Web-сайт MolBiol.ru
 

English   Deutsche Fassung  Український варіант
[Войти] [Регистрация]
Всё
всего сообщений: 3958   страницы (198): « < 190 191 192 193 194 195 196 > » 

раздел новостей: Софт Ещё о перекодировке
14.05.2002 10:14  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Совсем забыл упомянуть о том, что перекодировщик написан на JavaScript и исполняется на компьютере пользователя.
Тем, кто понимает: если появятся идеи по поводу улучшения перекодировщика - можете сами переписать программу (она очень короткая).
Для неспециалистов только вывод - достаточно сохранить на своём компьютере любую страницу форума и у вас будет собственный перекодировщик (то же самое - для всех программ из раздела "Расчёты" и виртуальных клавиатур со страниц поисков (по сайту и по форуму).
Чужие транслитовские тексты теперь можно читать после перекодировки: копируете сообщение в окно отправки и жмёте кнопку "Транслит" (я именно так и поступаю).



раздел новостей: Информация Перекодировка с транслита
13.05.2002 10:12  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Хочется надеяться, что с ломающим глаза транслитом удалось разобраться. На форуме появился встроенный перекодировщик. Программа взята с сайта "Ролевой Израиль" - толкиенистика и ролевые игры (удачных им сражений ).
Перекодировщик предназначен для тех, у кого не установлена русская раскладка клавиатуры. Чтобы перевести набранный в транслите текст, нужно нажать кнопку "Транслит". Правила перекодирования перечислены в таблице. Неочевидные соответствия выделены фоном. После перекодировки в конце текста появляется фраза "[Текст переведён с транслита]" (кому она не нравится - может просто делетировать smile.gif ).
кирилицаtranslit кирилицаtranslit
аaрr
бbсs
вv, wтt
гgуu
дdфf
еeхh, kh
ёyo, joцc
жzhчch
зzшsh
иiщc', s'h, c`, s`h
йjъ'' , ``
кkыy
лlь' , `
мmэq, e', e`
et->эт (в начале слова)
нnюyu, ju
оoяya, ja
пpксx
Кроме того, в конце слова:
ей
ой
ий
ey
oy
iy
 я
ый
ia
yy

Самые неочевидные соответствия:
"щ" = c', c` (слегка по-японски); s'h, s`h (модификация более распространённого обозначения "sch");
"э" = q (ничем не занятая английская буква); e', e` (е-мягкая); et->эт (в начале слова - большое спасибо a11 (msp@pochtamt.ru)).
Для того, чтобы перекодировщик выдал заглавные буквы, нужно писать заглавными английскими буквами. Для букв, которым соответствует сочетание из двух английских, достаточно чтобы заглавной была первая.
Если нужно написать английские слова в сообщении, есть два способа: во-первых, текст, заключенный с двух сторон в диезы (символ #), не будет перекодироваться (например Chelovek #chelovek# CHelovek будет транслирован в Человек chelovek Человек). Другой способ - написать русскую часть текста, нажать "Транслит", а затем дописать английский текст.


раздел новостей: Конференции Курсы по двугибридной системе
06.05.2002 09:43  Anonymous / Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
user posted image
Приглашаем всех заинтересованных принять участие в организуемых Европейской Федерацией Биохимических Обществ курсах по дрожжевой двухгибридной системе в Москве, 28 октября - 2 ноября 2002г.
Официальная цель подобных курсов в Восточной Европе - передача технологии. По окончании занятий участник курсов сможет приступить к работе, понимая, что и зачем он делает.
Все участники получат базовый набор (плазмиды, штаммы, протоколы) для проведения работ с одной из самых новых версий двухгибридной системы - Dual Bait. Кроме этого, рассматривается вариант закупки за счёт курсов и двухгибридной библиотеки. Это будет сделано, если наберётся достаточное количество заинтересованых лиц для организации внеклассных работ по трансформации этих библиотек в дрожжи. Тогда каждый участниксможет получить и аликвоту претрансформированной двухгибридной библиотеки.
Более подробная информация имеется на web-странице курсов.
От оргкомитета
Георгий Шпаковский
gvs@mail.ibch.ru


раздел новостей: Информация Пмб срочно нужна помощь!
22.04.2002 09:38  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Коллеги!
Мне и сайту "Практическая Молекулярная Биология" срочно нужна ваша помощь. В колонке новостей упоминалось, что я ушёл из Института Биологии гена, где был руководителем группы. Теперь эта группа называется лабораторией (группа была действительно хорошая!) и возглавляется директором института Георгиевым Георгием Павловичем. Сейчас оказалось, что сайт ПМБ тоже входит в круг интересов ИБГ. Речь о сайте уже заходила в январе, когда я получал трудовую книжку в институте, но я пообещал, что как только что нибудь с сайта появится на сервере института (старый web-адрес сайта был зарегистрирован на ИБГ) я подам в суд иск о нарушении авторских прав. Я думал, что на этом вся история и закончилась, но оказалось, что нет.
Сейчас РФФИ выделил грант "Поддержание и развитие гипертекстовой информационной системы Практическая Молекулярная Биология". Когда я уходил из группы, мы разговаривали с другими участниками гранта о судьбе сайта. Договорились подождать, даст ли РФФИ грант: если нет, то и разговаривать не о чем, если даст - тогда написать письмо в РФФИ с вопросом о том, как можно перевести на меня деньги. Сейчас, однако, директор влез в этот договор со своим собственным подходом (я не думаю, что это идея ребят). Георгия Павлович написал мне, что грант принадлежит институту и сайт будет "поддерживаться институтской командой".

Алексей Солдатов; e-mail: redactor@molbiol.ru;
"Практическая Молекулярная Биология" http://molbiol.ru
;


раздел новостей: Биология Дополнение к "Выделению ДНК из агарозного геля"
22.04.2002 09:25  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Анча Баранова из ИОГЕН РАН прислала протокол очистки центрифугированием ДНК из агарозного геля.


раздел новостей: Биология Амплификация и выделение низкокопийных плазмид
18.04.2002 09:21  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
В разделе "Методы" выложен ещё один протокол, посвящённый выделению плазмид: "Амплификация и выделение низкокопийных плазмид" от Татьяны Веремейко (veremeiko@ngs.ru). Кроме того, она прислала существенное дополнение к протоколу "Электропорация", касающееся приготовления электрокомпетентных клеток без заморозки.


раздел новостей: Конференции Технологии генодиагностики в практическом здравоохранени
18.04.2002 09:20  Anonymous / Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Приглашаем всех заинтересованных принять участие в научно-практическом симпозиуме "Технологии генодиагностики в практическом здравоохранении" (20-21 июня 2002г Москва) в рамках международной конференции "Геномика, протеомика и биоинформатика для медицины".
Еще не поздно прислать материалы для публикации в сборнике трудов! До 25 апреля! Можно по электронной почте: genodiagn2002@lytech.ru.


От оргкомитета симпозиума
Осипова Светлана
lytech.adm@mtu-net.ru


раздел новостей: Конференции Геномика, протеомика и биоинформатика для медицины
18.04.2002 09:17  Anonymous / Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
user posted image
"Геномика, протеомика и биоинформатика для медицины"(22-29 июня 2002 г., Москва)
Конференция будет проводиться на комфортабельном теплоходе, следующем по маршруту Москва - Санкт-Петербург. Участники конференции смогут посетить знаменитые места отечественной истории и познакомиться с природой русского Севера в период "белых ночей".

Основные темы конференции:
1. Геномика.
1.1 Геном человека 1.2 Геномы микроорганизмов и растений
1.3 Геномика для медицинских исследований

2. Протеомика.
2.1 Протеомный индекс человека
2.2 Протеомика микроорганизмов и растений
2.3 Протеомная диагностика заболеваний человека

3. Биоинформатика.
3.1 Анализ геномов: что можно извлечь из генетических текстов
3.2 Структурная геномика: высокопроизводительное 3D-моделирование
3.3 Компьютерное конструирование лекарств

В рамках конференции будут проведены два симпозиума, посвященные применению геномики, протеомики и биоинформатики для анализа:
1. Иммуноглобулинов
2. Цитохромов P450

Организаторы:
· Международный союз по биохимии и молекулярной биологии (IUBMB)
· Международная организация "Протеом человека" (HUPO)
· Министерство промышленности, науки и технологий РФ
· Министерство здравоохранения РФ
· Российская академия медицинских наук
· Российский фонд фундаментальных исследований
· Московский комитет по науке и технологиям
· НИИ Биомедицинской Химии
· НИИ физико-химической медицины МЗ РФ


раздел новостей: Литература Ebrary - чтение с экрана
10.04.2002 09:11  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Кирилл Кашкин (большое ему за это спасибо) прислал очень интересную ссылку на "Ebrary". Компания занимается продажей книг через интеренет. Прелесть в том, что после установки небольшого патча к Internet Explorer читать с экрана можно совершенно бесплатно. Копировать и печатать - за деньги (0.3$ за страницу - так что проще через "PrintScreen"). Книжек довольно много:
Molecular Genetics of Cancer: Second edition
Molecular Genetics of Hypertension
Molecular Genetics of Early Human Development
STRESS: Neural, Endocrine and Molecular Studies
Molecular Endocrinology: Genetic Analysis of Hormones & Their Receptors
Cell and Molecular Biology of Wood Formation
Vascular Protection: Molecular Mechanisms, Novel Therapeutic Principles and Clinical Application
Molecular Mechanisms of Metabolic Arrest: Life in Limbo
и многое другое...


раздел новостей: Биология Окрашивание белковых гелей Кумасси G-250
10.04.2002 09:10  Redactor           к началу страницы  комментарии: 2
Новый протокол "Окрашивание белковых гелей Coomassie brilliant blue G-250" от Инны Кригер (kriginkri@mail.ru). Это модифицированный метод из статьи Reisner A.H., Nemes P., Bucholtz C. 1975. Anal.Biochem. 99:474-476, использующийся в Институте белка РАН. На сколько я помню по собственному опыту чувствительность чуть ниже, чем при использовании кумасси R-250, но метод (i) очень быстр; (ii) гель именно "проявляется", то есть читать можно в процессе окрашивания, а не отмывки.


раздел новостей: Биология Выделение pDNA с PEG
10.04.2002 09:08  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
В разделе "Методы" появился новый протокол "Выделение pDNA (максипреп - очистка с PEG)". Прислала Анна Малашичева (anna.malashicheva@ens-lyon.fr). Большое ей спасибо!


раздел новостей: Литература Ещё о книгах онлайн
02.04.2002 09:06  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Ещё одна книга онлайн (Н.Бейли, Математика в биологии и медицине Перевод с английского Е.Г. Коваленко. Издательство "МИР" Москва 1970) стала последней каплей. Теперь все ссылки на онлайн издания вынесены на отдельную страницу "Книги онлайн".


раздел новостей: Литература Ч. Дарвин онлайн
01.04.2002 09:04  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Прислали ссылочку на сайт с книгами Ч. Дарвина. На русском есть две книги: Происхождение видов и Воспоминания о развитии моего ума и характера (Автобиография). На этом же сайте ссылки на другие произведения Дарвина (на английском). Кто прислал ссылку и кто сделал сайт - не знаю.


раздел новостей: Информация Тем, у кого нет русской клавиатуры
28.03.2002 10:02  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Для тех, у кого не установлена русская клавиатура: на страницах поиска сайта и Форума появились виртуальные клавиатуры (так что теперь доступен поиск по русски).


раздел новостей: Биология Выделения ДНК с Dispase II
27.03.2002 10:00  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Ещё один протокол от Степана Белякина (belyakin@embl-heidelberg.de) в разделе "Методы/Выделение DNA из эукариот": Выделение геномной DNA с Dispase II. Dispase II - дешёвая альтернатива Proteinase K. Автору - большое спасибо.


раздел новостей: Биология Расчёт параметров PCR
26.03.2002 09:58  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
На сайте появилась новая JavaScript программка "Расчёт параметров PCR". Она помогает оценить сбалансированность PCR реакции (по нуклеотидам и праймерам) и необходимое число циклов. Рассчитывается общее количество и концентрация полученного продукта. Оценивается, с какого цикла амплификация перестаёт быть экспоненциальной. Программа сама выбирает наиболее удобные единицы измерения для представления результатов ("µg/µl", "ng/µl" или "pg/µl"). Можно выбрать единицу измерения самому, программа спорить не станет и пересчитает.


раздел новостей: Биология Выделения ДНК с мочевиной
22.03.2002 09:56  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
В разделе "Методы/Выделение DNA из эукариот" появился новый протокол: 14_06 Выделение геномной ДНК (Holmes-Bonner). Proteinase K не используется. В качестве денатурирующего агента введена мочевина. Прислал Степан Белякин (belyakin@embl-heidelberg.de).


раздел новостей: Литература Вопрос по поводу книг онлайн
21.03.2002 09:38  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Может быть кто-то поможет разъяснить вопрос, который возник при обсуждении "Молекулярной биологии клетки онлайн".
Я так думаю, что в наше время любая книга перед изданием появляется в электронной форме. Если бы авторы/переводчики/редакторы только бы захотели, интернет был бы просто завален книгами. Я так понимаю, что они не слишком "за".
Но, с другой стороны. Вот передо мной книга:
################################
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
Лев Иванович Патрушев
более 500 страниц.
тираж 660 экземпляров.
Подписано к печати 15.05.2000
################################
Такой тираж - насмешка над автором большой книги. Ну не может это издание удовлетворить авторскую гордость собственным трудом. А если с книгой ничего не делать, то года через три-четыре она устареет и умрёт.
И похожая ситуация с другими книгами. Кто знает, что мешает публиковать книги в интернет хотя бы через год после выхода? Я этот вопрос вынес на форум.


раздел новостей: Информация Ещё немного о Full text
13.03.2002 03:29  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Небольшое дополнение к предыдущему сообщению. Забыл упомянуть о ещё одном типе ошибок. Нередко случается, что заказывается статья, не существующая в полнотекстовом варианте в электронном виде. Ссылка правильно ведёт к абстракту статьи на сайте журнала, а вот дальше идти некуда, так как кроме абстракта ничего больше на сайте и нет. Получается, что добрый человек приходит по ссылке, теряет время пытаясь найти полный текст, разбирается, что его нет в природе и, наконец, прекращает эту глупую работу в прекрасном настроении.
Если на странице абстракта на сайте журнала нет никаких ссылок на "full text" версию, то такой версии просто не существует.
Редко какой журнал имеет электронные версии статей старше 1995 года.
В архиве (Archive) журнала обычно указано, статьи каких лет доступны в электронном виде (Full Text and Abstracts), а каких - нет (Abstracts Only). Например, archive of all online issues журнала Genes & Development.
Кстати, за последнюю неделю запросы существенно улучшились. Похоже, что инструкция раньше была кривоватая.


раздел новостей: Информация Full text - это не просто
07.03.2002 01:26  Redactor           к началу страницы  комментарии: 0
Ещё в студенческие годы работал я в пионерском лагере вожатым. Когда пионеры брали спортивный инвентарь они должны были записываться на листочке на стене (чтобы можно было найти крайнего). Так вот, бадминтон служил источником неиссякаемой новизны. Все варианты уже и не припомнишь: "бодментон", "баминтон", "баб ментон" и т.д.
К чему это... Раздел "Full Text" просто поражает разнообразием вариантов составления запросов. Самое удивительное, что на эти запросы статьи приходят. Воистину, великодушию коллег за границей предела нет. Честь им и слава!
Однако любому терпению может придти конец. Тот, кто напрягает добрых людей неграмотными запросами, создаёт проблемы коллегам в России, так как добрые люди устанут и перестанут обращать внимание на чужие проблемы. Пожалуйста, прочитайте о том, как надо и как не надо пользоваться "Full Text" (на сайте имеются и более подробные правила).
PS. Когда я готовил этот текст, то с удивлением обнаружил, что большинство запросов оформлено более или менее правильно. Потом сообразил, что на глаза попадаются в основном хронически безответные запросы и именно они создают общее настроение. Видимо, кривые запросы раздражают и добрых коллег. Не обижайтесь, для тех, кому лень написать корректную просьбу о помощи, я буду закрывать доступ к форуму.
Как надо:
http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/295/5559/1487
Whitchurch CB, Tolker-Nielsen T, Ragas PC, Mattick JS. Extracellular DNA required for bacterial biofilm formation.
Science. 2002 Feb 22;295(5559):1487.

Мой e-mail адрес: colt@hotmail.ru
Спасибо!!!
Ссылка ведёт на сайт журнала непосредственно к тексту статьи в запретную для автора зону. Название статьи указано под ссылкой, так что коллега не будет сомневаться, правильную ли статью он отсылает. E-mail указан в тексте письма. Заранее сказано "Спасибо" (я сам, пожалуй, чуть более цветисто поблагодарил бы). Если ещё после присылки статьи будет отослано обратное письмо с личной благодарностью, то вообще чудно.
Как не надо: идея раздела совсем не в том, чтобы зарубежный коллега поработал вашим секретарём и поискал статью в интернете (ему и так есть чем заняться), а в том, чтобы он поделился своим правом доступа к информации.

Разбор полётов:
1) Nucleotide sequence and strand displacement amplification of the 70K protein gene from mycobacteria.
Little MC, Spears PA, Shank DD.
Mol Cell Probes 1994 Oct;8(5):375-84
Мой e-mail адрес: fomic@yandex.ru
Совсем плохо. Ни поздороваться, ни поблагодарить. Текст, как программа для машины. Ссылка текстовая. Получается, что <u>человек должен: (i) сходить в Citation Matcher, (ii) найти сайт журнала, (iii) отыскать на этом сайте статью</u>, и, наконец, (iv) добраться до pdf файла и его отослать. На самом деле, всё, что подчёркнуто, может (и должен) сделать автор запроса, и ссылка должна быть на сайт журнала с абстрактом (как можно ближе к pdf файлу).

2) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd= Retrieve&db=PubMed&list_uids=11826286&dopt=Abstract
не отказывайте, please!
Мой e-mail адрес: ???@?????
Не многим лучше, чем в предыдущем случае. Ссылка есть, но она ведёт в PubMed. То есть, <u>человек должен найти сайт журнала, отыскать на этом сайте статью</u>, добраться до pdf файла и его отослать. E-mail нужно искать в личных данных автора - совершенно лишний напряг.

3) Antisense Nucleic Acid Drug Dev 1999 Dec;9(6):507-13
Antisense oligodeoxynucleotide of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene inhibits cell proliferation and induces apoptosis in human cervical carcinoma cell lines.
Kim JW, Kim TE, Kim YK, Kim YW, Kim SJ, Lee JM, Kim IK, Namkoong SE.
Прошу прощения, но ссылку на pdf 1999 года не нашел
Но надеюсь на помощь.
Мой e-mail адрес: kmr@yandex.ru
Тоже нехорошо. "Full Text" только для просьб о доступе к журналу. Тот, кто собирается помочь, рассчитывает увидеть ссылку и больше ничего. Если нужна помощь в поиске адреса журнала, обращайтесь, пожалуйста, на форум.
4) Очень частая проблема: ссылка есть и она ведёт куда надо, но вписана она неправильно, так что щёлкать не по чему. Ниже приведено несколько образцов правильного написания одной и той же ссылки. Синим выделена та часть, которая определяет адрес:

[URL=http://link.springer.de/link/service/journals/00294/bibs/8033005/80330340.htm]
httр://link.springer.de/link/service/journals/00294/bibs/8033005/80330340.htm[/URL]

[URL=http://link.springer.de/link/service/journals/00294/bibs/8033005/80330340.htm]Mapping of promoters for the nucleus-encoded plastid RNA polymerase (NEP) in the iojap maize mutant [/URL]

[URL=http://link.springer.de/link/service/journals/00294/bibs/8033005/80330340.htm]Это ссылка на абстракт статьи[/URL]

[URL=http://link.springer.de/link/service/journals/00294/bibs/8033005/80330340.htm]
---Абстракт---[/URL]

В тексте запроса эти варианты будут выглядеть, соответственно:

http://link.springer.de/link/service/journ...05/80330340.htm

Mapping of promoters for the nucleus-encoded plastid RNA polymerase (NEP) in the iojap maize mutant

Это ссылка на абстракт статьи

---Абстракт---

Во-первых, всё совсем несложно, во-вторых, если запрос написан с ошибкой, его можно исправить. Для редактирования надо нажать на картинку user posted image . Не ленитесь, проверьте после отправки, что у вас получилось и поправьте, если требуется.

страницы (198): « < 190 191 192 193 194 195 196 > » 
 
Колонка новостей, спонсор — "Диаэм"
компания 'Диаэм' — cпонсор колонки новостей
поиск по каталогу Диаэм
 

  






Каталоги


Объявления





···
···

molbiol.ru для



···
 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  · Doctor Plastic: увеличение груди - в центре Москвы  · 
···






···
 ·  отличный выбор ванны чугунные с доставкой  ·  подмосковн­­ое уполномоче­­нное туристичес­­кое агентство Coral Travel · 
···

 
 
molbiol.ru  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама

molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов     Rambler