Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Связь с частотой аллеля.
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Александр Игошин




 прочитанное сообщение 22.03.2017 14:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Ситуация: есть список, состоящий из нескольких тысяч SNP и их частот в 50 популяциях, также есть некоторая переменная в общем случае (в моем - минимальная среднемесячная температура в районе каждой популяции). Необходимо протестировать связь между частотами аллелей в популяциях по всем снипам и моей переменной. Как это лучше сделать? Встречал исследования, где для подобных целей используется ранговая корреляция Спирмена, но меня это по некоторым причинам не устраивает. Можно ли, и корректно ли, использовать обычный коэффициент корреляции Пирсона? Или какой-нибудь совет на этот счет. Заранее благодарю!
Участник оффлайн! PS2004R
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.03.2017 20:31     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

(Александр Игошин @ 22.03.2017 14:39)
Ссылка на исходное сообщение  Ситуация: есть список, состоящий из нескольких тысяч SNP и их частот в 50 популяциях, также есть некоторая переменная в общем случае (в моем - минимальная среднемесячная температура в районе каждой популяции). Необходимо протестировать связь между частотами аллелей в популяциях по всем снипам и моей переменной. Как это лучше сделать? Встречал исследования, где для подобных целей используется ранговая корреляция Спирмена, но меня это по некоторым причинам не устраивает. Можно ли, и корректно ли, использовать обычный коэффициент корреляции Пирсона? Или какой-нибудь совет на этот счет. Заранее благодарю!


library(Boruta) и другие методы "relevant feature selection"

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 21.10.17 04:23
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft