просто ответ получить. Спасибо вам!
guest: petr
IP-штамп: fr.yb665GNCeo
гость



 прочитанное сообщение 13.07.2016 16:26     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Vector NTI, и т.д.
Участник оффлайн! Sergeant
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.07.2016 16:53     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

(guest: petr @ 13.07.2016 14:26)
Ссылка на исходное сообщение  Vector NTI, и т.д.

Это не метод- это инструмент. smile.gif
Участник оффлайн! Sergeant
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.07.2016 18:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

хотелось бы именно серьезно разобраться

Серьезно разобраться- тогда берете эту книгу и каждый алгоритм реализуете на любом из знакомых вам языков программирования. Иначе никак. Уйдет на это не один месяц, но толк будет.
Участник оффлайн! HayBiol

Волгоград



 прочитанное сообщение 13.07.2016 19:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

(Sergeant @ 13.07.2016 19:48)
Ссылка на исходное сообщение  Серьезно разобраться- тогда берете эту книгу и каждый алгоритм реализуете на любом из знакомых вам языков программирования. Иначе никак. Уйдет на это не один месяц, но толк будет.

то есть чтения будет маловато, так?) Тогда по другому вопрос поставлю, мне необходимо узнать о методах распознавания сайтов в плазмидах, как тот или иной сайт находят в плазмиде , какие инструменты используют и т.д. Прошу прощения, если вопрос повторился. Если ответом все таки является эта книга, то вопросов больше нет
Участник оффлайн! Sergeant
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.07.2016 20:20     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

распознавания сайтов в плазмидах

сайты бывают разные. И ищут их РАЗНЫМИ инструментами.
Поиск сайтов рестрикции есть практически во всех пакетах(Geneous, VectorNTI, Clone Manager, ...) и злой куче онлайн сервисов.
Можно искать ориджины репликации, сигнальные пептиды, промотеры и т.д.
вы уж определитесь, что вам надо.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 17.10.17 05:07
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft