Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Синтез короткой РНК -- Где дешевле? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 01.09.2017 11:19     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Требуется РНКовый аптамер, ингибирующий обратную транскриптазу. mol.gif
Последовательности таких аптамеров известны с 1994 года и за бугром они давно применяются. Например, NEB с 2014 года продаёт "WarmStart® RTx Reverse Transcriptase" - MMLV-ревертазу с аптамерным горячим стартом. Хотелось бы сделать доморощенный дешёвый вариант, т.е. добавить к отечественной дешёвой ревертазе дешёвый же РНКовый аптамер. Качество такого синтеза, если не ошибаюсь, особого значения не имеет. Главное - побольше и подешевле.

Отсюда - вопрос:
Где дешевле всего заказать синтез РНКового олигонуклеотида длиной 33N (лучше 41N)? confused.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 01.09.2017 11:20
Участник оффлайн! X34




 прочитанное сообщение 03.09.2017 15:22     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

с моей колокольни либо Карпов и ко (Позмогова и тд), либо Новосибирцы. без вариантов на мой взгляд

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): genseq
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 04.09.2017 09:13     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Новосибирцы - это к Рихтеру?
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 04.09.2017 14:16     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(genseq @ 01.09.2017 12:19)
Ссылка на исходное сообщение  Требуется РНКовый аптамер, ингибирующий обратную транскриптазу.  mol.gif
Последовательности таких аптамеров известны с 1994 года и за бугром они давно применяются. Например, NEB с 2014 года продаёт "WarmStart® RTx Reverse Transcriptase" - MMLV-ревертазу с аптамерным горячим стартом. Хотелось бы сделать доморощенный дешёвый вариант, т.е. добавить к отечественной дешёвой ревертазе дешёвый же РНКовый аптамер. Качество такого синтеза, если не ошибаюсь, особого значения не имеет. Главное - побольше и подешевле.

Отсюда - вопрос:
Где дешевле всего заказать синтез РНКового олигонуклеотида длиной 33N (лучше 41N)? confused.gif

Если есть у тебя соответствующая ревертаза, работающая при 55-60 град., я бы по синтезу аптамеров "за ценой не постоял".
Синтезируют все, кому не лень, а по оптовым ценам надо договариваться отдельно, в теплой обстановке с хорошей закуской... smile.gif
Если у тебя ревертаза для 37 град. - извини, это, как любят выражаться на молбиоле, зонтик для подводной прогулки.
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 04.09.2017 15:19     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Соответствующей ревертазы нет. Но мне кажется, что для одношаговой РТ-ПЦР, т.е. для синтеза коротких (150...300 п.о.) кДНК, можно использовать и обычную, которая инактивируется на 50% при 44 град. за 10 минут. Пару минут она продержится и на 50 градусах.

Что касается термостабильности, то все необходимые для неё аминокислотные замены в литературе давно описаны. И получить штамм-продуцент такой ревертазы может даже вьетнамский студент:
http://nsu.ru/xmlui/handle/nsu/11954
Единственная проблема - отсутствие заказчика. wink.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 12.09.2017 14:17
Участник оффлайн! R-J-Dio
Участник



 прочитанное сообщение 05.09.2017 10:47     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

(genseq @ 04.09.2017 16:19)
Ссылка на исходное сообщение  Соответствующей ревертазы нет. Но мне кажется, что для одношаговой РТ-ПЦР, т.е. для синтеза коротких (150...300 п.о.) кДНК, можно использовать и обычную, которая инактивируется на 50% при 44 град. за 10 минут. Пару минут она продержится и на 50 градусах.

Что касается термостабильности, то все необходимые для неё аминокислотные замены в литературе давно описаны. И получить штам-продуцент такой ревертазы может даже вьетнамский студент:
http://nsu.ru/xmlui/handle/nsu/11954
Единственная проблема - отсутствие заказчика.  wink.gif

пущинский мечтатель, даже не кремлевский... Знал бы, о чем говорил...
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.09.2017 21:29     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

У нас как-то вообще все невесело в отечестве с относительно современными ферментами и смесями.
А наценки на забугорные - в 2-3 раза.

Сообщение было отредактировано avial - 10.09.2017 21:30
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.09.2017 10:42     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Самый дешёвый силикатный сорбент сделал:
http://magno.ucoz.com/
Похоже, придётся заняться и самыми дешёвыми ферментами для ОТ-ПЦР (с аптамерным горячим стартом).

Проще всего сделать аналог Volcano2G DNA polymerase:
http://www.mypols.de/volcano-dna-polymerase-2/
Это модификация KlenTaq, обладающая ревертазной активностью. Но в рекламе рекомендуют использовать её для ампликонов длинной не больше 300 п.о., а в методических рекомендациях - не больше 200 п.о.. Наверное, лучше ориентироваться на получение термостабильного варианта MuMLV RT, хотя с ним возни будет больше. confused.gif
Участник оффлайн! R-J-Dio
Участник



 прочитанное сообщение 11.09.2017 12:07     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

пылесос + фонарик+ магнитола в одном флаконе. А вот если б еще и кофемолку впридачу.
Участник онлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.09.2017 13:27     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Собрал немного информации о мутациях, повышающих термостабильность обратной транскриптазы MoMLV и придающих ревертазную активность Taq ДНК-полимеразе.
Буду признателен за любые дополнения, замечания и предложения.

Файл/ы:

скачать файл MoMLV_RT.doc
размер: 410к
кол-во скачиваний: 16



скачать файл Taq_RT.doc
размер: 115.5к
кол-во скачиваний: 11


Участник оффлайн! R-J-Dio
Участник



 прочитанное сообщение 12.09.2017 13:29     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

кто еще колесо не изобретал?! Пора уж нам замахнуться и на вечный двигатель, вполне грантоемкое дело

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 17.12.17 17:07
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft