(Nostardamus @ 06.08.2016 00:56)
Ссылка на исходное сообщение Немного детализировать бы.
Н-с:
1.Что понимаете под "определением функцией очередного триплета"? Особенно интересно, как определяется функция кодона не синонима.
2. Как определяется, причем "примерно", стоп кодон?
3. Что есть сайты с обоймой тРНК = микродвижения...?
4. Как Сайт точно подводит нужную тРНК на кодон?
5. "нет никакого близкодействия и дальнодействия"... Если их вообще нет, то взаимодействие кодон-антикодон осуществиться вообще-то, вроде, не могут...
Сергей:
1 - потому что, при считывании мРНК, рРНК решает что делать после инструкций триплета и даже большего фрагмента.. На все типы кодонов у рРНК -есть ответ ,некоторые могут оказаться неустойчивыми, т.е. , давать разные результаты.
Н-с: Это так, но вопрос-то в другом. Такие слова как "решает, что делать", "есть ответ" - поэтические метафоры. Это не наука. Это снова скатывание к Маленьким Зеленым Человечкам (МЗЧ), которые "решают и дают ответы". Но тем не менее видимость решений-ответов есть, поэтому задача - понять, как такие решения-ответы получаются на самом деле. Если игнорировать такую задачу, то можно утверждать, что в растворе катион Na "решает" присоединиться к аниону Cl потому, что у них разные заряды.
2 - известно,что рРНК чувствует приближение СТОП кодона,а значит не только его,есть "предварительный" просмотр..
Н-с: снова МЗЧ - они, родимые, "чувствует-просматривает". Антропоморфизм...
3 - потому что та скорость с которой работает рибосома не может быть обеспечена свободной диффузией "заряженных" АК тРНК -чистая кинетика..
Н-с: Кинетика? Да. Но ей предшествуют опять-таки МЗЧ, что особенно чётко проявляется при выборе семантики дублетам кодонов-омонимов. Тут уж явное и чистое подобие принятию правильного решения. Но оно - результат работы рибосомы в целом как нанобиокомпьютера. А.Н.Спирин толкует, по сути, о том же. Но большинство норовит спрятаться за чистую физ-химию. Но разводят руками, когда речь идет о мышлении-сознании на уровне нейронов коры головного мозга. Тут уж физ-химия как-то теряется.
4 - информация о кодоне - триплете - запускает цепочку из физ-хим процессов приводящих к подводу тРНК к месту "работы" в определённом стерическом положении.
Н-с: Эта цепочка есть, но она под контролем биокомпьютинга. Контроль этот иногда работает вопреки физ-химии, например, когда нарушается канон Уотсона-Крика A-U, G-C
при кодировании аминокислот кодонами.
5 - Я имею ввиду ваши элементарные представления о строении и функционировании рибосомы., которая, ещё раз повторяю: представляет из себя древнейшую РНК-машину ..
Нс: эта "машина" в действительности квази разумный нанобиокомпьютер. Вы этого боитесь? Это не страшно и не ведет к религии.
Ваши ремарки по каждому пункту находят свой ответ в последующих пунктах.
Я подробно расписал процесс. Изучение этого процесса задача тонкая и сложная, но она будет решена.
Используемые термины- могут быть заменены на более механистиеские по мере заполнения белых мест в знании соответствующими терминами.. Пока самый апофеоз - это съёмка относительных движений малой и большой части рибосомы. Малоугловые рентгеновские камеры ( тут в Уфе есть такой,мне его показывал зав. лаб..) надо будет обсудить с ним вопрос участия в этих исследованиях с этим агрегатом..
Тут ясна цепочка событий она следует из кинетики процесса.. Так в 2006 году я предложил вертикальную организацию строения клетки и оказался прав. Теперь это уже входит в наше представление о строении и архитектуре клетки.. А откуда я это взял? из анализа кинетики работы клетки.. Другая организация не позволяла объяснить известные факты о процессинге в клетке.. Вот так.. без богов и религии..